More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1949 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  100 
 
 		 256 aa  517  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  58.33 
 
 		 267 aa  314  8e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  54.3 
 
 		 262 aa  291  7e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  55 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  53.01 
 
 		 266 aa  271  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  54.47 
 
 		 257 aa  260  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  48.73 
 
 		 269 aa  256  3e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  50.2 
 
 		 248 aa  250  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  50.2 
 
 		 248 aa  250  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  52.89 
 
 		 270 aa  249  4e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  54.85 
 
 		 253 aa  248  7e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  47.67 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  47.67 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  49.81 
 
 		 266 aa  242  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  48.84 
 
 		 267 aa  240  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  46.1 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  48.26 
 
 		 263 aa  232  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  48.26 
 
 		 263 aa  232  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  46.59 
 
 		 263 aa  229  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2977  signal peptidase I  47.58 
 
 		 264 aa  226  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0323133  hitchhiker  0.00413719 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  46.15 
 
 		 305 aa  225  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  46.15 
 
 		 305 aa  225  4e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  46.15 
 
 		 305 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  45.67 
 
 		 305 aa  224  8e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  45.14 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  50 
 
 		 284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  45.96 
 
 		 284 aa  221  6e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  45.96 
 
 		 284 aa  221  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  43.3 
 
 		 305 aa  221  8e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  46.64 
 
 		 305 aa  221  9e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  45.61 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  43.75 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1442  Signal peptidase I  47.96 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  44.44 
 
 		 305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  45.14 
 
 		 305 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  45.14 
 
 		 305 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  45.14 
 
 		 305 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  45.14 
 
 		 305 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  45.04 
 
 		 268 aa  218  7.999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  51.57 
 
 		 284 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1373  signal peptidase I  47.58 
 
 		 264 aa  218  8.999999999999998e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  40.62 
 
 		 325 aa  218  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  51.57 
 
 		 284 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  44.76 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  45.45 
 
 		 268 aa  218  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  44.35 
 
 		 297 aa  217  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  44.36 
 
 		 274 aa  217  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  45.23 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  44.21 
 
 		 300 aa  216  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  44.35 
 
 		 297 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  46.48 
 
 		 284 aa  216  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  51.57 
 
 		 284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  44.17 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  44.95 
 
 		 288 aa  216  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  46.3 
 
 		 284 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  47.18 
 
 		 297 aa  215  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  42.56 
 
 		 325 aa  215  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  47.18 
 
 		 297 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  47.18 
 
 		 297 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  47.18 
 
 		 297 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  49.15 
 
 		 283 aa  215  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  40.47 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  42.51 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  43.77 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  44.72 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  44.26 
 
 		 305 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  45.42 
 
 		 268 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  44.94 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  46.37 
 
 		 297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  46.37 
 
 		 297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  40.47 
 
 		 256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  45.56 
 
 		 297 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  45.31 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  41.12 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1201  signal peptidase I  42.97 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1242  signal peptidase I  42.97 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  43.42 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  40.59 
 
 		 325 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  43.68 
 
 		 299 aa  209  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  41.41 
 
 		 322 aa  208  7e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  43.8 
 
 		 298 aa  208  8e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  48.57 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  40.06 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2526  signal peptidase I (leader peptidase I)  42.76 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0283141  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2462  peptidase S26A, signal peptidase I  42.4 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  45.81 
 
 		 322 aa  203  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2900  signal peptidase I  49.56 
 
 		 297 aa  202  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185771  normal  0.669107 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  48.57 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  48.57 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  48.57 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  48.57 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  48.57 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  48.57 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  48.57 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0331  signal peptidase I  38.79 
 
 		 300 aa  201  7e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  44.78 
 
 		 342 aa  201  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  45.61 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  38.83 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1084  signal peptidase I  49.12 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  40.07 
 
 		 321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>