59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3057 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  100 
 
 
455 aa  882    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  41.98 
 
 
431 aa  257  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  45.83 
 
 
406 aa  240  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  45.35 
 
 
443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  45.35 
 
 
443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  45.35 
 
 
443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  45.45 
 
 
369 aa  229  6e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  44.89 
 
 
570 aa  222  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  42.14 
 
 
422 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  42.14 
 
 
422 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  42.14 
 
 
422 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  41.72 
 
 
398 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  41.74 
 
 
438 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  41.74 
 
 
438 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  41.74 
 
 
438 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  41.71 
 
 
417 aa  199  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  38.53 
 
 
428 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  38.53 
 
 
428 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  38.53 
 
 
428 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  35.91 
 
 
425 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  32.17 
 
 
427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  35.56 
 
 
444 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  33.14 
 
 
414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  33.25 
 
 
395 aa  127  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  34.06 
 
 
420 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  36.57 
 
 
421 aa  124  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  37.58 
 
 
402 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  34.29 
 
 
426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  36.48 
 
 
417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  36.48 
 
 
417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  33.52 
 
 
408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  31.32 
 
 
478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  29.02 
 
 
430 aa  110  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  32.9 
 
 
417 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  36.01 
 
 
470 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  33.73 
 
 
412 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  34.77 
 
 
469 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  31.25 
 
 
418 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  31.25 
 
 
418 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  31.25 
 
 
418 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  31.41 
 
 
428 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  32.29 
 
 
494 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  35.81 
 
 
411 aa  103  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  31.01 
 
 
479 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  30.22 
 
 
434 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  32.17 
 
 
477 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  33.65 
 
 
477 aa  97.8  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  33.11 
 
 
408 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  30.17 
 
 
419 aa  93.2  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  31.4 
 
 
410 aa  92  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  28.97 
 
 
437 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  30.79 
 
 
467 aa  90.9  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  35.05 
 
 
378 aa  87  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  31.84 
 
 
420 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  33.54 
 
 
463 aa  84.3  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  30.3 
 
 
455 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  28.93 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  32.39 
 
 
429 aa  63.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  28.95 
 
 
375 aa  46.6  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>