73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3202 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3202  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 		 280 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118328  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0821  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 		 280 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000215759 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3305  MltA-interacting MipA family protein  90.71 
 
 		 280 aa  524  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0180467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0806  MltA-interacting MipA family protein  61.45 
 
 		 281 aa  345  5e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0634  outer membrane protein V-like protein  54.15 
 
 		 278 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0983  MltA-interacting MipA family protein  28.42 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1012  MltA-interacting MipA family protein  30.65 
 
 		 288 aa  115  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00934718  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1004  MltA-interacting MipA family protein  28.9 
 
 		 268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000191613  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3182  MltA-interacting MipA family protein  30.25 
 
 		 304 aa  112  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0446172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3004  MltA-interacting MipA family protein  29.89 
 
 		 287 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000564668  normal  0.120239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3085  MltA-interacting MipA family protein  29.89 
 
 		 287 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00416947  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0898  MltA-interacting MipA family protein  30 
 
 		 311 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436193  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3285  MltA-interacting MipA family protein  28.9 
 
 		 287 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.011274  normal  0.15127 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3592  hypothetical protein  30 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1106  MltA-interacting MipA family protein  29.06 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.374888  normal  0.0229825 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1073  MltA-interacting MipA family protein  29.06 
 
 		 287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0880  MltA-interacting MipA family protein  29.5 
 
 		 291 aa  109  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0870258  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1032  MltA-interacting MipA family protein  28.2 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000317103  normal  0.951238 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2697  hypothetical protein  29.25 
 
 		 281 aa  105  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.371809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2798  putative outer membrane protein  27.94 
 
 		 294 aa  103  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0453163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0152  hypothetical protein  27.05 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3569  MltA-interacting MipA  23.76 
 
 		 292 aa  86.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000215128  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.92 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000364413  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2644  MltA-interacting protein  29.5 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158606  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2376  MltA-interacting MipA  29.14 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.487283  normal  0.1296 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0561  MltA-interacting MipA  28.97 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.711283  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1392  MltA-interacting MipA family protein  22.94 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0808  MltA-interacting MipA family protein  23.23 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.121594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3058  MltA-interacting MipA family protein  25.69 
 
 		 257 aa  53.1  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03124  hypothetical protein  24.77 
 
 		 255 aa  52.4  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  26.24 
 
 		 497 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4081  MltA-interacting protein MipA  22.99 
 
 		 246 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03390  hypothetical protein  22.99 
 
 		 246 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03439  hypothetical protein  22.99 
 
 		 246 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0129  MltA-interacting MipA family protein  22.99 
 
 		 246 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.862546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4953  MltA-interacting protein MipA  22.99 
 
 		 246 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3788  MltA-interacting protein MipA  22.99 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0125  MltA-interacting MipA family protein  22.99 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3910  MltA-interacting protein MipA  22.61 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709992 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0847  MltA-interacting MipA family protein  24.31 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0974591  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3975  MltA-interacting MipA family protein  25.69 
 
 		 257 aa  47  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.859945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2586  scaffolding protein for murein-synthesizing holoenzyme putative outermembrane protein  25 
 
 		 245 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3571  MltA-interacting MipA family protein  31.36 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.068192  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0752  MltA-interacting MipA family protein  24.31 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0638189  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0747  MltA-interacting MipA family protein  31.36 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.594828  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  21.17 
 
 		 491 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3503  MltA-interacting MipA family protein  31.36 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3692  MltA-interacting MipA family protein  31.36 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0252512  normal  0.0159359 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3498  MltA-interacting MipA family protein  23.61 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.605906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3566  MltA-interacting MipA family protein  23.61 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119628  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2353  hypothetical protein  21.84 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000266286  normal  0.096147 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3687  MltA-interacting MipA family protein  23.61 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645543  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2564  MltA-interacting MipA family protein  27.21 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1990  MltA-interacting protein  21.84 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000189285  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2098  MltA-interacting MipA family protein  21.84 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0842  MltA-interacting MipA family protein  31.36 
 
 		 281 aa  43.5  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00913257  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1380  MltA-interacting protein  21.88 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.215527 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1860  MltA-interacting MipA family protein  21.66 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000393444  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01739  hypothetical protein  21.66 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0288  hypothetical protein  26.35 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.028889  hitchhiker  0.00000185576 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2070  MltA-interacting protein  21.88 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515947 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1889  MltA-interacting protein  21.88 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01751  scaffolding protein for murein synthesizing machinery  21.66 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.910835  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1413  MltA-interacting protein  21.88 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  normal  0.558802 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1397  MltA-interacting protein  21.88 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401837 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2030  MltA-interacting protein MipA  21.66 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1867  MltA-interacting protein MipA  21.66 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00884269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2006  MltA-interacting protein MipA  21.66 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1409  MltA-interacting protein MipA  21.66 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.543769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1850  MltA-interacting MipA family protein  21.66 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.112768  hitchhiker  0.0014018 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000689  outer membrane protein OmpV  26.29 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.419049  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1099  hypothetical protein  26.09 
 
 		 254 aa  43.1  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  20.85 
 
 		 248 aa  42.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>