More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3250 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3250  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  100 
 
 
310 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.13 
 
 
332 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.02 
 
 
309 aa  277  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.43514  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11550  carbohydrate ABC transporter membrane protein  46.45 
 
 
354 aa  268  7e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.0144146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.82 
 
 
294 aa  259  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000181172  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.28 
 
 
330 aa  257  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.94 
 
 
338 aa  255  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.786552  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.26 
 
 
328 aa  252  6e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.00155627 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2755  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.93 
 
 
333 aa  249  5e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.276283  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2071  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.31 
 
 
345 aa  243  3e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000672298  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1875  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  44.85 
 
 
350 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0432685  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.12 
 
 
338 aa  233  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.335951  normal  0.466485 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.94 
 
 
312 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.71 
 
 
312 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.746865  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2949  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.79 
 
 
302 aa  225  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3986  putative ABC transporter (permease protein)  41.22 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
315 aa  203  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.68 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  37.34 
 
 
307 aa  199  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.34 
 
 
307 aa  199  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  38.57 
 
 
320 aa  196  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  40.62 
 
 
305 aa  193  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 
318 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0625824  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
307 aa  192  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
299 aa  192  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.8 
 
 
318 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949955  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 
312 aa  192  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
309 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.86 
 
 
306 aa  189  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8235  ABC transporter, permease protein  38.85 
 
 
306 aa  189  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
294 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
298 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.13 
 
 
296 aa  186  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
316 aa  186  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0497455  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 
310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0867066 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0541  ABC transporter, permease protein  37.64 
 
 
308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0557  ABC transporter, permease protein  37.64 
 
 
308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
313 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.394829 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
295 aa  182  7e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1182  sugar ABC transporter, permease protein, putative  41.49 
 
 
319 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547049  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1085  putative sugar ABC transporter, permease protein  41.49 
 
 
319 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  37.63 
 
 
288 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.4 
 
 
303 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0695484  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.456499 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.05 
 
 
306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.692762  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 
317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.78 
 
 
299 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
297 aa  179  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
293 aa  179  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.58 
 
 
320 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230008  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1247  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
308 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.732084 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29410  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.83 
 
 
322 aa  176  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.899558  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.13 
 
 
306 aa  176  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
310 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181942  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
317 aa  176  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.156333  normal  0.563407 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
299 aa  176  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.426381  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  35.76 
 
 
317 aa  176  7e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.13 
 
 
324 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.74 
 
 
304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29330  permease component of ABC-type sugar transporter  35.82 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172129  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.14 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00259426  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02940  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.21 
 
 
318 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.68 
 
 
311 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.51 
 
 
290 aa  172  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
290 aa  172  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 
312 aa  172  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1755  ABC transporter permease  38.4 
 
 
312 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.576454  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
316 aa  172  7.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0176  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.27 
 
 
314 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.18 
 
 
327 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.128939 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07100  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.92 
 
 
318 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.790586  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
311 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
291 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
316 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.2607 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 
309 aa  170  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.179346  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
316 aa  170  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
292 aa  170  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
312 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
316 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6585  lactose transport system (permease)  38.95 
 
 
306 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  35.64 
 
 
293 aa  169  5e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
292 aa  169  5e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
314 aa  168  8e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0166533  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
300 aa  169  8e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.454536  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.65 
 
 
307 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000296099  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
300 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
309 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07470  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.9 
 
 
304 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4034  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
303 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
308 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.283214  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03080  permease component of ABC-type sugar transporter  34.4 
 
 
322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.18 
 
 
309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.114297  normal  0.0929805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.4 
 
 
312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.308461  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 
305 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 
318 aa  166  4e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000473727  hitchhiker  0.00124128 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
286 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453278  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>