137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4429 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4429  ResB family protein  100 
 
 
544 aa  1083    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5010  ResB family protein  52.53 
 
 
567 aa  496  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125994  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2702  putative integral membrane protein  53.91 
 
 
527 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132371  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0271  ResB family protein  52.47 
 
 
538 aa  457  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.888676  normal  0.775261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0574  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  51.7 
 
 
560 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2201  ResB family protein  47.25 
 
 
532 aa  423  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3089  ResB family protein  46.77 
 
 
588 aa  418  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3290  ResB family protein  46.77 
 
 
576 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0446  ResB family protein  46.53 
 
 
605 aa  415  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4472  ResB family protein  46.47 
 
 
550 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4303  ResB family protein  46.47 
 
 
550 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4203  ResB family protein  46.47 
 
 
550 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07220  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  45.3 
 
 
596 aa  410  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189184  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0253  ResB family protein  48.89 
 
 
603 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0503  ResB family protein  46.04 
 
 
532 aa  392  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.808002  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17950  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  47.15 
 
 
565 aa  380  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3252  ResB family protein  43.98 
 
 
558 aa  373  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0625944  normal  0.0386797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0825  ResB family protein  44.71 
 
 
522 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.633442  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2732  ResB family protein  44.76 
 
 
598 aa  364  2e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18726  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0630  ResB family protein  41.79 
 
 
572 aa  358  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153575  hitchhiker  0.00598835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6713  ResB family protein  42.3 
 
 
518 aa  358  1.9999999999999998e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4560  ResB family protein  40.75 
 
 
569 aa  351  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.601047  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6118  ResB family protein  45.84 
 
 
563 aa  350  5e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0678882  normal  0.526462 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0928  ResB family protein  40.72 
 
 
550 aa  344  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0512  ResB-like  44.42 
 
 
704 aa  335  9e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925619  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0523  ResB family protein  41.23 
 
 
532 aa  331  2e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.470693  hitchhiker  0.00443309 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24240  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  42.67 
 
 
578 aa  329  6e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191952  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4096  ResB family protein  41.79 
 
 
545 aa  320  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.798403  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4516  ResB family protein  41.39 
 
 
539 aa  318  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  decreased coverage  0.000842403 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24330  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  37.15 
 
 
565 aa  317  2e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10539  transmembrane protein  41.8 
 
 
529 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000523438  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0691  ResB family protein  37.45 
 
 
540 aa  313  4.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110274  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1038  ResB family protein  42.66 
 
 
567 aa  309  1.0000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.941907  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02960  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  40.28 
 
 
548 aa  306  4.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22658  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0694  ResB-like protein  41.22 
 
 
536 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0707  ResB family protein  41.22 
 
 
536 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0687  ResB family protein  41.22 
 
 
536 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0050  ResB family protein  41.2 
 
 
549 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4571  ResB family protein  43.26 
 
 
558 aa  296  5e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0868  ResB family protein  41.06 
 
 
562 aa  291  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0471387  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8080  ResB family protein  39.29 
 
 
573 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297598  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2631  ResB family protein  38.86 
 
 
532 aa  276  5e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2661  ResB family protein  38.78 
 
 
534 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1119  ResB family protein  23.49 
 
 
457 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00407825  normal  0.622731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0748  ResB-like protein  25.3 
 
 
484 aa  90.9  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3358  ResB family protein  26.26 
 
 
434 aa  89  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181016  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2199  ResB-like  25.49 
 
 
423 aa  86.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15791  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  25.69 
 
 
429 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16391  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  21.69 
 
 
428 aa  82.4  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16621  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  25.18 
 
 
428 aa  80.9  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.371034  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0613  ResB-like family protein  22.18 
 
 
454 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.051368  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  28.07 
 
 
457 aa  77.4  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16501  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  24.1 
 
 
428 aa  76.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0472  putative C-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  27.4 
 
 
426 aa  75.9  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1553  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.81 
 
 
428 aa  75.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0696  ResB family protein  21.17 
 
 
458 aa  74.7  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.129347  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  26.22 
 
 
461 aa  74.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  26.22 
 
 
461 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0186  cytochrome c-type biogenesis protein  25.07 
 
 
670 aa  73.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229857  normal  0.30032 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3146  ResB-like  23.81 
 
 
733 aa  72  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176659  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3283  ResB-like protein  24.27 
 
 
750 aa  71.2  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3842  ResB family protein  22.52 
 
 
453 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000782388  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2169  ResB family protein  30 
 
 
700 aa  70.5  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3454  ResB family protein  21.03 
 
 
452 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000344779  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1104  ResB family protein  23.91 
 
 
457 aa  69.3  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0859447  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0039  ResB family protein  23.85 
 
 
678 aa  68.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0702  ResB family protein  24.67 
 
 
395 aa  67  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2917  ResB family protein  23.66 
 
 
734 aa  67  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105711 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3035  cytochrome c assembly family protein  25 
 
 
719 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2221  ResB family protein  23.46 
 
 
553 aa  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0244398  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5588  ResB family protein  24.63 
 
 
727 aa  66.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.946506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3264  ResB family protein  23.66 
 
 
734 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.201427 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2757  ResB family protein  22.96 
 
 
455 aa  64.3  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2901  ResB-like  22.59 
 
 
452 aa  63.9  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000032859  normal  0.767475 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0990  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  22.03 
 
 
426 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137792  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04711  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  25.18 
 
 
432 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3610  ResB family protein  25.16 
 
 
737 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12153  hitchhiker  0.0000000885403 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3520  ResB family protein  21.66 
 
 
452 aa  62  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428253 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0322  c-type cytochrome biogenesis protein  25.51 
 
 
456 aa  61.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3742  ResB-like family protein  25.08 
 
 
718 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00865077  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3480  ResB-like/cytochrome c biosynthesis protein  22.37 
 
 
738 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3136  cytochrome c assembly family protein  25.08 
 
 
718 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1957  cytochrome c assembly family protein  25.08 
 
 
718 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3713  putative cytochrome C biogenesis protein  25.08 
 
 
725 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3771  putative cytochrome C biogenesis protein  25.08 
 
 
718 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3511  cytochrome c assembly family protein  25.08 
 
 
725 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2806  ResB family protein  25.24 
 
 
741 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.924998  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2726  ResB-like  23.45 
 
 
737 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0381  ResB family protein  23.45 
 
 
737 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0347  cytochrome C biogenesis protein  25.49 
 
 
740 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00552206 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1198  ResB family protein  25.42 
 
 
542 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0360  ResB family protein  23.45 
 
 
737 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1529  resB protein  24.34 
 
 
541 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4997  ResB family protein  24.89 
 
 
459 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2588  ResB family protein  25.35 
 
 
454 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000492342  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3674  ResB family protein  26.52 
 
 
457 aa  58.9  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1529  ResB family protein  25.34 
 
 
694 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.469704  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1490  ResB-like protein required for cytochrome c biosynthesis  23.56 
 
 
451 aa  58.9  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3816  resB protein  23.81 
 
 
541 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000491918 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2852  ResB family protein  25.08 
 
 
701 aa  57.8  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.199509  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>