More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0048 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0048  SufS subfamily cysteine desulfurase  100 
 
 		 413 aa  845    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1458  SufS subfamily cysteine desulfurase  61.89 
 
 		 413 aa  536  1e-151  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1412  SufS subfamily cysteine desulfurase  61.65 
 
 		 413 aa  531  1e-150  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.69 
 
 		 408 aa  444  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.36 
 
 		 406 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.56 
 
 		 406 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  47.1 
 
 		 408 aa  379  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  47.32 
 
 		 406 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  47.32 
 
 		 406 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  47.32 
 
 		 406 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  47.32 
 
 		 406 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  47.32 
 
 		 406 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  46.83 
 
 		 406 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  46.83 
 
 		 406 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  46.83 
 
 		 406 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  46.83 
 
 		 406 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.83 
 
 		 406 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.61 
 
 		 406 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.93 
 
 		 413 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.93 
 
 		 413 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.47 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  45.63 
 
 		 413 aa  365  1e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  45.78 
 
 		 410 aa  359  4e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.75 
 
 		 410 aa  355  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.66 
 
 		 412 aa  352  1e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.8 
 
 		 414 aa  349  6e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.41 
 
 		 414 aa  347  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.06 
 
 		 414 aa  347  2e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  43.93 
 
 		 410 aa  345  7e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  44.23 
 
 		 420 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  43.34 
 
 		 405 aa  338  9.999999999999999e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  41.95 
 
 		 414 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  43.2 
 
 		 408 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  42.86 
 
 		 421 aa  336  5e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.93 
 
 		 413 aa  336  5e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.72 
 
 		 409 aa  336  5.999999999999999e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.34 
 
 		 406 aa  335  7e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  41.12 
 
 		 406 aa  334  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.63 
 
 		 406 aa  332  6e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40.88 
 
 		 406 aa  332  8e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  41.08 
 
 		 407 aa  332  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.15 
 
 		 443 aa  330  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  42.61 
 
 		 404 aa  330  3e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.24 
 
 		 415 aa  330  3e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  42.44 
 
 		 419 aa  330  3e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.12 
 
 		 421 aa  330  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40.63 
 
 		 406 aa  329  4e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.14 
 
 		 433 aa  330  4e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  42.25 
 
 		 417 aa  329  5.0000000000000004e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.58 
 
 		 408 aa  329  6e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  41.32 
 
 		 407 aa  329  7e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.71 
 
 		 412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.82 
 
 		 412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.73 
 
 		 412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.94 
 
 		 435 aa  326  4.0000000000000003e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.39 
 
 		 451 aa  326  4.0000000000000003e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  42.13 
 
 		 414 aa  326  5e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.34 
 
 		 429 aa  324  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.89 
 
 		 412 aa  324  2e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.05 
 
 		 404 aa  323  4e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.34 
 
 		 406 aa  323  4e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  40 
 
 		 429 aa  322  6e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.48 
 
 		 414 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  41.85 
 
 		 413 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.26 
 
 		 417 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  40.94 
 
 		 424 aa  320  3e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  42.96 
 
 		 395 aa  320  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1637  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.13 
 
 		 407 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.48 
 
 		 414 aa  319  7e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.19 
 
 		 419 aa  319  7e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.42 
 
 		 415 aa  318  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.32 
 
 		 429 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.83 
 
 		 417 aa  317  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  41.08 
 
 		 406 aa  318  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.08 
 
 		 429 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.12 
 
 		 444 aa  316  4e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.12 
 
 		 425 aa  316  5e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5397  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.69 
 
 		 414 aa  316  6e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.95 
 
 		 434 aa  315  7e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.87 
 
 		 417 aa  315  7e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  40.64 
 
 		 403 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.08 
 
 		 429 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  41.28 
 
 		 412 aa  314  1.9999999999999998e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0462  cysteine desulfurase  42.05 
 
 		 407 aa  314  1.9999999999999998e-84  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.49202  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.62 
 
 		 417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.62 
 
 		 417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.83 
 
 		 408 aa  313  2.9999999999999996e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  41.28 
 
 		 405 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  39.26 
 
 		 441 aa  313  2.9999999999999996e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  41.56 
 
 		 414 aa  313  3.9999999999999997e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.98 
 
 		 414 aa  312  5.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.19 
 
 		 418 aa  312  6.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.38 
 
 		 414 aa  312  6.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.59 
 
 		 420 aa  312  7.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40.49 
 
 		 406 aa  312  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  41.12 
 
 		 414 aa  311  1e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  40.88 
 
 		 416 aa  311  1e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40.49 
 
 		 406 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  39.47 
 
 		 414 aa  311  1e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.12 
 
 		 416 aa  311  1e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>