50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2697 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2697  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.371809  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0634  outer membrane protein V-like protein  30.99 
 
 
278 aa  123  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0880  MltA-interacting MipA family protein  29.69 
 
 
291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0870258  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3202  MltA-interacting MipA family protein  29.25 
 
 
280 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118328  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0821  MltA-interacting MipA family protein  29.25 
 
 
280 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000215759 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 
327 aa  104  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000364413  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0898  MltA-interacting MipA family protein  28.62 
 
 
311 aa  102  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436193  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1032  MltA-interacting MipA family protein  27.21 
 
 
292 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000317103  normal  0.951238 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0152  hypothetical protein  27.42 
 
 
307 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0806  MltA-interacting MipA family protein  28.4 
 
 
281 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3305  MltA-interacting MipA family protein  27.14 
 
 
280 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0180467  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3085  MltA-interacting MipA family protein  27.18 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00416947  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3004  MltA-interacting MipA family protein  27.18 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000564668  normal  0.120239 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0983  MltA-interacting MipA family protein  26.48 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175299  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1073  MltA-interacting MipA family protein  26.04 
 
 
287 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1106  MltA-interacting MipA family protein  25.35 
 
 
304 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.374888  normal  0.0229825 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3285  MltA-interacting MipA family protein  25.35 
 
 
287 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.011274  normal  0.15127 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3569  MltA-interacting MipA  24.83 
 
 
292 aa  93.6  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000215128  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3182  MltA-interacting MipA family protein  26.17 
 
 
304 aa  93.2  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0446172  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3592  hypothetical protein  25.57 
 
 
304 aa  90.1  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2798  putative outer membrane protein  26.67 
 
 
294 aa  87  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0453163  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2644  MltA-interacting protein  29.92 
 
 
259 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158606  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2376  MltA-interacting MipA  29.77 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.487283  normal  0.1296 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1012  MltA-interacting MipA family protein  24.71 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00934718  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1004  MltA-interacting MipA family protein  24.72 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000191613  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0808  MltA-interacting MipA family protein  22.54 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.121594  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03124  hypothetical protein  25.35 
 
 
255 aa  58.9  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  25.45 
 
 
491 aa  55.8  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1392  MltA-interacting MipA family protein  24.46 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212014  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  23.13 
 
 
249 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  22.81 
 
 
249 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  23.64 
 
 
497 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4081  MltA-interacting protein MipA  24.29 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0129  MltA-interacting MipA family protein  24.29 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.862546  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3910  MltA-interacting protein MipA  24.29 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.709992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4953  MltA-interacting protein MipA  24.29 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3788  MltA-interacting protein MipA  24.29 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0125  MltA-interacting MipA family protein  24.29 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1099  hypothetical protein  24.44 
 
 
254 aa  45.8  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0288  hypothetical protein  25.93 
 
 
285 aa  45.8  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.028889  hitchhiker  0.00000185576 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03439  hypothetical protein  23.89 
 
 
246 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03390  hypothetical protein  23.89 
 
 
246 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1889  MltA-interacting protein  21.86 
 
 
248 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2070  MltA-interacting protein  21.86 
 
 
248 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000515947 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1380  MltA-interacting protein  22.22 
 
 
274 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1413  MltA-interacting protein  21.86 
 
 
248 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  normal  0.558802 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1397  MltA-interacting protein  22.22 
 
 
274 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000401837 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  21.55 
 
 
248 aa  43.5  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2730  MltA-interacting MipA family protein  21.48 
 
 
254 aa  42.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  hitchhiker  0.000331014 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2586  scaffolding protein for murein-synthesizing holoenzyme putative outermembrane protein  22.61 
 
 
245 aa  42.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>