More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10021 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10021  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  640  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8517  2-nitropropane dioxygenase NPD  54.15 
 
 
326 aa  270  3e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4715  putative 2-nitropropane dioxygenase  47.68 
 
 
333 aa  249  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1082  2-nitropropane dioxygenase NPD  54.46 
 
 
328 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3202  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  41.95 
 
 
323 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306208  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3068  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.77 
 
 
323 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0899956  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0206  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.79 
 
 
348 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2480  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.8 
 
 
288 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459764  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.39 
 
 
338 aa  164  2e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.58 
 
 
315 aa  162  5e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  6.55776e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  34.47 
 
 
317 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.37 
 
 
316 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  7.36816e-09  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5156  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.01 
 
 
317 aa  152  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707988  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2787  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.8 
 
 
331 aa  152  9e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.87 
 
 
316 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.52963e-05  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4537  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.49 
 
 
318 aa  146  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.262388  normal  0.792833 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  34.49 
 
 
321 aa  146  5e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4881  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.37 
 
 
320 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.35 
 
 
313 aa  143  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  2.1316e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  35.6 
 
 
315 aa  139  8e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.61973e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  34.56 
 
 
326 aa  137  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  6.64093e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.38 
 
 
323 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  6.94328e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.86 
 
 
325 aa  134  1e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  33.97 
 
 
323 aa  134  3e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.37 
 
 
316 aa  132  1e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  6.97959e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  32.61 
 
 
314 aa  127  2e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  30.77 
 
 
314 aa  126  6e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.77 
 
 
314 aa  126  6e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1222  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.79 
 
 
305 aa  125  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.925622 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04268  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03850)  36.2 
 
 
356 aa  124  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00389838 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  31.69 
 
 
318 aa  124  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1242  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.1 
 
 
295 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.488111 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1009  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.09 
 
 
345 aa  122  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5032  2-nitropropane dioxygenase NPD  51.33 
 
 
157 aa  122  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5586  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.13 
 
 
305 aa  121  2e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658342  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  35.19 
 
 
320 aa  119  5e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  32.21 
 
 
321 aa  119  5e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  35.29 
 
 
319 aa  119  1e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0744  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.25 
 
 
354 aa  118  1e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04120  oxidoreductase 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17430)  31.82 
 
 
380 aa  118  1e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.18 
 
 
334 aa  117  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.19 
 
 
319 aa  116  4e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.09 
 
 
328 aa  117  4e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1215  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.46 
 
 
295 aa  114  2e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.58877  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1232  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.46 
 
 
295 aa  114  2e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.86313 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.51 
 
 
319 aa  114  2e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1477  hypothetical protein  34.85 
 
 
370 aa  112  7e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.1 
 
 
317 aa  112  8e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4936  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.13 
 
 
492 aa  112  8e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.121654 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.14 
 
 
360 aa  111  2e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0946  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.1 
 
 
313 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00349563  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  39.22 
 
 
313 aa  110  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.93 
 
 
319 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4504  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30 
 
 
338 aa  109  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372283  normal  0.089603 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3064  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.46 
 
 
311 aa  109  7e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.31 
 
 
328 aa  109  8e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3191  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.33 
 
 
492 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  32.39 
 
 
311 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.19 
 
 
311 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3574  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.23 
 
 
331 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  1.29826e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.23 
 
 
331 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.5 
 
 
324 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1170  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  25.77 
 
 
342 aa  106  4e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.5 
 
 
355 aa  106  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.89 
 
 
377 aa  107  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.31 
 
 
329 aa  105  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2452  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.76 
 
 
345 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.24 
 
 
323 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.72 
 
 
380 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.65 
 
 
324 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1483  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.78 
 
 
335 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.36 
 
 
324 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3976  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.95 
 
 
341 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.36 
 
 
324 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7089  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.82 
 
 
329 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.7 
 
 
328 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38755  predicted protein  29.31 
 
 
343 aa  103  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.172  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.65 
 
 
313 aa  102  8e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.8 
 
 
355 aa  102  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.8 
 
 
355 aa  102  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.21 
 
 
312 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0720  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.47 
 
 
374 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0155051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0706  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.47 
 
 
374 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0466586  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  29.97 
 
 
314 aa  101  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0700  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.47 
 
 
374 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.225979 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0133  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.91 
 
 
352 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.134277 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3306  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.23 
 
 
342 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.152065  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.84 
 
 
335 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2841  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.55 
 
 
383 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000258118  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.74 
 
 
354 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0152  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.63 
 
 
345 aa  100  5e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.174988  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4296  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.73 
 
 
332 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4142  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.73 
 
 
332 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4067  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.73 
 
 
332 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0544  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  25.23 
 
 
326 aa  99  9e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.51 
 
 
354 aa  99  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09580  hypothetical protein  33.33 
 
 
351 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02830  2-nitropropane dioxygenase, putative  31.52 
 
 
409 aa  98.6  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3987  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.87 
 
 
369 aa  98.6  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0898704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2858  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.46 
 
 
316 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>