More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0197 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0197  cytidylate kinase  100 
 
 		 203 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1023  cytidylate kinase  67.5 
 
 		 212 aa  259  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283753  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3591  cytidylate kinase  69.65 
 
 		 206 aa  249  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.39582  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3881  cytidylate kinase  67.66 
 
 		 211 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3276  cytidylate kinase  69.15 
 
 		 211 aa  248  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.811486  normal  0.522336 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3784  cytidylate kinase  65.64 
 
 		 194 aa  233  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150684  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1111  cytidylate kinase  58.05 
 
 		 208 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0102  cytidylate kinase  54.29 
 
 		 216 aa  206  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0715  cytidylate kinase  68.82 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0193  cytidylate kinase  55.39 
 
 		 217 aa  205  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3607  cytidylate kinase  54.19 
 
 		 218 aa  204  8e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0733159  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4031  cytidylate kinase  52.68 
 
 		 215 aa  204  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4361  cytidylate kinase  52.45 
 
 		 215 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0102365 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0025  cytidylate kinase  55.21 
 
 		 219 aa  201  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0026  cytidylate kinase  55.73 
 
 		 219 aa  200  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404349  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2457  cytidylate kinase  57.35 
 
 		 208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3457  cytidylate kinase  51.22 
 
 		 212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0614  cytidylate kinase  52.45 
 
 		 216 aa  199  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00523823 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0030  cytidylate kinase  51.55 
 
 		 214 aa  192  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0398  cytidylate kinase  53.43 
 
 		 212 aa  191  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1324  cytidylate kinase  54.63 
 
 		 208 aa  191  7e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0066  cytidylate kinase  53.43 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0168644  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0030  cytidylate kinase  56.57 
 
 		 212 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0191  cytidylate kinase  52.45 
 
 		 212 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0104  cytidylate kinase  51.96 
 
 		 212 aa  181  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1304  cytidylate kinase  47.29 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00011985  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0099  cytidylate kinase  54.26 
 
 		 208 aa  178  5.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.906806 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  45.07 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2938  cytidylate kinase  51.22 
 
 		 211 aa  174  6e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0641  cytidylate kinase  50.49 
 
 		 212 aa  174  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.112665 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0208  cytidylate kinase  49.52 
 
 		 212 aa  171  5.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.300993  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2129  cytidylate kinase  53.97 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.29015 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2406  cytidylate kinase  53.97 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.311621 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1494  cytidylate kinase  51.98 
 
 		 209 aa  168  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.373102 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0164  cytidylate kinase  49.51 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7108  cytidylate kinase  51.46 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978606  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2086  cytidylate kinase  47.2 
 
 		 222 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6548  cytidylate kinase  53.44 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219054  normal  0.440161 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0150  cytidylate kinase  50.24 
 
 		 217 aa  162  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  45.21 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2916  cytidylate kinase  50.7 
 
 		 219 aa  159  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0479896 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  43.32 
 
 		 231 aa  159  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 222 aa  158  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  41.35 
 
 		 232 aa  157  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 230 aa  157  8e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  41.18 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  40.48 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5617  cytidylate kinase  48.78 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.314381  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  42.6 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  45.5 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  42.6 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0294  cytidylate kinase  49.75 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0745  cytidylate kinase  45.37 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.804624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  42.6 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  42.6 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1953  cytidylate kinase  42.73 
 
 		 230 aa  155  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000156815  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  41.94 
 
 		 232 aa  155  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1637  cytidylate kinase  46.23 
 
 		 228 aa  154  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  43.87 
 
 		 227 aa  154  7e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  41.1 
 
 		 230 aa  154  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  42.92 
 
 		 230 aa  154  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2946  cytidylate kinase  45.75 
 
 		 228 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  41.01 
 
 		 230 aa  153  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2883  cytidylate kinase  45.75 
 
 		 228 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0880838  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  40.47 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2403  cytidylate kinase  42.47 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4159  cytidylate kinase  46.23 
 
 		 228 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  41.74 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0567  cytidylate kinase  44.91 
 
 		 228 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1005  cytidylate kinase  44.91 
 
 		 228 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1046  cytidylate kinase  44.91 
 
 		 228 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  43.4 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2995  cytidylate kinase  45.75 
 
 		 255 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2468  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  43.32 
 
 		 673 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.835531  normal  0.361895 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  44 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0429  cytidylate kinase  45.28 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0948  cytidylate kinase  45.28 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  40.27 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0200  cytidylate kinase  45.28 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2573  cytidylate kinase  45.28 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0883038  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  41.94 
 
 		 224 aa  151  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1392  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  44.24 
 
 		 673 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121243  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  37.74 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1645  cytidylate kinase  43.72 
 
 		 225 aa  150  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  39.64 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3002  cytidylate kinase  45.62 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  hitchhiker  0.00995031 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  42.51 
 
 		 221 aa  149  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2570  cytidylate kinase  45.5 
 
 		 221 aa  149  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138254  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 229 aa  149  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  39.37 
 
 		 231 aa  149  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  43.89 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  41.78 
 
 		 225 aa  149  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  39.82 
 
 		 230 aa  149  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  43.26 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  43.26 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0981  cytidylate kinase  45.83 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233916  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>