40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_2040 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_2040  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 		 256 aa  525  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1157  MltA-interacting MipA family protein  73.33 
 
 		 167 aa  269  4e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481888 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1156  MltA-interacting MipA family protein  57.83 
 
 		 93 aa  100  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428917 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1656  putative outer membrane protein/scaffolding protein MipA  28.57 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0234795  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1891  MltA-interacting MipA  27.47 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0905177 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0145  MltA-interacting MipA family protein  30.65 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1392  MltA-interacting MipA family protein  24.11 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1976  MltA-interacting MipA family protein  29.82 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3701  MltA-interacting MipA family protein  25.48 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1090  MltA-interacting MipA family protein  24.39 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1684  MltA-interacting MipA family protein  25.9 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2733  outer membrane protein  26.44 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  23.55 
 
 		 497 aa  50.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3438  MltA-interacting MipA family protein  25.12 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4081  MltA-interacting MipA family protein  25.12 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1397  MltA-interacting protein  28.21 
 
 		 274 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401837 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1380  MltA-interacting protein  28.21 
 
 		 274 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1889  MltA-interacting protein  28.21 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1413  MltA-interacting protein  28.21 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  normal  0.558802 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2070  MltA-interacting protein  28.21 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515947 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03390  hypothetical protein  24.32 
 
 		 246 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03439  hypothetical protein  24.32 
 
 		 246 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1724  hypothetical protein  23.3 
 
 		 267 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3569  MltA-interacting MipA  23.11 
 
 		 292 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000215128  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  27.37 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  27.91 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4953  MltA-interacting protein MipA  23.65 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0125  MltA-interacting MipA family protein  23.65 
 
 		 246 aa  43.5  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0129  MltA-interacting MipA family protein  23.65 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.862546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0983  MltA-interacting MipA family protein  26.43 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4081  MltA-interacting protein MipA  23.65 
 
 		 246 aa  43.5  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3788  MltA-interacting protein MipA  23.65 
 
 		 246 aa  43.5  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3910  MltA-interacting protein MipA  23.65 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709992 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000689  outer membrane protein OmpV  26.67 
 
 		 258 aa  42.7  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.419049  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2098  MltA-interacting MipA family protein  26.17 
 
 		 256 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2353  hypothetical protein  26.17 
 
 		 273 aa  42.7  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000266286  normal  0.096147 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1990  MltA-interacting protein  26.17 
 
 		 256 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000189285  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0880  MltA-interacting MipA family protein  24.22 
 
 		 291 aa  42.4  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0870258  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2730  MltA-interacting MipA family protein  25.44 
 
 		 254 aa  42.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  hitchhiker  0.000331014 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  23 
 
 		 491 aa  42  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>