More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1643 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
317 aa  639    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  58.23 
 
 
323 aa  344  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  51.13 
 
 
315 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  52.04 
 
 
323 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  49.2 
 
 
315 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  54.17 
 
 
323 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  47.91 
 
 
315 aa  291  8e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  51.01 
 
 
302 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  45.68 
 
 
324 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  45.51 
 
 
322 aa  258  7e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  45.22 
 
 
312 aa  253  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  47.47 
 
 
341 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  47.47 
 
 
315 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  47.47 
 
 
315 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 
337 aa  242  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  42.16 
 
 
308 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  42.24 
 
 
344 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  40.45 
 
 
351 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  45.94 
 
 
330 aa  231  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  40.86 
 
 
350 aa  230  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  41.56 
 
 
323 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  38.94 
 
 
356 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  40.19 
 
 
314 aa  205  7e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  39.37 
 
 
328 aa  200  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3309  alpha/beta hydrolase fold  39.31 
 
 
321 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244903  hitchhiker  0.0000365568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  39.69 
 
 
334 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  38.15 
 
 
331 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3843  alpha/beta hydrolase fold  39.49 
 
 
316 aa  193  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  41.21 
 
 
311 aa  192  5e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 
331 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0515  alpha/beta hydrolase fold  39.58 
 
 
343 aa  189  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  37.03 
 
 
315 aa  188  9e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 
323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 
288 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  37.38 
 
 
297 aa  165  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 
287 aa  163  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  36.11 
 
 
301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  35.87 
 
 
283 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  30.23 
 
 
289 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 
289 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  35.91 
 
 
293 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9230  epoxide hydrolase  34.33 
 
 
371 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.247355  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3311  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 
351 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000971087  hitchhiker  0.0000356017 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  33.44 
 
 
284 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  35.13 
 
 
308 aa  152  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  36.88 
 
 
287 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  32.27 
 
 
290 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  36.39 
 
 
286 aa  149  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6398  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 
367 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.234405 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0495  alpha/beta hydrolase fold protein  34.95 
 
 
345 aa  149  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5525  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 
367 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  35.83 
 
 
288 aa  148  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5889  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 
367 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159226  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  34.67 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  36.48 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  35.91 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  36.42 
 
 
288 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 
291 aa  145  9e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6110  alpha/beta hydrolase fold  33.97 
 
 
376 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173305  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 
300 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  33.23 
 
 
297 aa  144  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  37.58 
 
 
308 aa  143  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2842  alpha/beta hydrolase fold  32.44 
 
 
434 aa  143  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
291 aa  142  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5871  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 
376 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  35.37 
 
 
289 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5947  alpha/beta hydrolase fold  35.62 
 
 
390 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00350915 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  34.98 
 
 
304 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  33.75 
 
 
287 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  34.91 
 
 
308 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 
308 aa  136  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  50.64 
 
 
304 aa  136  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  33.44 
 
 
292 aa  135  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 
328 aa  135  9e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  32.27 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  33.02 
 
 
289 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  33.44 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  45.73 
 
 
349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7125  putative epoxide hydrolase  33.7 
 
 
356 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.675745  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.49 
 
 
313 aa  126  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  34.06 
 
 
308 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  45.45 
 
 
308 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
287 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  33.75 
 
 
308 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  33.96 
 
 
307 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6641  hypothetical protein  65.56 
 
 
144 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  35.32 
 
 
270 aa  122  9e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 
306 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  32.59 
 
 
307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  33.44 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  34.09 
 
 
296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.77 
 
 
293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  35.31 
 
 
307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  34.28 
 
 
494 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  36.71 
 
 
294 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 
293 aa  116  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  33.12 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  33.12 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  44.83 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>