More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1630 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1630  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  100 
 
 
712 aa  1418    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8315  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  56.13 
 
 
711 aa  756    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.718859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5592  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  54.26 
 
 
725 aa  695    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854543  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3806  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  52.49 
 
 
749 aa  691    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0618  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  52.07 
 
 
725 aa  655    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7097  glutathione import ATP-binding protein GsiA  57.04 
 
 
718 aa  742    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0918  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.41 
 
 
677 aa  659    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.233334 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0535  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  55.45 
 
 
725 aa  743    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4015  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  52.91 
 
 
756 aa  698    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4532  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  62.35 
 
 
736 aa  890    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124709  normal  0.790856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1953  glutathione import ATP-binding protein GsiA  54.61 
 
 
686 aa  725    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2291  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  53.73 
 
 
706 aa  632  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00302442  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11307  oligopeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter oppD  53.32 
 
 
612 aa  617  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3930  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  53.73 
 
 
611 aa  611  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  49.38 
 
 
629 aa  610  1e-173  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4004  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  53.73 
 
 
611 aa  611  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3945  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  53.73 
 
 
611 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0762521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2259  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  53.9 
 
 
611 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115174  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4432  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  52.87 
 
 
611 aa  601  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.62214  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.74 
 
 
703 aa  595  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.46 
 
 
708 aa  593  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108178  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.62 
 
 
676 aa  591  1e-167  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0890  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.02 
 
 
690 aa  587  1e-166  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.34 
 
 
674 aa  583  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.734122 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3276  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.14 
 
 
688 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168178  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3727  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.9 
 
 
665 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  47.23 
 
 
599 aa  564  1.0000000000000001e-159  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1832  ABC transporter related  50.63 
 
 
606 aa  559  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2293  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.5 
 
 
695 aa  546  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559859  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1668  oligopeptidee ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 
659 aa  543  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1319  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  44.77 
 
 
658 aa  530  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179908  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2331  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.2 
 
 
699 aa  530  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425368  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3738  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.46 
 
 
680 aa  529  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.31873  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.26 
 
 
671 aa  526  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426861  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0218  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.34 
 
 
905 aa  528  1e-148  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0707728  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  46.55 
 
 
601 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  46.74 
 
 
593 aa  511  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0936  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.16 
 
 
615 aa  509  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  44.32 
 
 
612 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  44.57 
 
 
623 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  44.41 
 
 
623 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2406  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.89 
 
 
744 aa  504  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.96 
 
 
617 aa  504  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  44.72 
 
 
623 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  43.7 
 
 
612 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  43.86 
 
 
623 aa  500  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  43.86 
 
 
623 aa  499  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  43.86 
 
 
623 aa  499  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  44.01 
 
 
623 aa  501  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  44.41 
 
 
623 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1411  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.23 
 
 
701 aa  500  1e-140  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  44.17 
 
 
623 aa  501  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1753  ATPase component ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system  47.04 
 
 
628 aa  501  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  43.86 
 
 
623 aa  499  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  43.7 
 
 
612 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  43.66 
 
 
629 aa  499  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.34 
 
 
625 aa  496  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  44.41 
 
 
623 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  46.38 
 
 
619 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.48 
 
 
623 aa  495  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  42.16 
 
 
640 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.04 
 
 
625 aa  495  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  43.71 
 
 
623 aa  495  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  44.31 
 
 
586 aa  492  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.75 
 
 
633 aa  491  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  44.73 
 
 
593 aa  488  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2059  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.27 
 
 
694 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190669  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.94 
 
 
633 aa  488  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4554  ABC transporter related  46.49 
 
 
670 aa  488  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  43.94 
 
 
601 aa  485  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  43.84 
 
 
610 aa  484  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  40.71 
 
 
609 aa  484  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.44 
 
 
626 aa  482  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  44.18 
 
 
611 aa  485  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  42.55 
 
 
611 aa  479  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  41.88 
 
 
624 aa  482  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  43.94 
 
 
640 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  44.39 
 
 
632 aa  480  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  43.97 
 
 
630 aa  480  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  42.23 
 
 
620 aa  480  1e-134  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 
627 aa  476  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0747  hypothetical protein  42.17 
 
 
602 aa  477  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0728  hypothetical protein  42.17 
 
 
603 aa  478  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.93 
 
 
619 aa  478  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  42.7 
 
 
615 aa  476  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  42.77 
 
 
611 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4453  opine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.12 
 
 
610 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1927  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  44.91 
 
 
629 aa  474  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.831202  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  43.71 
 
 
613 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  43.79 
 
 
640 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1843  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  44.56 
 
 
665 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1890  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.56 
 
 
665 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.508621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1824  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.56 
 
 
665 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807702  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.75 
 
 
632 aa  472  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  42.92 
 
 
625 aa  471  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2467  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  39.68 
 
 
695 aa  470  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.380053  normal  0.0115313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.93 
 
 
637 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181718  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  43.78 
 
 
593 aa  466  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  40 
 
 
578 aa  466  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.99 
 
 
633 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.15689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>