55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3848 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3848  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  936    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0056  protein of unknown function DUF88  56.58 
 
 		 448 aa  497  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0028  protein of unknown function DUF88  49.9 
 
 		 509 aa  476  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0344  protein of unknown function DUF88  51.59 
 
 		 504 aa  473  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.752457  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1706  hypothetical protein  50.2 
 
 		 507 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.936741 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1187  hypothetical protein  34.81 
 
 		 418 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000236385  decreased coverage  0.000174597 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3051  protein of unknown function DUF88  35.47 
 
 		 418 aa  227  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10856 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2484  hypothetical protein  33.26 
 
 		 439 aa  225  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00113577  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3564  hypothetical protein  33.41 
 
 		 415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4578  protein of unknown function DUF88  43.48 
 
 		 527 aa  190  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.975373  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0587  protein of unknown function DUF88  44.22 
 
 		 240 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000787089  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1289  protein of unknown function DUF88  47.85 
 
 		 474 aa  160  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  hitchhiker  0.00441203 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0546  protein of unknown function DUF88  29.44 
 
 		 426 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  32.57 
 
 		 421 aa  90.5  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  32.43 
 
 		 564 aa  89  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  32.32 
 
 		 477 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  32.32 
 
 		 483 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  32.32 
 
 		 483 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  31.1 
 
 		 507 aa  87.4  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  32.32 
 
 		 472 aa  87.4  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  31.1 
 
 		 501 aa  86.7  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  31.1 
 
 		 508 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  27.91 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  30.49 
 
 		 498 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  30.49 
 
 		 498 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  30.49 
 
 		 498 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  30.49 
 
 		 496 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  29.94 
 
 		 381 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  30.9 
 
 		 440 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  29.71 
 
 		 480 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  30.29 
 
 		 478 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  30.06 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  32.14 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  26.79 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  27.23 
 
 		 253 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  26.79 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  29.86 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  30 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  27.48 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  28.47 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  29.67 
 
 		 272 aa  51.2  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0052  protein of unknown function DUF88  27.66 
 
 		 470 aa  50.1  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315794  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  27.48 
 
 		 268 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1042  protein of unknown function DUF88  30.12 
 
 		 378 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.18689 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  23.35 
 
 		 842 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  23.35 
 
 		 787 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  39.24 
 
 		 276 aa  46.6  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3241  hypothetical protein  23.46 
 
 		 789 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000142022  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  46.67 
 
 		 284 aa  44.3  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1655  hypothetical protein  32.18 
 
 		 432 aa  43.9  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00290  hypothetical protein  28.45 
 
 		 249 aa  43.9  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  45.45 
 
 		 259 aa  43.5  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0095  hypothetical protein  30.77 
 
 		 273 aa  43.5  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0117028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3705  protein of unknown function DUF88  22.65 
 
 		 600 aa  43.5  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000821311  hitchhiker  0.0000382798 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15160  conserved hypothetical protein TIGR00288  30.53 
 
 		 371 aa  43.1  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>