52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0546 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0546  protein of unknown function DUF88  100 
 
 		 426 aa  875    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3051  protein of unknown function DUF88  31.81 
 
 		 418 aa  159  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10856 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0056  protein of unknown function DUF88  29.25 
 
 		 448 aa  156  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1187  hypothetical protein  29.75 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000236385  decreased coverage  0.000174597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3564  hypothetical protein  29.49 
 
 		 415 aa  154  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0028  protein of unknown function DUF88  33.87 
 
 		 509 aa  149  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3848  hypothetical protein  29.44 
 
 		 461 aa  146  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0344  protein of unknown function DUF88  33.13 
 
 		 504 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.752457  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1289  protein of unknown function DUF88  44.51 
 
 		 474 aa  145  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  hitchhiker  0.00441203 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2484  hypothetical protein  28.18 
 
 		 439 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00113577  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1706  hypothetical protein  32 
 
 		 507 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.936741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4578  protein of unknown function DUF88  30.95 
 
 		 527 aa  109  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.975373  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0587  protein of unknown function DUF88  34.64 
 
 		 240 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000787089  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  30.89 
 
 		 249 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  38.67 
 
 		 483 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  40.85 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  38.67 
 
 		 483 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  38.67 
 
 		 477 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  40.85 
 
 		 496 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  38.67 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  40.85 
 
 		 507 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  40.85 
 
 		 501 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  40.85 
 
 		 498 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  40.85 
 
 		 498 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  37.33 
 
 		 564 aa  57  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  40.85 
 
 		 498 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  39.44 
 
 		 508 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  36 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  39.76 
 
 		 253 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  39.76 
 
 		 253 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  39.76 
 
 		 253 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  36 
 
 		 275 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  28 
 
 		 308 aa  54.7  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  33.03 
 
 		 264 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  42.19 
 
 		 440 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  36 
 
 		 478 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  36 
 
 		 480 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18070  Protein of unknown function DUF88  27.33 
 
 		 335 aa  51.2  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.304133  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  32.58 
 
 		 260 aa  51.2  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  43.33 
 
 		 251 aa  49.3  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0482  hypothetical protein  31.58 
 
 		 287 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1655  hypothetical protein  27.43 
 
 		 432 aa  46.6  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  33.78 
 
 		 272 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3452  hypothetical protein  27.92 
 
 		 282 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0489  protein of unknown function DUF88  29.29 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  24.86 
 
 		 787 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1042  protein of unknown function DUF88  33.8 
 
 		 378 aa  45.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.18689 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1014  hypothetical protein  28.4 
 
 		 299 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  24.86 
 
 		 842 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  29.73 
 
 		 268 aa  44.3  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0052  protein of unknown function DUF88  33.8 
 
 		 470 aa  44.3  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315794  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1475  hypothetical protein  29.11 
 
 		 229 aa  43.1  0.009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>