53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0288 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0288  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  590  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.028889  hitchhiker  0.00000185576 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3980  MltA-interacting MipA family protein  29.03 
 
 		 289 aa  105  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3571  MltA-interacting MipA family protein  29.72 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.068192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3692  MltA-interacting MipA family protein  29.72 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0252512  normal  0.0159359 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3503  MltA-interacting MipA family protein  29.02 
 
 		 279 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0747  MltA-interacting MipA family protein  29.72 
 
 		 281 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.594828  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0842  MltA-interacting MipA family protein  29.48 
 
 		 281 aa  97.8  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00913257  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3064  MltA-interacting MipA family protein  29.1 
 
 		 286 aa  90.5  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0555  MltA-interacting MipA  28.46 
 
 		 286 aa  86.3  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03124  hypothetical protein  26.95 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0683  hypothetical protein  26.53 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0752  MltA-interacting MipA family protein  25.39 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0638189  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3566  MltA-interacting MipA family protein  25.39 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119628  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0936  outer membrane protein OmpV  30.34 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0240452  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3498  MltA-interacting MipA family protein  25.39 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.605906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3687  MltA-interacting MipA family protein  25.39 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645543  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1032  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000317103  normal  0.951238 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000689  outer membrane protein OmpV  23.36 
 
 		 258 aa  53.5  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.419049  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3058  MltA-interacting MipA family protein  23.08 
 
 		 257 aa  53.1  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3569  MltA-interacting MipA  26.19 
 
 		 292 aa  53.1  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000215128  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0847  MltA-interacting MipA family protein  28.38 
 
 		 257 aa  52.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0974591  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3085  MltA-interacting MipA family protein  27.07 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00416947  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3004  MltA-interacting MipA family protein  27.07 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000564668  normal  0.120239 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3592  hypothetical protein  27.07 
 
 		 304 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3701  MltA-interacting MipA family protein  22.16 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3975  MltA-interacting MipA family protein  23.74 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.859945  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1099  hypothetical protein  25.98 
 
 		 254 aa  49.7  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3182  MltA-interacting MipA family protein  26.32 
 
 		 304 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0446172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0880  MltA-interacting MipA family protein  25.93 
 
 		 291 aa  49.7  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0870258  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  28.14 
 
 		 248 aa  49.3  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0983  MltA-interacting MipA family protein  24.29 
 
 		 294 aa  48.9  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3305  MltA-interacting MipA family protein  27.54 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0180467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1392  MltA-interacting MipA family protein  24.86 
 
 		 255 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0561  MltA-interacting MipA  21.58 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.711283  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000364413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2798  putative outer membrane protein  26.62 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0453163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1012  MltA-interacting MipA family protein  24.81 
 
 		 288 aa  47  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00934718  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1423  hypothetical protein  31.58 
 
 		 368 aa  46.2  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3166  MltA-interacting MipA family protein  23.05 
 
 		 257 aa  45.8  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0454156  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2697  hypothetical protein  25.93 
 
 		 281 aa  45.8  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.371809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0152  hypothetical protein  27.06 
 
 		 307 aa  45.8  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1106  MltA-interacting MipA family protein  26.92 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.374888  normal  0.0229825 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1073  MltA-interacting MipA family protein  26.92 
 
 		 287 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2564  MltA-interacting MipA family protein  25.38 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0898  MltA-interacting MipA family protein  20.86 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436193  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3285  MltA-interacting MipA family protein  26.92 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.011274  normal  0.15127 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2586  scaffolding protein for murein-synthesizing holoenzyme putative outermembrane protein  25.88 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3202  MltA-interacting MipA family protein  26.35 
 
 		 280 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118328  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0821  MltA-interacting MipA family protein  26.35 
 
 		 280 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000215759 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2376  MltA-interacting MipA  21.05 
 
 		 259 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.487283  normal  0.1296 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3404  MltA-interacting MipA  23.03 
 
 		 282 aa  42.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0806  MltA-interacting MipA family protein  29.79 
 
 		 281 aa  42.4  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0634  outer membrane protein V-like protein  25.6 
 
 		 278 aa  42.4  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.712948 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>