88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1012 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1012  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 
288 aa  597  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00934718  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3085  MltA-interacting MipA family protein  75.69 
 
 
287 aa  481  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00416947  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3004  MltA-interacting MipA family protein  75.69 
 
 
287 aa  481  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000564668  normal  0.120239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3182  MltA-interacting MipA family protein  76.74 
 
 
304 aa  483  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0446172  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3592  hypothetical protein  76.04 
 
 
304 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1106  MltA-interacting MipA family protein  73.36 
 
 
304 aa  461  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.374888  normal  0.0229825 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1073  MltA-interacting MipA family protein  73.7 
 
 
287 aa  461  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3285  MltA-interacting MipA family protein  73.36 
 
 
287 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.011274  normal  0.15127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1004  MltA-interacting MipA family protein  73.33 
 
 
268 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000191613  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0983  MltA-interacting MipA family protein  52.35 
 
 
294 aa  338  7e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175299  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0898  MltA-interacting MipA family protein  54.24 
 
 
311 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436193  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1032  MltA-interacting MipA family protein  52.4 
 
 
292 aa  330  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000317103  normal  0.951238 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0880  MltA-interacting MipA family protein  52.76 
 
 
291 aa  322  3e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0870258  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2798  putative outer membrane protein  54.98 
 
 
294 aa  310  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0453163  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3569  MltA-interacting MipA  31.12 
 
 
292 aa  159  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000215128  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 
327 aa  139  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000364413  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0821  MltA-interacting MipA family protein  30.65 
 
 
280 aa  116  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000215759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3202  MltA-interacting MipA family protein  30.65 
 
 
280 aa  116  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118328  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3305  MltA-interacting MipA family protein  29.64 
 
 
280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0180467  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0634  outer membrane protein V-like protein  26.64 
 
 
278 aa  100  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  25.44 
 
 
248 aa  91.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1397  MltA-interacting protein  26.48 
 
 
274 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000401837 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1380  MltA-interacting protein  26.48 
 
 
274 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2070  MltA-interacting protein  26.48 
 
 
248 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000515947 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1413  MltA-interacting protein  26.48 
 
 
248 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  normal  0.558802 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1889  MltA-interacting protein  26.48 
 
 
248 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2697  hypothetical protein  24.71 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.371809  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0152  hypothetical protein  23.13 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0806  MltA-interacting MipA family protein  26 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3701  MltA-interacting MipA family protein  31.13 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1976  MltA-interacting MipA family protein  28.57 
 
 
249 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2730  MltA-interacting MipA family protein  26.67 
 
 
254 aa  75.5  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  hitchhiker  0.000331014 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2353  hypothetical protein  25.85 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000266286  normal  0.096147 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1990  MltA-interacting protein  25.85 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000189285  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2098  MltA-interacting MipA family protein  25.85 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000161478  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01751  scaffolding protein for murein synthesizing machinery  24 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.910835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1860  MltA-interacting MipA family protein  24 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000393444  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2506  MltA-interacting protein MipA  24 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0237592  normal  0.810887 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2030  MltA-interacting protein MipA  24 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2006  MltA-interacting protein MipA  24 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1867  MltA-interacting protein MipA  24 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00884269  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01739  hypothetical protein  24 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1409  MltA-interacting protein MipA  24 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.543769  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1850  MltA-interacting MipA family protein  24 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.112768  hitchhiker  0.0014018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  30.41 
 
 
497 aa  72.8  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  32.54 
 
 
491 aa  72.4  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4081  MltA-interacting MipA family protein  27.81 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2218  MltA-interacting MipA family protein  28.57 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3438  MltA-interacting MipA family protein  27.81 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2376  MltA-interacting MipA  24.91 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.487283  normal  0.1296 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2644  MltA-interacting protein  24.43 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158606  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1724  hypothetical protein  29.14 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03390  hypothetical protein  20.55 
 
 
246 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03124  hypothetical protein  24.9 
 
 
255 aa  65.1  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03439  hypothetical protein  20.55 
 
 
246 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4081  MltA-interacting protein MipA  20.55 
 
 
246 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0125  MltA-interacting MipA family protein  20.55 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3788  MltA-interacting protein MipA  20.55 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0129  MltA-interacting MipA family protein  20.55 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.862546  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4953  MltA-interacting protein MipA  20.55 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3910  MltA-interacting protein MipA  20.55 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.709992 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2733  outer membrane protein  27.15 
 
 
272 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244653  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  26.53 
 
 
249 aa  63.2  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  26 
 
 
249 aa  62.4  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2586  scaffolding protein for murein-synthesizing holoenzyme putative outermembrane protein  25.59 
 
 
245 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0145  MltA-interacting MipA family protein  25.34 
 
 
246 aa  55.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2146  putative MltA-interacting protein MipA  23.58 
 
 
250 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0292974  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0478  MltA-interacting MipA family protein  25.52 
 
 
272 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3466  MltA-interacting MipA family protein  20.94 
 
 
244 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1684  MltA-interacting MipA family protein  24.49 
 
 
263 aa  52.8  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0683  hypothetical protein  25.24 
 
 
318 aa  52.4  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3687  MltA-interacting MipA family protein  26.32 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645543  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3498  MltA-interacting MipA family protein  26.32 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.605906  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3404  MltA-interacting MipA  22.17 
 
 
282 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0936  outer membrane protein OmpV  24.36 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0240452  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0752  MltA-interacting MipA family protein  25.66 
 
 
257 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0638189  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3566  MltA-interacting MipA family protein  25.66 
 
 
257 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119628  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3975  MltA-interacting MipA family protein  24.2 
 
 
257 aa  49.3  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.859945  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0847  MltA-interacting MipA family protein  22.58 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0974591  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0288  hypothetical protein  24.81 
 
 
285 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.028889  hitchhiker  0.00000185576 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1392  MltA-interacting MipA family protein  20.21 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212014  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2564  MltA-interacting MipA family protein  20.91 
 
 
270 aa  47.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295331  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3058  MltA-interacting MipA family protein  22.54 
 
 
257 aa  46.2  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2029  MltA-interacting MipA family protein  27.59 
 
 
284 aa  46.2  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221941  normal  0.944146 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1099  hypothetical protein  20.16 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0561  MltA-interacting MipA  23.61 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.711283  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2450  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase HemN  20.44 
 
 
253 aa  43.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.846103  normal  0.839506 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3808  hypothetical protein  21.02 
 
 
460 aa  43.1  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>