More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0099 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0099  cell shape-determining protein MrdB, putative  100 
 
 		 379 aa  763    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.876321  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  32.32 
 
 		 380 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  32.22 
 
 		 388 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  29.38 
 
 		 412 aa  163  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  32.05 
 
 		 380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  34.5 
 
 		 373 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  31.67 
 
 		 368 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  31.05 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1786  rod shape-determining protein RodA  35.71 
 
 		 380 aa  150  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  30.97 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  31.41 
 
 		 368 aa  150  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  31.86 
 
 		 368 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  34.39 
 
 		 373 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  28.95 
 
 		 368 aa  150  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  31.27 
 
 		 363 aa  150  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  32.93 
 
 		 382 aa  150  5e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  31.66 
 
 		 387 aa  149  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  32.9 
 
 		 368 aa  149  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  28.12 
 
 		 368 aa  149  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  30.53 
 
 		 378 aa  149  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  33.24 
 
 		 362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  32.39 
 
 		 367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  32.39 
 
 		 367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  33.68 
 
 		 373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  31.9 
 
 		 371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  29.82 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  31.97 
 
 		 372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  32.19 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  32.19 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  32.19 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  32.19 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  32.65 
 
 		 368 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  33.88 
 
 		 368 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  34.19 
 
 		 426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  31.88 
 
 		 417 aa  146  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  31.76 
 
 		 367 aa  146  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  29.77 
 
 		 369 aa  145  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  31.86 
 
 		 373 aa  145  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  30.23 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  32.7 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  32.72 
 
 		 378 aa  145  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  32.12 
 
 		 438 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  32.2 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  27.88 
 
 		 367 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1325  cell cycle protein FtsW  28.5 
 
 		 386 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1113  cell cycle protein  29.24 
 
 		 386 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  32.15 
 
 		 377 aa  143  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  34.71 
 
 		 373 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4083  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  29.62 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1100  stage V sporulation protein E  28.21 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  30.99 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1106  cell division protein ftsW  28.21 
 
 		 386 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.058773  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1258  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  29.33 
 
 		 386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  33.22 
 
 		 366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1363  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  29.47 
 
 		 386 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  34.62 
 
 		 366 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  32.06 
 
 		 398 aa  139  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1565  cell division protein FtsW  33.78 
 
 		 364 aa  139  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  32.55 
 
 		 368 aa  138  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  29.53 
 
 		 379 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4859  rod shape-determining protein RodA  34.19 
 
 		 380 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  30.08 
 
 		 375 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  34.19 
 
 		 373 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  30.15 
 
 		 372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  30.15 
 
 		 372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  29.22 
 
 		 421 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0615  rod shape-determining protein RodA  33.46 
 
 		 381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1485  rod shape-determining protein RodA  32.5 
 
 		 380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  29.76 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0240  rod shape-determining protein RodA  32.41 
 
 		 380 aa  136  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  31.7 
 
 		 419 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  30.29 
 
 		 422 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 366 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1287  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  27.71 
 
 		 386 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0930  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 371 aa  135  8e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  31.1 
 
 		 373 aa  135  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  30.64 
 
 		 374 aa  135  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0929  putative rod shape determining protein  31.79 
 
 		 380 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  31.75 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  27.75 
 
 		 374 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  31.71 
 
 		 370 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  32.25 
 
 		 374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4364  cell cycle protein  34.43 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  33.69 
 
 		 372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1742  rod shape-determining protein RodA  36.14 
 
 		 383 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  32.37 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2025  rod shape-determining protein RodA  35.31 
 
 		 383 aa  134  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0161321  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  33.33 
 
 		 370 aa  134  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  30.27 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  30.27 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4806  rod shape-determining protein RodA  34.19 
 
 		 374 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal  0.152125 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1691  cell cycle protein FtsW  31.51 
 
 		 403 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.951767  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  30.7 
 
 		 370 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  28.61 
 
 		 367 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  31.33 
 
 		 422 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4681  rod shape-determining protein RodA  34.19 
 
 		 380 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  30.7 
 
 		 370 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  30.7 
 
 		 370 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  30.7 
 
 		 370 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3340  putative rod shape-determining protein RodA  31.16 
 
 		 381 aa  133  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00193411  normal  0.0192453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>