95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4081 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4081  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 
271 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3438  MltA-interacting MipA family protein  98.52 
 
 
271 aa  540  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2733  outer membrane protein  83.03 
 
 
272 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244653  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1724  hypothetical protein  63.53 
 
 
267 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3404  MltA-interacting MipA  30.95 
 
 
282 aa  125  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03124  hypothetical protein  30.88 
 
 
255 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2586  scaffolding protein for murein-synthesizing holoenzyme putative outermembrane protein  30.64 
 
 
245 aa  90.1  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3701  MltA-interacting MipA family protein  29.6 
 
 
250 aa  85.5  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  30.36 
 
 
491 aa  85.5  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1315  MltA-interacting MipA  27.55 
 
 
261 aa  84  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00759705  normal  0.297084 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3166  MltA-interacting MipA family protein  31.33 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0454156  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1171  MltA-interacting MipA  30.09 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.731654  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  29.6 
 
 
497 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0983  MltA-interacting MipA family protein  29.49 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175299  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0880  MltA-interacting MipA family protein  31.13 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0870258  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1099  hypothetical protein  27.45 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0847  MltA-interacting MipA family protein  31.69 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0974591  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2730  MltA-interacting MipA family protein  27.19 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  hitchhiker  0.000331014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1889  MltA-interacting protein  26.05 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2070  MltA-interacting protein  26.05 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000515947 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  25.53 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1413  MltA-interacting protein  26.05 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  normal  0.558802 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1397  MltA-interacting protein  26.05 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000401837 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1380  MltA-interacting protein  26.05 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1976  MltA-interacting MipA family protein  28.38 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1012  MltA-interacting MipA family protein  27.81 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00934718  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1032  MltA-interacting MipA family protein  31.03 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000317103  normal  0.951238 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3498  MltA-interacting MipA family protein  32.34 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.605906  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3687  MltA-interacting MipA family protein  32.34 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645543  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0898  MltA-interacting MipA family protein  28.4 
 
 
311 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436193  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1684  MltA-interacting MipA family protein  27.95 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0649  MltA-interacting MipA family protein  24.71 
 
 
466 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0235984  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3708  MltA-interacting MipA family protein  26.53 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0561  MltA-interacting MipA  28.97 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.711283  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1656  putative outer membrane protein/scaffolding protein MipA  26.72 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0234795  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1891  MltA-interacting MipA  25.31 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0905177 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0936  outer membrane protein OmpV  29.79 
 
 
257 aa  67  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0240452  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3058  MltA-interacting MipA family protein  27.27 
 
 
257 aa  67  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2098  MltA-interacting MipA family protein  24.48 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1990  MltA-interacting protein  24.48 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000189285  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3975  MltA-interacting MipA family protein  27.92 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.859945  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0752  MltA-interacting MipA family protein  31.14 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0638189  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2353  hypothetical protein  24.48 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000266286  normal  0.096147 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2506  MltA-interacting protein MipA  26.99 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0237592  normal  0.810887 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3566  MltA-interacting MipA family protein  31.14 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119628  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1850  MltA-interacting MipA family protein  26.99 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.112768  hitchhiker  0.0014018 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2030  MltA-interacting protein MipA  26.99 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1409  MltA-interacting protein MipA  26.99 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.543769  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01751  scaffolding protein for murein synthesizing machinery  26.99 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.910835  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1867  MltA-interacting protein MipA  26.99 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00884269  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1860  MltA-interacting MipA family protein  26.99 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000393444  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01739  hypothetical protein  26.99 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2006  MltA-interacting protein MipA  26.99 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2218  MltA-interacting MipA family protein  27.56 
 
 
249 aa  63.5  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3182  MltA-interacting MipA family protein  28.85 
 
 
304 aa  62.4  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0446172  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2564  MltA-interacting MipA family protein  29.41 
 
 
270 aa  62.4  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295331  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3004  MltA-interacting MipA family protein  28.85 
 
 
287 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000564668  normal  0.120239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3085  MltA-interacting MipA family protein  28.85 
 
 
287 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00416947  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3592  hypothetical protein  26.49 
 
 
304 aa  61.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2644  MltA-interacting protein  27.8 
 
 
259 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158606  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1073  MltA-interacting MipA family protein  28.19 
 
 
287 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1106  MltA-interacting MipA family protein  28.19 
 
 
304 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.374888  normal  0.0229825 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3285  MltA-interacting MipA family protein  28.19 
 
 
287 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.011274  normal  0.15127 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0145  MltA-interacting MipA family protein  24.89 
 
 
246 aa  59.3  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2376  MltA-interacting MipA  27.6 
 
 
259 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.487283  normal  0.1296 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1157  MltA-interacting MipA family protein  36.46 
 
 
167 aa  58.5  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0481888 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03390  hypothetical protein  23.77 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03439  hypothetical protein  23.77 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0775  MltA-interacting MipA family protein  23.17 
 
 
454 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0478  MltA-interacting MipA family protein  27.46 
 
 
272 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1090  MltA-interacting MipA family protein  30.3 
 
 
250 aa  57  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3910  MltA-interacting protein MipA  24.22 
 
 
246 aa  57  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.709992 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0410  MltA-interacting MipA family protein  26.5 
 
 
253 aa  57  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0808  MltA-interacting MipA family protein  24.62 
 
 
247 aa  57  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.121594  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4081  MltA-interacting protein MipA  23.77 
 
 
246 aa  57  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0125  MltA-interacting MipA family protein  23.77 
 
 
246 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4953  MltA-interacting protein MipA  23.77 
 
 
246 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3788  MltA-interacting protein MipA  23.77 
 
 
246 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0129  MltA-interacting MipA family protein  23.77 
 
 
246 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.862546  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1004  MltA-interacting MipA family protein  30.17 
 
 
268 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000191613  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3808  hypothetical protein  24.14 
 
 
460 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681212 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  26.64 
 
 
249 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  27.83 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3569  MltA-interacting MipA  25.66 
 
 
292 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000215128  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2450  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase HemN  23.56 
 
 
253 aa  53.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.846103  normal  0.839506 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2798  putative outer membrane protein  29.46 
 
 
294 aa  53.5  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0453163  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2040  MltA-interacting MipA family protein  25.19 
 
 
256 aa  52.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000689  outer membrane protein OmpV  27.86 
 
 
258 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.419049  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2639  MltA-interacting MipA family protein  29.1 
 
 
252 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1392  MltA-interacting MipA family protein  27.63 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212014  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0683  hypothetical protein  23.37 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4756  putative outer membrane protein  26.58 
 
 
308 aa  45.4  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.290345 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0162  MltA-interacting MipA family protein  30.21 
 
 
225 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0152  hypothetical protein  27.54 
 
 
307 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
327 aa  42.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000364413  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>