35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1490 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1490  ResB-like protein required for cytochrome c biosynthesis  100 
 
 
451 aa  911    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2901  ResB-like  22.01 
 
 
452 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000032859  normal  0.767475 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0613  ResB-like family protein  22.09 
 
 
454 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.051368  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3520  ResB family protein  23.5 
 
 
452 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428253 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3454  ResB family protein  22.55 
 
 
452 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000344779  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2757  ResB family protein  22.54 
 
 
455 aa  57.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0748  ResB-like protein  21.84 
 
 
484 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  21.58 
 
 
457 aa  54.3  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3842  ResB family protein  20.74 
 
 
453 aa  54.3  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000782388  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07220  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis  19.76 
 
 
596 aa  53.1  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189184  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3252  ResB family protein  22.39 
 
 
558 aa  50.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0625944  normal  0.0386797 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1491  ResB family protein  24.11 
 
 
535 aa  50.8  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.388611  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0630  ResB family protein  21.3 
 
 
572 aa  50.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153575  hitchhiker  0.00598835 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3358  ResB family protein  20.57 
 
 
434 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181016  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4203  ResB family protein  21.34 
 
 
550 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0702  ResB family protein  23.94 
 
 
395 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4303  ResB family protein  21.34 
 
 
550 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4472  ResB family protein  21.34 
 
 
550 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0395  ResB family protein  21.52 
 
 
511 aa  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2732  ResB family protein  28.41 
 
 
598 aa  47.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18726  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0360  ResB family protein  23.2 
 
 
737 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2588  ResB family protein  22.91 
 
 
454 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000492342  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0253  ResB family protein  23.37 
 
 
603 aa  46.6  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0400  ResB family protein  21.02 
 
 
554 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2169  ResB family protein  22.79 
 
 
700 aa  45.8  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0381  ResB family protein  23.2 
 
 
737 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2726  ResB-like  23.2 
 
 
737 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8080  ResB family protein  20.83 
 
 
573 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297598  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0574  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  29.23 
 
 
560 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0347  cytochrome C biogenesis protein  24.81 
 
 
740 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00552206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4429  ResB family protein  32.14 
 
 
544 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15791  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  18.22 
 
 
429 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18591  putative c-type cytochrome biogenesis protein Ccs1  23.8 
 
 
426 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0548  ResB family protein  22.42 
 
 
461 aa  43.9  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1104  ResB family protein  23.16 
 
 
457 aa  43.1  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0859447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>