65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0344 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0344  protein of unknown function DUF88  100 
 
 
504 aa  1027    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.752457  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0028  protein of unknown function DUF88  61.26 
 
 
509 aa  619  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0056  protein of unknown function DUF88  55.91 
 
 
448 aa  542  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1706  hypothetical protein  54.37 
 
 
507 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.936741 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3848  hypothetical protein  51.49 
 
 
461 aa  462  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1187  hypothetical protein  43.17 
 
 
418 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000236385  decreased coverage  0.000174597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4578  protein of unknown function DUF88  36.6 
 
 
527 aa  223  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.975373  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3051  protein of unknown function DUF88  43.43 
 
 
418 aa  212  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10856 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2484  hypothetical protein  42.44 
 
 
439 aa  212  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00113577  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0587  protein of unknown function DUF88  49.11 
 
 
240 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000787089  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3564  hypothetical protein  38.77 
 
 
415 aa  167  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0546  protein of unknown function DUF88  33.33 
 
 
426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  29.63 
 
 
496 aa  91.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  28.47 
 
 
508 aa  91.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  29.2 
 
 
498 aa  90.5  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  29.2 
 
 
498 aa  90.5  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  29.2 
 
 
498 aa  90.5  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  28.52 
 
 
275 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  29.43 
 
 
507 aa  89.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  29.43 
 
 
501 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  28.73 
 
 
381 aa  89  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  30.9 
 
 
421 aa  86.7  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  27.97 
 
 
472 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  30.95 
 
 
477 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  30.95 
 
 
483 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  30.95 
 
 
483 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  30.95 
 
 
564 aa  84.3  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  28.41 
 
 
478 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  25 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  28.04 
 
 
480 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  27.44 
 
 
264 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  29.83 
 
 
440 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  28.23 
 
 
253 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  28 
 
 
253 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  27.82 
 
 
253 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1289  protein of unknown function DUF88  32.06 
 
 
474 aa  73.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  hitchhiker  0.00441203 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  26.12 
 
 
249 aa  67  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  24.63 
 
 
260 aa  63.2  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  29.17 
 
 
412 aa  58.2  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  32.77 
 
 
251 aa  56.6  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  23.28 
 
 
787 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  23.6 
 
 
842 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  26.37 
 
 
272 aa  49.7  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0806  protein of unknown function DUF88  25.31 
 
 
246 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806829  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0659  hypothetical protein  27.89 
 
 
262 aa  47  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0052  protein of unknown function DUF88  29.73 
 
 
470 aa  46.6  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315794  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1042  protein of unknown function DUF88  29.73 
 
 
378 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.18689 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  32.26 
 
 
286 aa  46.2  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0048  hypothetical protein  27.97 
 
 
239 aa  45.8  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.665316  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00290  hypothetical protein  27.81 
 
 
249 aa  46.2  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4482  hypothetical protein  28.15 
 
 
267 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3395  hypothetical protein  26.38 
 
 
432 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  26.37 
 
 
268 aa  45.4  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3691  hypothetical protein  27.49 
 
 
272 aa  44.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1404  protein of unknown function DUF88  21.71 
 
 
296 aa  44.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.516072  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3241  hypothetical protein  24.32 
 
 
789 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000142022  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2071  hypothetical protein  25.86 
 
 
247 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000154426  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2044  hypothetical protein  25.64 
 
 
249 aa  44.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0376115  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0105  hypothetical protein  27.19 
 
 
236 aa  44.3  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0857  protein of unknown function DUF88  29.61 
 
 
275 aa  44.3  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  45.45 
 
 
259 aa  43.9  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1655  hypothetical protein  30.69 
 
 
432 aa  44.3  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3082  hypothetical protein  23.72 
 
 
261 aa  43.9  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.407546  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  45.45 
 
 
276 aa  43.9  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2871  hypothetical protein  26.44 
 
 
240 aa  43.5  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.234327 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>