More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0526 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0526  ABC-type sugar transport systems permease components-like  100 
 
 
293 aa  578  1e-164  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.78 
 
 
299 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655631 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4638  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  70 
 
 
308 aa  385  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000461706  normal  0.23331 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4983  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  66.9 
 
 
310 aa  377  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.96 
 
 
294 aa  363  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.96 
 
 
294 aa  363  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.200183 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1051  lactose transport system permease protein  61.13 
 
 
306 aa  338  5.9999999999999996e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.390377  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1449  lactose transport system permease protein  57.59 
 
 
290 aa  333  2e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0650773 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15561  putative lactose transporter  64.46 
 
 
302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.334934 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.49 
 
 
310 aa  232  6e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.155614  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.13 
 
 
303 aa  222  7e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.693678  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.71 
 
 
300 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.06 
 
 
290 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0563  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.2 
 
 
294 aa  209  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22835  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3074  sugar ABC transporter permease protein  43.68 
 
 
307 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.15 
 
 
318 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
295 aa  204  1e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  40.36 
 
 
307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 
307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.01 
 
 
316 aa  199  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  40.07 
 
 
288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.57 
 
 
306 aa  199  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 
305 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.51 
 
 
298 aa  192  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 
309 aa  192  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  37.32 
 
 
317 aa  191  1e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 
300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 
300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.62 
 
 
299 aa  188  8e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.426381  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.76 
 
 
309 aa  187  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.68 
 
 
279 aa  187  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.983189  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.85 
 
 
293 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.14 
 
 
293 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990678  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 
320 aa  186  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230008  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  37.5 
 
 
293 aa  186  5e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
296 aa  185  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000392628 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.24 
 
 
318 aa  185  7e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000473727  hitchhiker  0.00124128 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.68 
 
 
296 aa  185  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1900  sugar ABC transporter, permease protein, putative  39.25 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1635  sugar ABC transporter, permease  39.25 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.26 
 
 
294 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.43 
 
 
316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.264329 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.96 
 
 
310 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181942  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0461  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.24 
 
 
301 aa  182  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
290 aa  182  7e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00881  ABC transporter sugar permease  37.97 
 
 
294 aa  182  8.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0244413  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.42 
 
 
292 aa  181  9.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29330  permease component of ABC-type sugar transporter  37.89 
 
 
321 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.81 
 
 
309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.93 
 
 
402 aa  180  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.79 
 
 
309 aa  179  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325465  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  38.23 
 
 
320 aa  178  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
317 aa  178  9e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
314 aa  178  9e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.74 
 
 
314 aa  178  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59424  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 
308 aa  177  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.283214  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
318 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949955  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 
325 aa  178  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
290 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.21 
 
 
321 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
318 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0625824  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.42 
 
 
309 aa  176  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.81 
 
 
307 aa  176  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45981  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  37.81 
 
 
305 aa  176  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2034  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 
296 aa  175  6e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.963086  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  38.38 
 
 
287 aa  175  7e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 
310 aa  175  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.467118  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
292 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
317 aa  175  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1969  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 
296 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 
307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.61 
 
 
302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.159905  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0204  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.169553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 
312 aa  172  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0229  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 
312 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.772545  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03080  permease component of ABC-type sugar transporter  38.85 
 
 
322 aa  172  7.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
291 aa  172  7.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0196347  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
311 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.05 
 
 
317 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.10809  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
307 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
296 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.243021 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
299 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29020  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.02 
 
 
275 aa  170  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
291 aa  169  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1691  oligogalacturonide ABC tansporter, permease protein  36.17 
 
 
296 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.041328  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.06 
 
 
316 aa  169  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 
296 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.780468  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
294 aa  169  7e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 
291 aa  169  7e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.199241  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0630  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  32.85 
 
 
310 aa  168  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0905  transmembrane permease MsmF  31.93 
 
 
289 aa  168  8e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0122469  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0698  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  32.85 
 
 
310 aa  168  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0480  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  32.85 
 
 
310 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
291 aa  168  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0604  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  32.85 
 
 
310 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10960  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.37 
 
 
298 aa  167  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0623  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  32.85 
 
 
310 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>