42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3571 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3571  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 		 281 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.068192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3692  MltA-interacting MipA family protein  97.86 
 
 		 281 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0252512  normal  0.0159359 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0747  MltA-interacting MipA family protein  98.58 
 
 		 281 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.594828  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3503  MltA-interacting MipA family protein  96.06 
 
 		 279 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0842  MltA-interacting MipA family protein  88.97 
 
 		 281 aa  497  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00913257  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3980  MltA-interacting MipA family protein  74.55 
 
 		 289 aa  428  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3064  MltA-interacting MipA family protein  73.28 
 
 		 286 aa  396  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0555  MltA-interacting MipA  70.23 
 
 		 286 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0288  hypothetical protein  29.72 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.028889  hitchhiker  0.00000185576 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0683  hypothetical protein  26.33 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  32.53 
 
 		 249 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  23.92 
 
 		 497 aa  48.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  32.53 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1032  MltA-interacting MipA family protein  24.32 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000317103  normal  0.951238 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1423  hypothetical protein  28.9 
 
 		 368 aa  47  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1976  MltA-interacting MipA family protein  30.21 
 
 		 249 aa  46.6  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0936  outer membrane protein OmpV  26.74 
 
 		 257 aa  46.2  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0240452  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3305  MltA-interacting MipA family protein  31.36 
 
 		 280 aa  45.8  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0180467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  34.04 
 
 		 491 aa  45.8  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2376  MltA-interacting MipA  24.53 
 
 		 259 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.487283  normal  0.1296 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1850  MltA-interacting MipA family protein  33.33 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.112768  hitchhiker  0.0014018 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01751  scaffolding protein for murein synthesizing machinery  33.33 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.910835  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2218  MltA-interacting MipA family protein  31.25 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01739  hypothetical protein  33.33 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1860  MltA-interacting MipA family protein  33.33 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000393444  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2030  MltA-interacting protein MipA  33.33 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1409  MltA-interacting protein MipA  33.33 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.543769  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3592  hypothetical protein  22.52 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2006  MltA-interacting protein MipA  33.33 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1867  MltA-interacting protein MipA  33.33 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00884269  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0821  MltA-interacting MipA family protein  31.36 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000215759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3202  MltA-interacting MipA family protein  31.36 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118328  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0808  MltA-interacting MipA family protein  27.96 
 
 		 247 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.121594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2564  MltA-interacting MipA family protein  33.33 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1397  MltA-interacting protein  27.59 
 
 		 274 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401837 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1413  MltA-interacting protein  27.59 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  normal  0.558802 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1380  MltA-interacting protein  27.59 
 
 		 274 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1889  MltA-interacting protein  27.59 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2070  MltA-interacting protein  27.59 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515947 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0898  MltA-interacting MipA family protein  24.17 
 
 		 311 aa  42.7  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436193  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3085  MltA-interacting MipA family protein  21.62 
 
 		 287 aa  42.4  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00416947  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3004  MltA-interacting MipA family protein  21.62 
 
 		 287 aa  42  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000564668  normal  0.120239 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>