More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0068 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0068  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  100 
 
 
308 aa  597  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.97 
 
 
305 aa  408  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0279283 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.49 
 
 
312 aa  400  1e-110  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01540  carbohydrate ABC transporter membrane protein  59.44 
 
 
329 aa  355  6e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23420  carbohydrate ABC transporter membrane protein  63.7 
 
 
310 aa  341  1e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.93855  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.38 
 
 
294 aa  312  4e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0540669  normal  0.0518644 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1618  binding-protein-dependent transport protein  49.64 
 
 
296 aa  261  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.14282  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.31 
 
 
340 aa  253  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.162139 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.22 
 
 
296 aa  179  6e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.54 
 
 
309 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.179346  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
329 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.811614  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
300 aa  154  3e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.454536  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
295 aa  153  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
309 aa  149  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.46 
 
 
294 aa  149  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.96 
 
 
300 aa  148  1e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0038089  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3250  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.97 
 
 
310 aa  148  1e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
338 aa  147  2e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.786552  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
315 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  2.28392e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8235  ABC transporter, permease protein  34.64 
 
 
306 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.47 
 
 
305 aa  143  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0388505  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28370  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.74 
 
 
287 aa  140  2e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.096742  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1875  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  33.22 
 
 
350 aa  140  2e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0432685  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
319 aa  140  2e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11550  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.99 
 
 
354 aa  139  7e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.0144146 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03080  permease component of ABC-type sugar transporter  33.33 
 
 
322 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 
297 aa  137  3e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185813 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
312 aa  136  3e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.633875  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
328 aa  137  3e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.00155627 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
293 aa  136  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
299 aa  135  7e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  35.58 
 
 
287 aa  135  7e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
319 aa  135  1e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
279 aa  134  1e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.232459 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
309 aa  134  2e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.43514  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 
317 aa  134  2e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00850  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.48 
 
 
320 aa  133  4e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6585  lactose transport system (permease)  34.98 
 
 
306 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.96 
 
 
330 aa  132  7e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
320 aa  132  8e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.253823  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1361  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
315 aa  132  8e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193472  normal  0.165724 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2833  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
319 aa  131  1e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0200859  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
308 aa  131  1e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
299 aa  131  1e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.456499 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
293 aa  130  2e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00259426  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
302 aa  130  2e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
312 aa  131  2e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11610  permease component of ABC-type sugar transporter  32.85 
 
 
311 aa  130  2e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.117578  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  31.69 
 
 
318 aa  131  2e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
292 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
311 aa  130  4e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.9 
 
 
302 aa  129  5e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
306 aa  129  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.692762  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.68 
 
 
308 aa  129  7e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172129  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
306 aa  128  9e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
317 aa  128  1e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  32.85 
 
 
307 aa  128  1e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
292 aa  128  1e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
307 aa  128  1e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.12 
 
 
291 aa  127  2e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0196347  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1304  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  33.07 
 
 
334 aa  127  2e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00913134  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
298 aa  127  2e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
316 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
309 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  3.25465e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
327 aa  126  4e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0175684  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
318 aa  126  4e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.63 
 
 
328 aa  127  4e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0926617  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3942  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30 
 
 
321 aa  126  4e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.108149  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
296 aa  126  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  3.92628e-05 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
297 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3650  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.93 
 
 
315 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0685768 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
328 aa  125  8e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.913769 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
287 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.484603  normal  0.727796 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  34.06 
 
 
305 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31530  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.91 
 
 
313 aa  124  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.68002  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33 
 
 
316 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2010  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  27.85 
 
 
318 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.360583  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.43 
 
 
331 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.216304  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12339  sugar-transport integral membrane protein ABC transporter uspA  34.57 
 
 
290 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
317 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.10809  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
297 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
297 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0810  ABC-type sugar transport system, permease component  30.77 
 
 
283 aa  124  3e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2414  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  31.54 
 
 
294 aa  123  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.78 
 
 
306 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
299 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270687  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06940  hypothetical protein  30.96 
 
 
329 aa  123  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
316 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 
289 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.77 
 
 
291 aa  122  5e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
316 aa  122  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 
286 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728774  normal  0.302995 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
292 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3270  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
321 aa  122  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.14 
 
 
299 aa  122  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.426381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4890  sugar transport system (permease)  32.32 
 
 
284 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
309 aa  122  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2071  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
345 aa  121  1e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  6.72298e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.2 
 
 
296 aa  122  1e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.83647e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
283 aa  121  1e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>