35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2265 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2265  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 112 aa  223  6e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.635279  normal  0.073962 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0204  TPR repeat-containing protein  60.19 
 
 		 110 aa  117  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0438861  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0023  TPR repeat-containing protein  50.98 
 
 		 111 aa  97.8  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.727906  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0354  TPR repeat-containing protein  45.28 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2284  TPR repeat-containing protein  46.15 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0435427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2621  TPR repeat-containing protein  45.1 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46510  hypothetical protein  45.63 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0247352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4712  hypothetical protein  44.76 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.658591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0051  TPR repeat-containing protein  45.36 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0013  hypothetical protein  42.16 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0015  TPR domain-containing protein  43.88 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00160  TPR repeat-containing protein  43.88 
 
 		 105 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0080  TPR repeat-containing protein  44.55 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.550206  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0064  TPR domain-containing protein  44.55 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000302311 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0080  tetratricopeptide domain-containing protein  44.55 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.163561  hitchhiker  0.00000000000757426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0083  TPR repeat-containing protein  44.55 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  hitchhiker  0.0000000163177 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3205  tetratricopeptide TPR_2  33.94 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3254  hypothetical protein  30.85 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3488  DnaJ-like protein  34.85 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.471685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  27.62 
 
 		 452 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38886  predicted protein  29.51 
 
 		 648 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 715 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1242  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 103 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  41.79 
 
 		 654 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 3560 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  36.9 
 
 		 1005 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  29.73 
 
 		 519 aa  41.2  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31.76 
 
 		 1694 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  30.77 
 
 		 564 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 827 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0216  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 296 aa  40.8  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.63 
 
 		 1034 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0088  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 275 aa  40.4  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 243 aa  40.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  40.35 
 
 		 662 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>