More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0742 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 		 247 aa  474  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  45.37 
 
 		 257 aa  190  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  41.56 
 
 		 261 aa  189  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  39.51 
 
 		 258 aa  186  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  41.53 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  41.53 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  41.53 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  41.53 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  39.51 
 
 		 265 aa  185  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  41.53 
 
 		 265 aa  185  6e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  44.24 
 
 		 265 aa  185  7e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  44.24 
 
 		 265 aa  185  7e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  44.24 
 
 		 265 aa  184  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  46.7 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  43.42 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  45.75 
 
 		 258 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  42.04 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  43.32 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  38.71 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  37.9 
 
 		 267 aa  179  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  38.27 
 
 		 263 aa  176  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  39.41 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  41.84 
 
 		 261 aa  174  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  42.19 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03149  flagellar biosynthesis protein FliR  38.17 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1703  flagellar biosynthesis protein FliR  39.02 
 
 		 260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  43.19 
 
 		 258 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  38.8 
 
 		 267 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  41.4 
 
 		 262 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  45.45 
 
 		 258 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002827  flagellar biosynthesis protein FliR  38.43 
 
 		 260 aa  171  9e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1630  flagellar biosynthesis protein FliR  38.71 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  44.98 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2296  flagellar biosynthesis protein FliR  36.99 
 
 		 260 aa  168  8e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  40.93 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  42.62 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  37.87 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  38.37 
 
 		 264 aa  165  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  42.24 
 
 		 259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  41.47 
 
 		 259 aa  164  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  43.04 
 
 		 258 aa  164  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  36.89 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  35.83 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  35.83 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  35.83 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  34.58 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  39.27 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  38.1 
 
 		 260 aa  161  9e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  32.08 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  41.86 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  41.86 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3035  flagellar biosynthesis protein FliR  37.04 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3219  flagellar biosynthesis protein FliR  39.29 
 
 		 260 aa  158  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  38.3 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  34.45 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  37.55 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  38.32 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0036  flagellar biosynthetic protein FliR  37.92 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0027  flagellar biosynthetic protein FliR  37.45 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  34.75 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  34.75 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  42.59 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  33.89 
 
 		 247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  36.51 
 
 		 260 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0153  flagellar biosynthesis protein FliR  31.95 
 
 		 260 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  36.1 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  38.14 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  36.1 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  36.1 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  36.1 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  36.1 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  36.1 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  36.1 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  39 
 
 		 261 aa  149  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  35.8 
 
 		 261 aa  149  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3666  flagellar biosynthetic protein FliR  40.74 
 
 		 259 aa  149  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3595  flagellar biosynthetic protein FliR  43.64 
 
 		 259 aa  148  8e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  35.39 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2160  flagellar biosynthesis protein FliR  40 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  34.62 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1700  flagellar biosynthetic protein FliR  34.31 
 
 		 269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000123329 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0065  flagellar protein FliR  34.31 
 
 		 269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1692  flagellar biosynthesis protein FliR  40.57 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000555568  normal  0.0138418 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1698  flagellar biosynthetic protein FliR  40.57 
 
 		 261 aa  143  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412821  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  34.09 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  37.92 
 
 		 264 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2183  flagellar biosynthesis protein FliR  40.57 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000259397  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  33.64 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1234  flagellar biosynthesis protein FliR  40.57 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000114634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  40.09 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2727  flagellar biosynthesis protein FliR  40.57 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00116197  normal  0.508279 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  39.72 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  37.6 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000910874  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24110  flagellar biosynthetic protein  38.17 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001178  flagellar biosynthesis protein FliR  40.47 
 
 		 258 aa  142  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.795861  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  37.19 
 
 		 264 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  37.19 
 
 		 264 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  37.19 
 
 		 264 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  37.19 
 
 		 264 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1071  flagellar biosynthesis protein FliR  40.16 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>