87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000689 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000689  outer membrane protein OmpV  100 
 
 		 258 aa  525  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.419049  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0936  outer membrane protein OmpV  57.36 
 
 		 257 aa  297  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0240452  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2564  MltA-interacting MipA family protein  45.35 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0561  MltA-interacting MipA  47.88 
 
 		 257 aa  231  9e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.711283  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0847  MltA-interacting MipA family protein  45.56 
 
 		 257 aa  227  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0974591  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3687  MltA-interacting MipA family protein  44.4 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645543  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3498  MltA-interacting MipA family protein  44.4 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.605906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0752  MltA-interacting MipA family protein  44.4 
 
 		 257 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0638189  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3975  MltA-interacting MipA family protein  46.33 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.859945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3566  MltA-interacting MipA family protein  44.02 
 
 		 257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119628  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3058  MltA-interacting MipA family protein  45.56 
 
 		 257 aa  218  6e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3166  MltA-interacting MipA family protein  33.74 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0454156  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2376  MltA-interacting MipA  29.74 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.487283  normal  0.1296 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2586  scaffolding protein for murein-synthesizing holoenzyme putative outermembrane protein  29.41 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3708  MltA-interacting MipA family protein  29.08 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03124  hypothetical protein  27.14 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  26.86 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  24.34 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2644  MltA-interacting protein  29.44 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158606  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0880  MltA-interacting MipA family protein  22.68 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0870258  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  24.91 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1032  MltA-interacting MipA family protein  22.09 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000317103  normal  0.951238 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2506  MltA-interacting protein MipA  23.17 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0237592  normal  0.810887 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1099  hypothetical protein  24.18 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01739  hypothetical protein  22.78 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2006  MltA-interacting protein MipA  22.78 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01751  scaffolding protein for murein synthesizing machinery  22.78 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.910835  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1867  MltA-interacting protein MipA  22.78 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00884269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2030  MltA-interacting protein MipA  22.78 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1860  MltA-interacting MipA family protein  22.78 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000393444  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1850  MltA-interacting MipA family protein  22.78 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.112768  hitchhiker  0.0014018 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1409  MltA-interacting protein MipA  22.78 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.543769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  23.45 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2733  outer membrane protein  29.49 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0288  hypothetical protein  23.36 
 
 		 285 aa  53.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.028889  hitchhiker  0.00000185576 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2639  MltA-interacting MipA family protein  27.04 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1724  hypothetical protein  28.07 
 
 		 267 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0983  MltA-interacting MipA family protein  24.66 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3404  MltA-interacting MipA  30.2 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0808  MltA-interacting MipA family protein  24.41 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.121594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3438  MltA-interacting MipA family protein  27.86 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4081  MltA-interacting MipA family protein  27.86 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  27.54 
 
 		 491 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2353  hypothetical protein  20.23 
 
 		 273 aa  50.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000266286  normal  0.096147 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3910  MltA-interacting protein MipA  21.84 
 
 		 246 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709992 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4081  MltA-interacting protein MipA  21.46 
 
 		 246 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0587  MltA-interacting MipA family protein  27.9 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222677  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1990  MltA-interacting protein  20.23 
 
 		 256 aa  49.7  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000189285  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1684  MltA-interacting MipA family protein  26.45 
 
 		 263 aa  49.7  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2098  MltA-interacting MipA family protein  20.23 
 
 		 256 aa  49.7  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0129  MltA-interacting MipA family protein  21.46 
 
 		 246 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.862546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4953  MltA-interacting protein MipA  21.46 
 
 		 246 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1397  MltA-interacting protein  22.39 
 
 		 274 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401837 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1413  MltA-interacting protein  22.39 
 
 		 248 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  normal  0.558802 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1380  MltA-interacting protein  22.39 
 
 		 274 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1889  MltA-interacting protein  22.39 
 
 		 248 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2070  MltA-interacting protein  22.39 
 
 		 248 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515947 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3788  MltA-interacting protein MipA  21.46 
 
 		 246 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0125  MltA-interacting MipA family protein  21.46 
 
 		 246 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0145  MltA-interacting MipA family protein  20.22 
 
 		 246 aa  48.9  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.531464 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03439  hypothetical protein  21.46 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1157  MltA-interacting MipA family protein  27.59 
 
 		 167 aa  48.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481888 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03390  hypothetical protein  21.46 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0152  hypothetical protein  27.45 
 
 		 307 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0634  outer membrane protein V-like protein  30.59 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0898  MltA-interacting MipA family protein  22.6 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436193  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0542  MltA-interacting MipA family protein  26.67 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00487253  normal  0.261768 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2218  MltA-interacting MipA family protein  24.19 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1392  MltA-interacting MipA family protein  21.13 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0476  MltA-interacting MipA family protein  27.44 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3031  MltA-interacting MipA family protein  24.64 
 
 		 286 aa  46.2  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317395  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2730  MltA-interacting MipA family protein  23.61 
 
 		 254 aa  46.2  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  hitchhiker  0.000331014 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3701  MltA-interacting MipA family protein  26.98 
 
 		 250 aa  45.8  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2094  MltA-interacting MipA  24.58 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  23.38 
 
 		 497 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3569  MltA-interacting MipA  26.09 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000215128  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  27.35 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0821  MltA-interacting MipA family protein  26.29 
 
 		 280 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000215759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3202  MltA-interacting MipA family protein  26.29 
 
 		 280 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118328  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2798  putative outer membrane protein  25.26 
 
 		 294 aa  43.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0453163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0478  MltA-interacting MipA family protein  25.44 
 
 		 272 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2040  MltA-interacting MipA family protein  26.67 
 
 		 256 aa  42.7  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3466  MltA-interacting MipA family protein  23.91 
 
 		 244 aa  42.7  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2450  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase HemN  24.89 
 
 		 253 aa  42.7  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.846103  normal  0.839506 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 327 aa  42.7  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000364413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3305  MltA-interacting MipA family protein  26.76 
 
 		 280 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0180467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3115  MltA-interacting MipA  32.22 
 
 		 288 aa  42  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>