94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1156 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1156  HAD family hydrolase  100 
 
 
226 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0666674  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0039  HAD family hydrolase  37.11 
 
 
242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1282  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.65 
 
 
242 aa  113  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.8 
 
 
248 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4795  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.52 
 
 
268 aa  98.6  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  35.24 
 
 
248 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.99 
 
 
248 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2868  HAD family hydrolase  30.17 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  33.91 
 
 
219 aa  77.8  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.09 
 
 
245 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8721  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.95 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.966182  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  30.48 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.28 
 
 
223 aa  71.6  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  30.74 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  29.73 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  30.36 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  29.71 
 
 
233 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  27.57 
 
 
214 aa  64.3  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.46 
 
 
525 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4348  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  33.33 
 
 
253 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0954836  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3262  hypothetical protein  29.33 
 
 
250 aa  59.3  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  23.28 
 
 
233 aa  58.9  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3043  HAD family beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.29 
 
 
260 aa  58.9  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  30.77 
 
 
216 aa  58.5  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6404  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.25 
 
 
254 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.929591 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  28.37 
 
 
209 aa  56.2  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1014  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.83 
 
 
313 aa  55.8  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.13 
 
 
244 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0240  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30 
 
 
268 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.414523 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  25.11 
 
 
234 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  28.27 
 
 
218 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  27.11 
 
 
221 aa  54.3  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4270  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.05 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2886  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.47 
 
 
248 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  27.43 
 
 
1314 aa  52.4  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20560  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  23.75 
 
 
246 aa  52.4  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.497192 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.69 
 
 
213 aa  52  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5751  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.1 
 
 
236 aa  52  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511728  normal  0.030519 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  25.35 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  32.24 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  26.13 
 
 
215 aa  49.3  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  30.52 
 
 
219 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  29.5 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  27.62 
 
 
230 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  24.89 
 
 
232 aa  48.9  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0553  HAD family hydrolase  27.8 
 
 
247 aa  48.9  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0979  putative beta-phosphoglucomutase  30.54 
 
 
221 aa  48.9  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3311  beta-phosphoglucomutase  30.08 
 
 
220 aa  48.5  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0895  HAD family sugar phosphatase  27.03 
 
 
228 aa  48.9  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0344  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.37 
 
 
250 aa  48.5  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118132  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2961  beta-phosphoglucomutase  28.96 
 
 
219 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.423838 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27200  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.8 
 
 
249 aa  48.1  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182706  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  25.11 
 
 
456 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  25.54 
 
 
456 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2717  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.34 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1156  HAD family hydrolase  25.24 
 
 
251 aa  47.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.10504  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1494  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.36 
 
 
240 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.981223  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.29 
 
 
1051 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  25.34 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02150  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.65 
 
 
246 aa  47  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  25.37 
 
 
456 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0530  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.73 
 
 
257 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1473  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.4 
 
 
252 aa  46.2  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.302617  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  29.47 
 
 
219 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1871  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.05 
 
 
227 aa  45.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.54 
 
 
252 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.657489 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  24.79 
 
 
1055 aa  45.8  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.7 
 
 
232 aa  45.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0806  HAD superfamily hydrolase  25.11 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0727233  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.13 
 
 
1051 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  30.21 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0058  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  21.31 
 
 
203 aa  45.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00166064  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3629  HAD family hydrolase  26.13 
 
 
233 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.956312 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  24.68 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.21 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  27.04 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  23.81 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  28.91 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1749  HAD family hydrolase  25.78 
 
 
227 aa  43.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.56 
 
 
248 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121216 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_10396  predicted protein  25.65 
 
 
168 aa  43.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21740  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.7 
 
 
1125 aa  43.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.976778  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0307  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  24.03 
 
 
250 aa  42.4  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  26.87 
 
 
233 aa  42.4  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1531  beta-phosphoglucomutase  29.03 
 
 
214 aa  42  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2025  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.4 
 
 
247 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2117  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  24.51 
 
 
262 aa  42  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2000  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.4 
 
 
247 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0437  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.88 
 
 
244 aa  42  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1432  putative beta-phosphoglucomutase  29.77 
 
 
219 aa  42  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  29.77 
 
 
219 aa  42  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3556  HAD family hydrolase  25 
 
 
262 aa  42  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  29.77 
 
 
219 aa  42  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0524  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.54 
 
 
251 aa  42  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0185005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>