More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1214 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  100 
 
 		 121 aa  246  7e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  63.87 
 
 		 125 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  63.87 
 
 		 132 aa  169  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  63.87 
 
 		 132 aa  169  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  63.87 
 
 		 131 aa  167  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  61.34 
 
 		 131 aa  165  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  65.18 
 
 		 117 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  59.66 
 
 		 154 aa  161  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  61.21 
 
 		 120 aa  160  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  62.16 
 
 		 139 aa  158  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  58.47 
 
 		 131 aa  154  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  58.26 
 
 		 120 aa  154  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  62.61 
 
 		 123 aa  154  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  60 
 
 		 122 aa  153  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  59.13 
 
 		 120 aa  152  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  62.93 
 
 		 123 aa  152  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  58.82 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  56.64 
 
 		 124 aa  150  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  55.56 
 
 		 123 aa  149  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  55.56 
 
 		 123 aa  149  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  59.83 
 
 		 124 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  59.83 
 
 		 124 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  66.07 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  57.39 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  58.97 
 
 		 143 aa  147  4e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  63.96 
 
 		 149 aa  147  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  58.97 
 
 		 124 aa  146  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  52.94 
 
 		 125 aa  146  9e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  58.56 
 
 		 126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  58.26 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  57.98 
 
 		 125 aa  145  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  58.97 
 
 		 122 aa  144  5e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  53.04 
 
 		 123 aa  142  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  51.69 
 
 		 124 aa  142  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  54.7 
 
 		 123 aa  141  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  56.88 
 
 		 126 aa  140  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  61.95 
 
 		 126 aa  140  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  53.78 
 
 		 124 aa  139  9e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  55.86 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  53.98 
 
 		 137 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  58.72 
 
 		 125 aa  139  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  52.17 
 
 		 140 aa  137  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  57.94 
 
 		 123 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  49.57 
 
 		 125 aa  136  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  50.42 
 
 		 123 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  48.25 
 
 		 123 aa  135  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  48.72 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  52.63 
 
 		 123 aa  134  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  54.13 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  50.93 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  51.28 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  51.89 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  55.66 
 
 		 122 aa  127  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  52.21 
 
 		 120 aa  123  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  58.1 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  57.14 
 
 		 121 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  57.14 
 
 		 121 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  57.14 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  56.19 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1828  thioredoxin-related  45.45 
 
 		 124 aa  114  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00237221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  51.43 
 
 		 123 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1185  thioredoxin-related  39.82 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0751428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  39.09 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  39.09 
 
 		 121 aa  109  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  39.05 
 
 		 120 aa  102  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2251  Thioredoxin domain protein  48.62 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.32893  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  38.68 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  46.6 
 
 		 178 aa  100  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  42.72 
 
 		 269 aa  100  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11498  thioredoxin trxA  45.54 
 
 		 124 aa  100  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000146148  normal  0.118625 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  49.49 
 
 		 140 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  49.49 
 
 		 140 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  50.51 
 
 		 140 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  47.47 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  47.47 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  45.19 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  48.48 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  48.48 
 
 		 170 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  50.52 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  46.6 
 
 		 140 aa  97.8  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  45.1 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  40.2 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  42.72 
 
 		 140 aa  94.4  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  47.52 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4710  thioredoxin  44.55 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015363  normal  0.0508397 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  41.84 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  44.55 
 
 		 140 aa  91.3  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  42.05 
 
 		 104 aa  90.9  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  51.61 
 
 		 108 aa  90.9  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  40.22 
 
 		 135 aa  90.5  8e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  48.51 
 
 		 109 aa  90.1  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  45.54 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  42.86 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  50 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3204  thioredoxin 2  40.57 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  45 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  50 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000083  thioredoxin 2  44 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.396729  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0854  thioredoxin 2  42.57 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  39.6 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>