85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2226 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2226  putative integral membrane protein  100 
 
 		 146 aa  278  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3440  protein of unknown function DUF107  59.59 
 
 		 146 aa  154  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3263  hypothetical protein  57.34 
 
 		 143 aa  149  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154765  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4808  protein of unknown function DUF107  62.24 
 
 		 143 aa  141  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8849  protein of unknown function DUF107  59.72 
 
 		 144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1351  hypothetical protein  44.29 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.927831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1155  hypothetical protein  47.14 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21889  normal  0.55377 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2577  hypothetical protein  46.15 
 
 		 153 aa  98.6  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.869725  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  44.29 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3685  protein of unknown function DUF107  41.84 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.384963 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19790  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  41.01 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333903 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18360  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  42.42 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  34.56 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2500  hypothetical protein  44.6 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  37.32 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2413  protein of unknown function DUF107  45.65 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2110  protein of unknown function DUF107  37.86 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2314  protein of unknown function DUF107  43.96 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3019  hypothetical protein  40.27 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2314  protein of unknown function DUF107  40.29 
 
 		 181 aa  77.4  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3127  hypothetical protein  39.72 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3188  hypothetical protein  39.72 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.258766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3138  hypothetical protein  39.72 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1933  protein of unknown function DUF107  37.23 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000898113 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  35.46 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  35.46 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3245  hypothetical protein  38.89 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3420  protein of unknown function DUF107  41.48 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  32.17 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3088  protein of unknown function DUF107  40.71 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.020627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3654  hypothetical protein  37.86 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1428  protein of unknown function DUF107  38.46 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21700  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  49.49 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2052  protein of unknown function DUF107  40.15 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  33.59 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  29.5 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11516  hypothetical protein  35.66 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2090  protein of unknown function DUF107  41.91 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  28.37 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  30.23 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2758  hypothetical protein  42.67 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1178  protein of unknown function DUF107  37.5 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.463854  hitchhiker  0.00363544 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2246  protein of unknown function DUF107  26.76 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353999 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  25.34 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  25.34 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  29.5 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  27.19 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  27.19 
 
 		 142 aa  50.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  28.87 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  27.19 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  27.19 
 
 		 142 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  27.19 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  27.19 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  23.97 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  23.97 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0156  hypothetical protein  28.7 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.867378  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0532  protein of unknown function DUF107  31.21 
 
 		 167 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  29.37 
 
 		 458 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  30.2 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  23.29 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0137  hypothetical protein  27.83 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  27.78 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  27.78 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2767  nodulation efficiency protein NfeD  33.55 
 
 		 464 aa  45.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  27.78 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12030  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  37.23 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0225473  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  32.39 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06173  serine protease  28.47 
 
 		 455 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  31.69 
 
 		 153 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  27.78 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  29.73 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1951  hypothetical protein  23.24 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370736  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1704  nucleolar GTP-binding 1  38.33 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0701  hypothetical protein  31.25 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3217  protein of unknown function DUF107  25.93 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  27.34 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  31.34 
 
 		 144 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  34.04 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  25.9 
 
 		 150 aa  41.2  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1634  hypothetical protein  30.82 
 
 		 459 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0549  inner membrane protein YbbJ  33.93 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1227  protein of unknown function DUF107  24.22 
 
 		 133 aa  40.4  0.007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3721  hypothetical protein  28.46 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1099  hypothetical protein  25 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0946  hypothetical protein  32.17 
 
 		 463 aa  40.4  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0248108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>