More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1145 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 95 aa  179  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  87.64 
 
 		 90 aa  150  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  87.36 
 
 		 92 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  80.68 
 
 		 88 aa  137  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  80.68 
 
 		 88 aa  137  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  83.12 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  82.56 
 
 		 90 aa  124  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  75.28 
 
 		 89 aa  123  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  74.42 
 
 		 86 aa  123  9e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  74.7 
 
 		 86 aa  117  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  70.79 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  73.17 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  67.42 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  74.68 
 
 		 86 aa  110  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  71.25 
 
 		 86 aa  107  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  68.18 
 
 		 88 aa  107  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  70.37 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  68.6 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  70.37 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  68.75 
 
 		 86 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  68.75 
 
 		 86 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  68.75 
 
 		 86 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  67.9 
 
 		 88 aa  103  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  63.75 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  70.93 
 
 		 86 aa  101  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  67.9 
 
 		 86 aa  101  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  66.28 
 
 		 86 aa  100  8e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  67.44 
 
 		 86 aa  98.6  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  68.6 
 
 		 86 aa  96.7  9e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  65.06 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  70.37 
 
 		 86 aa  94  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  60.49 
 
 		 86 aa  92.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  68 
 
 		 86 aa  91.3  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  61.63 
 
 		 86 aa  91.3  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1614  ribosomal protein S20  64.77 
 
 		 88 aa  86.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  63.95 
 
 		 86 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12430  SSU ribosomal protein S20P  66.28 
 
 		 88 aa  84.3  6e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0372924  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07740  ribosomal protein S20  65.43 
 
 		 172 aa  84  6e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.603346 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1654  ribosomal protein S20  65.82 
 
 		 167 aa  83.6  8e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.158748  hitchhiker  0.00316633 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  59.26 
 
 		 87 aa  82  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  55.7 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  55.81 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  55 
 
 		 87 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  55 
 
 		 87 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  48.31 
 
 		 89 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0854  ribosomal protein S20  60 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  53.09 
 
 		 89 aa  74.7  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  48.78 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0583  30S ribosomal protein S20  61.25 
 
 		 86 aa  73.6  0.0000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  55.84 
 
 		 88 aa  72  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  52.5 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  51.85 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  48.81 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  51.81 
 
 		 94 aa  67  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  67  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  50.62 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  52.56 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  44.32 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  46.74 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2909  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2817  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  48.78 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  49.38 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  45.05 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 85 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  42.35 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  45.05 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  48.89 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  51.28 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  47.37 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  45.65 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  40.74 
 
 		 85 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  48.15 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  46.15 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2717  30S ribosomal protein S20  53.95 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.469442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  44.94 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  51.9 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0225  30S ribosomal protein S20  38.89 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477404  normal  0.0381808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0850  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000116553  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1710  30S ribosomal protein S20  47.95 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000312483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>