58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3947 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3947  Saccharopine dehydrogenase  100 
 
 
379 aa  760    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  63.76 
 
 
367 aa  477  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  63.49 
 
 
367 aa  474  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1936  saccharopine dehydrogenase  65.54 
 
 
392 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  58.15 
 
 
367 aa  441  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  61 
 
 
373 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1243  saccharopine dehydrogenase  56.21 
 
 
365 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2268  Saccharopine dehydrogenase  56.5 
 
 
365 aa  388  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87049  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1992  putative saccharopine dehydrogenase, NAD-binding  55.96 
 
 
365 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899138  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2308  hypothetical protein  57.06 
 
 
366 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2080  saccharopine dehydrogenase  56.78 
 
 
366 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.599315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2136  saccharopine dehydrogenase  56.5 
 
 
366 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0976  hypothetical protein  56.5 
 
 
366 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175424  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2269  saccharopine dehydrogenase  56.78 
 
 
366 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.044171  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5016  saccharopine dehydrogenase  55.37 
 
 
366 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.288707  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1536  saccharopine dehydrogenase  55.93 
 
 
366 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1645  saccharopine dehydrogenase  55.65 
 
 
366 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.733408 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6355  saccharopine dehydrogenase  55.65 
 
 
366 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1645  saccharopine dehydrogenase  55.65 
 
 
366 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1723  saccharopine dehydrogenase  55.65 
 
 
366 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1737  saccharopine dehydrogenase  55.65 
 
 
366 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0269  saccharopine dehydrogenase  56.46 
 
 
385 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.901872  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3051  TrkA-N:saccharopine dehydrogenase  53.15 
 
 
393 aa  361  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.995368  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2656  saccharopine dehydrogenase  52.96 
 
 
373 aa  360  2e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2810  saccharopine dehydrogenase  55 
 
 
380 aa  358  8e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111095  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2155  saccharopine dehydrogenase  52.59 
 
 
367 aa  352  8.999999999999999e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0566  saccharopine dehydrogenase  51.93 
 
 
385 aa  352  8.999999999999999e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.411174 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1846  Saccharopine dehydrogenase  52.22 
 
 
389 aa  350  2e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3208  saccharopine dehydrogenase  54.2 
 
 
397 aa  345  8e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2037  saccharopine dehydrogenase  51.67 
 
 
389 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4331  saccharopine dehydrogenase  47.62 
 
 
379 aa  342  9e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5587  Saccharopine dehydrogenase  48.75 
 
 
376 aa  330  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1304  hypothetical protein  45.71 
 
 
362 aa  320  3e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1303  hypothetical protein  45.71 
 
 
362 aa  320  3e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1254  hypothetical protein  45.72 
 
 
376 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  0.0375347 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  43.09 
 
 
354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2420  Saccharopine dehydrogenase  37.25 
 
 
354 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0002  Saccharopine dehydrogenase  38.66 
 
 
360 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0292492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0002  Saccharopine dehydrogenase  37.82 
 
 
360 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  hitchhiker  0.0043893 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  31.77 
 
 
385 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  28.8 
 
 
384 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  29.28 
 
 
392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  27.06 
 
 
413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  28.32 
 
 
348 aa  101  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  29.51 
 
 
347 aa  92  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  27.87 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  28.57 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1035  saccharopine dehydrogenase  29.24 
 
 
369 aa  82  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.002622 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  23.08 
 
 
748 aa  56.6  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  23.63 
 
 
398 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0106  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate forming)  25.58 
 
 
380 aa  50.1  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70210  seventh step in lysine biosynthesis pathway  21.39 
 
 
444 aa  48.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  22.77 
 
 
934 aa  47.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5447  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  21.43 
 
 
441 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205449  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05601  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming) (Eurofung)  20.71 
 
 
450 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  27.27 
 
 
384 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  28.85 
 
 
376 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  35.59 
 
 
221 aa  42.7  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>