29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0806 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0806  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 		 281 aa  578  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0821  MltA-interacting MipA family protein  61.45 
 
 		 280 aa  345  6e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000215759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3202  MltA-interacting MipA family protein  61.45 
 
 		 280 aa  345  6e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118328  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3305  MltA-interacting MipA family protein  60.69 
 
 		 280 aa  344  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0180467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0634  outer membrane protein V-like protein  52.31 
 
 		 278 aa  297  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0983  MltA-interacting MipA family protein  27.12 
 
 		 294 aa  105  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1032  MltA-interacting MipA family protein  26.83 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000317103  normal  0.951238 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2697  hypothetical protein  28.4 
 
 		 281 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.371809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0898  MltA-interacting MipA family protein  28.47 
 
 		 311 aa  97.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436193  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0880  MltA-interacting MipA family protein  27.46 
 
 		 291 aa  95.5  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0870258  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0152  hypothetical protein  26.62 
 
 		 307 aa  90.1  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.69 
 
 		 327 aa  87  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000364413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1012  MltA-interacting MipA family protein  26 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00934718  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3285  MltA-interacting MipA family protein  24.38 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.011274  normal  0.15127 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1106  MltA-interacting MipA family protein  24.38 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.374888  normal  0.0229825 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1073  MltA-interacting MipA family protein  24.38 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2798  putative outer membrane protein  27.17 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0453163  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3592  hypothetical protein  27.6 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1004  MltA-interacting MipA family protein  25.48 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000191613  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3182  MltA-interacting MipA family protein  25.69 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0446172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3085  MltA-interacting MipA family protein  24.9 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00416947  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3004  MltA-interacting MipA family protein  24.9 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000564668  normal  0.120239 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3569  MltA-interacting MipA  23.26 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000215128  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2644  MltA-interacting protein  25.7 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158606  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2376  MltA-interacting MipA  25.68 
 
 		 259 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.487283  normal  0.1296 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1392  MltA-interacting MipA family protein  21.21 
 
 		 255 aa  47  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0561  MltA-interacting MipA  23.45 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.711283  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  21.62 
 
 		 491 aa  42.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0288  hypothetical protein  29.79 
 
 		 285 aa  42.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.028889  hitchhiker  0.00000185576 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>