275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10074 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10074  hypothetical protein  100 
 
 
411 aa  816  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0244263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1522  amidohydrolase  48.54 
 
 
429 aa  310  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0533658 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4704  amidohydrolase  41.43 
 
 
424 aa  290  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3221  amidohydrolase  34.87 
 
 
413 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  2.7233e-11  hitchhiker  0.000156349 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2674  amidohydrolase  38.5 
 
 
394 aa  190  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  31.32 
 
 
407 aa  187  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  32.52 
 
 
400 aa  163  5e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  30.9 
 
 
445 aa  156  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  31.45 
 
 
426 aa  152  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  33.93 
 
 
423 aa  148  2e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  31.64 
 
 
444 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  32.32 
 
 
433 aa  144  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  30.22 
 
 
405 aa  142  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  33.25 
 
 
440 aa  142  1e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  29.78 
 
 
430 aa  142  1e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  33.33 
 
 
391 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  30.17 
 
 
407 aa  139  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  31.7 
 
 
426 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  30.56 
 
 
455 aa  138  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  31.38 
 
 
421 aa  137  3e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  30.92 
 
 
422 aa  135  2e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  27.34 
 
 
401 aa  135  2e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  31.23 
 
 
441 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  30.85 
 
 
421 aa  132  9e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  32.92 
 
 
419 aa  132  2e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  31.08 
 
 
424 aa  130  4e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  30.24 
 
 
409 aa  130  4e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  29.76 
 
 
428 aa  130  5e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  29.3 
 
 
426 aa  130  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  30.33 
 
 
411 aa  129  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  30.87 
 
 
429 aa  129  8e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  28.72 
 
 
430 aa  129  1e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  31.02 
 
 
411 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  30.22 
 
 
431 aa  126  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  26.67 
 
 
413 aa  126  8e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  30.33 
 
 
417 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  30.33 
 
 
417 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  30.33 
 
 
417 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  30.67 
 
 
416 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  30.24 
 
 
411 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  27.96 
 
 
426 aa  125  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  29.68 
 
 
438 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  30.36 
 
 
414 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  31.68 
 
 
426 aa  123  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  30.68 
 
 
412 aa  122  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  33.17 
 
 
444 aa  122  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  28.94 
 
 
433 aa  122  1e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  32.45 
 
 
413 aa  122  1e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  30.25 
 
 
402 aa  122  2e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  29.19 
 
 
433 aa  121  2e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  28.76 
 
 
444 aa  121  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  28.06 
 
 
431 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  28.36 
 
 
409 aa  120  4e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  27.76 
 
 
407 aa  120  5e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  30.46 
 
 
428 aa  120  5e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  27.32 
 
 
407 aa  120  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  30.41 
 
 
419 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0462  amidohydrolase  33.51 
 
 
401 aa  118  2e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  8.42595e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  27.76 
 
 
423 aa  118  2e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  30.08 
 
 
402 aa  118  2e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  30.73 
 
 
425 aa  118  2e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  29.9 
 
 
415 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  29.59 
 
 
411 aa  117  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  28.31 
 
 
432 aa  117  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  27.51 
 
 
437 aa  116  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  30.81 
 
 
425 aa  115  1e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  29.92 
 
 
445 aa  114  2e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  30.35 
 
 
408 aa  114  4e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  30.35 
 
 
408 aa  114  4e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  30.35 
 
 
408 aa  114  4e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  29.16 
 
 
434 aa  112  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  29.6 
 
 
408 aa  112  1e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  29.5 
 
 
419 aa  112  1e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  31.03 
 
 
408 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  27.49 
 
 
423 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  28.68 
 
 
440 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  27.34 
 
 
448 aa  109  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  28.14 
 
 
404 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  30.5 
 
 
414 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  28.86 
 
 
459 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  27.82 
 
 
413 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  28.46 
 
 
470 aa  106  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  30.2 
 
 
422 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  34.75 
 
 
428 aa  104  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  29.69 
 
 
411 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  27.2 
 
 
403 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  27.96 
 
 
391 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  28.04 
 
 
420 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  30.05 
 
 
407 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  26.83 
 
 
432 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  28.57 
 
 
436 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  27.59 
 
 
390 aa  101  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  29.8 
 
 
443 aa  101  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  28.72 
 
 
396 aa  101  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  28.9 
 
 
409 aa  100  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  30.77 
 
 
486 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  28.64 
 
 
413 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  30.79 
 
 
393 aa  99.8  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  32.27 
 
 
456 aa  99.8  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  28.4 
 
 
413 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>