69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0548 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 327 aa  673    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000364413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0880  MltA-interacting MipA family protein  33.01 
 
 		 291 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0870258  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0983  MltA-interacting MipA family protein  31.72 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0898  MltA-interacting MipA family protein  33.87 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436193  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1032  MltA-interacting MipA family protein  32 
 
 		 292 aa  165  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000317103  normal  0.951238 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3592  hypothetical protein  30.2 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3182  MltA-interacting MipA family protein  28.86 
 
 		 304 aa  146  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0446172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1106  MltA-interacting MipA family protein  28.1 
 
 		 304 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.374888  normal  0.0229825 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3285  MltA-interacting MipA family protein  27.87 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.011274  normal  0.15127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1073  MltA-interacting MipA family protein  27.87 
 
 		 287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3004  MltA-interacting MipA family protein  28.52 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000564668  normal  0.120239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3085  MltA-interacting MipA family protein  28.72 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00416947  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1012  MltA-interacting MipA family protein  27.54 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00934718  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1004  MltA-interacting MipA family protein  27.54 
 
 		 268 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000191613  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2798  putative outer membrane protein  29.61 
 
 		 294 aa  133  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0453163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3569  MltA-interacting MipA  26.27 
 
 		 292 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000215128  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0634  outer membrane protein V-like protein  26.67 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2697  hypothetical protein  24.92 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.371809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0152  hypothetical protein  24.47 
 
 		 307 aa  90.5  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0806  MltA-interacting MipA family protein  23.69 
 
 		 281 aa  87  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3305  MltA-interacting MipA family protein  26.2 
 
 		 280 aa  86.3  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0180467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3202  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 		 280 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118328  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0821  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 		 280 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000215759 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0808  MltA-interacting MipA family protein  29.27 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.121594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  26.57 
 
 		 497 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1392  MltA-interacting MipA family protein  27.15 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2730  MltA-interacting MipA family protein  25.33 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  hitchhiker  0.000331014 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1684  MltA-interacting MipA family protein  28.29 
 
 		 263 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2353  hypothetical protein  26.14 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000266286  normal  0.096147 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2098  MltA-interacting MipA family protein  26.14 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1990  MltA-interacting protein  26.14 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000189285  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2376  MltA-interacting MipA  21.75 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.487283  normal  0.1296 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3910  MltA-interacting protein MipA  26.97 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709992 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0125  MltA-interacting MipA family protein  26.32 
 
 		 246 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0129  MltA-interacting MipA family protein  26.32 
 
 		 246 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.862546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  27.81 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  27.45 
 
 		 249 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4081  MltA-interacting protein MipA  26.32 
 
 		 246 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3788  MltA-interacting protein MipA  26.32 
 
 		 246 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1397  MltA-interacting protein  25.83 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401837 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1413  MltA-interacting protein  25.83 
 
 		 248 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  normal  0.558802 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1380  MltA-interacting protein  25.83 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1889  MltA-interacting protein  25.83 
 
 		 248 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2070  MltA-interacting protein  25.83 
 
 		 248 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515947 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4953  MltA-interacting protein MipA  26.32 
 
 		 246 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03439  hypothetical protein  26.32 
 
 		 246 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03390  hypothetical protein  26.32 
 
 		 246 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2644  MltA-interacting protein  29.91 
 
 		 259 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158606  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  25.83 
 
 		 491 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1656  putative outer membrane protein/scaffolding protein MipA  23.33 
 
 		 270 aa  53.1  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0234795  normal  0.604065 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1860  MltA-interacting MipA family protein  24.5 
 
 		 248 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000393444  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01739  hypothetical protein  24.5 
 
 		 248 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2030  MltA-interacting protein MipA  24.5 
 
 		 248 aa  52.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2006  MltA-interacting protein MipA  24.5 
 
 		 248 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1867  MltA-interacting protein MipA  24.5 
 
 		 248 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00884269  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01751  scaffolding protein for murein synthesizing machinery  24.5 
 
 		 248 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.910835  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2506  MltA-interacting protein MipA  24.5 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0237592  normal  0.810887 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1409  MltA-interacting protein MipA  24.5 
 
 		 248 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.543769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1850  MltA-interacting MipA family protein  24.5 
 
 		 248 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.112768  hitchhiker  0.0014018 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3701  MltA-interacting MipA family protein  24 
 
 		 250 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1891  MltA-interacting MipA  22 
 
 		 270 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0905177 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06020  hypothetical protein  23.95 
 
 		 211 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2218  MltA-interacting MipA family protein  25.17 
 
 		 249 aa  48.9  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  23.84 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0288  hypothetical protein  24.81 
 
 		 285 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.028889  hitchhiker  0.00000185576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3721  phosphate ABC transporter permease  25.44 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4081  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 		 271 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000689  outer membrane protein OmpV  27.03 
 
 		 258 aa  42.7  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.419049  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3438  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 		 271 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>