90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1187 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1187  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  865    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000236385  decreased coverage  0.000174597 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3051  protein of unknown function DUF88  71.01 
 
 		 418 aa  608  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10856 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2484  hypothetical protein  55.42 
 
 		 439 aa  481  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00113577  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0587  protein of unknown function DUF88  77.97 
 
 		 240 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000787089  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0056  protein of unknown function DUF88  34.93 
 
 		 448 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3848  hypothetical protein  34.81 
 
 		 461 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0344  protein of unknown function DUF88  42.07 
 
 		 504 aa  217  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.752457  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3564  hypothetical protein  33.41 
 
 		 415 aa  208  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0028  protein of unknown function DUF88  39.78 
 
 		 509 aa  202  8e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1706  hypothetical protein  39.71 
 
 		 507 aa  195  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.936741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4578  protein of unknown function DUF88  43.97 
 
 		 527 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.975373  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1289  protein of unknown function DUF88  49.39 
 
 		 474 aa  158  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  hitchhiker  0.00441203 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0546  protein of unknown function DUF88  29.75 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  31.95 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  31.29 
 
 		 483 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  31.29 
 
 		 483 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  29.93 
 
 		 501 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  31.69 
 
 		 477 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  30.67 
 
 		 472 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  29.93 
 
 		 564 aa  75.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  31.29 
 
 		 507 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  30.28 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  29.25 
 
 		 498 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  29.79 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  27.33 
 
 		 508 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  27.33 
 
 		 498 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  27.33 
 
 		 498 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  29.25 
 
 		 496 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  26.17 
 
 		 478 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  29.25 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  28.67 
 
 		 480 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  28 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0048  hypothetical protein  32.34 
 
 		 239 aa  69.7  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.665316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  30.26 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  31.63 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  30.26 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  30.26 
 
 		 253 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  30.26 
 
 		 249 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4745  hypothetical protein  30.72 
 
 		 246 aa  57  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0335  hypothetical protein  30.77 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000159017  normal  0.161063 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0105  hypothetical protein  32.08 
 
 		 236 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  26.38 
 
 		 276 aa  53.5  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2071  hypothetical protein  27.71 
 
 		 247 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000154426  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4482  hypothetical protein  28.76 
 
 		 267 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3395  hypothetical protein  26.83 
 
 		 432 aa  53.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0659  hypothetical protein  26.63 
 
 		 262 aa  52.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3705  protein of unknown function DUF88  22.44 
 
 		 600 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000821311  hitchhiker  0.0000382798 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  24.7 
 
 		 259 aa  51.6  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3452  hypothetical protein  33.78 
 
 		 282 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2026  hypothetical protein  53.33 
 
 		 270 aa  51.2  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4005  hypothetical protein  52.17 
 
 		 263 aa  50.4  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  33.71 
 
 		 251 aa  50.4  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  22.44 
 
 		 787 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  22.44 
 
 		 842 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  33.82 
 
 		 260 aa  49.3  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  26.39 
 
 		 268 aa  49.7  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  26 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1873  hypothetical protein  26.16 
 
 		 252 aa  48.5  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0302  protein of unknown function DUF88  21.71 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0057  hypothetical protein  26.97 
 
 		 246 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.184388 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2044  hypothetical protein  25.97 
 
 		 249 aa  47.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0376115  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  23.66 
 
 		 275 aa  47.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3082  hypothetical protein  25 
 
 		 261 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.407546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1459  hypothetical protein  28.67 
 
 		 248 aa  47  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2871  hypothetical protein  25.93 
 
 		 240 aa  47  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0110  hypothetical protein  28.67 
 
 		 248 aa  47  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.151004 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1180  hypothetical protein  42.86 
 
 		 259 aa  46.2  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3241  hypothetical protein  20.89 
 
 		 789 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000142022  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1655  hypothetical protein  32.08 
 
 		 432 aa  46.6  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0095  hypothetical protein  29.41 
 
 		 273 aa  45.8  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0117028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0650  protein of unknown function DUF88  23.83 
 
 		 234 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3535  hypothetical protein  31.06 
 
 		 264 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.098439  normal  0.0144387 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3232  hypothetical protein  46.67 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0597283  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2410  hypothetical protein  33.85 
 
 		 259 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.727494  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3691  hypothetical protein  44.68 
 
 		 272 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  25.64 
 
 		 272 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0670  protein of unknown function DUF88  23.83 
 
 		 234 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135963  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0489  protein of unknown function DUF88  44.23 
 
 		 287 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  46.67 
 
 		 284 aa  45.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0180  hypothetical protein  44.68 
 
 		 254 aa  44.3  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.124198  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2419  hypothetical protein  44.68 
 
 		 247 aa  43.9  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0857  protein of unknown function DUF88  33.73 
 
 		 275 aa  43.5  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0007  hypothetical protein  23.08 
 
 		 487 aa  43.5  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18070  Protein of unknown function DUF88  30.23 
 
 		 335 aa  43.5  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.304133  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1014  hypothetical protein  23.93 
 
 		 299 aa  43.5  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6293  protein of unknown function DUF88  25.7 
 
 		 262 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7469  protein of unknown function DUF88  46.67 
 
 		 260 aa  43.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0476  hypothetical protein  40.82 
 
 		 265 aa  43.1  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1144  protein of unknown function DUF88  29.81 
 
 		 193 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0052  protein of unknown function DUF88  26.44 
 
 		 470 aa  43.1  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>