166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1727 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  277  4e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  36.96 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  38.13 
 
 
147 aa  91.3  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  34.88 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  32.46 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0042  OsmC family protein  36.07 
 
 
142 aa  72  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  34.96 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  31.85 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  34.71 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  33.93 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  37.25 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  37.25 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  37.25 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  33.86 
 
 
405 aa  67.8  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  34.13 
 
 
132 aa  67  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  31.69 
 
 
189 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  34.11 
 
 
408 aa  67  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  34.92 
 
 
407 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  34.35 
 
 
407 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  27.34 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  31.75 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  31.58 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  32.52 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  36.27 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  34.75 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  36.27 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  31.88 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  34.45 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  36.27 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  30.95 
 
 
171 aa  63.9  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  28.95 
 
 
131 aa  63.5  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  31.2 
 
 
406 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  32.81 
 
 
410 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  30.08 
 
 
415 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  42.37 
 
 
410 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  30 
 
 
129 aa  62  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  42.37 
 
 
410 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  33.61 
 
 
132 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  35.96 
 
 
405 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  30.91 
 
 
131 aa  60.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  32.28 
 
 
127 aa  60.1  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  30.83 
 
 
406 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1071  OsmC family protein  25 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601559  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1143  OsmC family protein  25 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000523467  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1072  OsmC family protein  26.87 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.107078  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1075  OsmC family protein  25 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  25 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  31.48 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  30.25 
 
 
185 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  29.2 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  27.83 
 
 
423 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  31.62 
 
 
202 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  32 
 
 
185 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  34.31 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  28.44 
 
 
408 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  29.46 
 
 
180 aa  57.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  27.56 
 
 
172 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0732  OsmC family protein  30.84 
 
 
137 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  33.33 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  34.31 
 
 
136 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2658  OsmC family protein  32.17 
 
 
133 aa  57  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.498397 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  29.69 
 
 
413 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  31.09 
 
 
182 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  30 
 
 
406 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  27.52 
 
 
408 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  30.94 
 
 
406 aa  55.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  31.5 
 
 
412 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  29.41 
 
 
418 aa  54.3  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  29.27 
 
 
183 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  35.83 
 
 
411 aa  54.3  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3495  hypothetical protein  25 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  29.73 
 
 
182 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  35.29 
 
 
182 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  26.09 
 
 
405 aa  53.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  26.61 
 
 
135 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  31.25 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  25.98 
 
 
193 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  31.53 
 
 
409 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  27.42 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  33.68 
 
 
135 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  34.31 
 
 
182 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  26.72 
 
 
183 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  28.46 
 
 
183 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  28.95 
 
 
200 aa  51.2  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.333829 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  30.7 
 
 
187 aa  50.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  30.77 
 
 
402 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  30.47 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  27.88 
 
 
129 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  39.36 
 
 
185 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  27.12 
 
 
409 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  33.61 
 
 
187 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  29.66 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  33.67 
 
 
186 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  27.97 
 
 
186 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  31.58 
 
 
169 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3007  OsmC family protein  20.59 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  25.41 
 
 
179 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  31.3 
 
 
185 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  28.81 
 
 
186 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  27.12 
 
 
187 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.137347 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>