More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1199 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1199  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  454  1e-127  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105724  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1278  hypothetical protein  58.3 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07721  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  45.02 
 
 		 231 aa  185  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795739 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14181  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  45.58 
 
 		 226 aa  180  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07191  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.33 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.0203679 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0094  SAM-dependent methyltransferase  41.33 
 
 		 227 aa  175  6e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.333279  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0315  hypothetical protein  37.89 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0042  Methyltransferase type 12  39.21 
 
 		 223 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07171  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.93 
 
 		 231 aa  141  6e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07351  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.5 
 
 		 231 aa  141  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.138217  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07151  methylase  36.64 
 
 		 235 aa  141  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.353179  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2592  hypothetical protein  37.84 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0662  hypothetical protein  36.32 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1655  methyltransferase type 12  36.77 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.159478  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0120  Methyltransferase type 12  36.49 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0895  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.88 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195725 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2907  Methyltransferase type 11  26.27 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 270 aa  67  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1580  type 11 methyltransferase  34.35 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4615  Methyltransferase type 11  32.06 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369451  hitchhiker  0.00577635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7775  hypothetical protein  32.82 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  39.62 
 
 		 263 aa  62  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  39.62 
 
 		 263 aa  62  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  39.62 
 
 		 263 aa  62  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  42.7 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  33.76 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  40.74 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  22.93 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  33.85 
 
 		 414 aa  59.3  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.89 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  42.53 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  41.77 
 
 		 285 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  29.75 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  29.75 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  29.75 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  29.75 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  29.75 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.33 
 
 		 296 aa  58.5  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.78 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  38.75 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  34.83 
 
 		 246 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  26.97 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  36.63 
 
 		 255 aa  57  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  36.25 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  25.73 
 
 		 289 aa  57  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  27.04 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  33.58 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2270  Methyltransferase type 11  38.37 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.23 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5054  HemK family modification methylase  38.3 
 
 		 284 aa  55.5  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244317  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  28.5 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.76 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  37.08 
 
 		 395 aa  55.1  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  33.14 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  33.33 
 
 		 400 aa  55.1  0.0000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  27.43 
 
 		 283 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  31.31 
 
 		 273 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 268 aa  54.3  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  28.18 
 
 		 269 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 252 aa  54.3  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  35.09 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  40.26 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  49.18 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  25 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.04 
 
 		 259 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 337 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.08 
 
 		 258 aa  53.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.57 
 
 		 257 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.05 
 
 		 258 aa  53.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.08 
 
 		 258 aa  53.1  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2107  methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0316  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.78 
 
 		 255 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.224637  normal  0.898974 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  27.27 
 
 		 269 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  46.27 
 
 		 258 aa  53.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 312 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.77 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  24.32 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.71 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 272 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38159  predicted protein  28.26 
 
 		 343 aa  52.4  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  31.21 
 
 		 248 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  32.35 
 
 		 249 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  31.91 
 
 		 251 aa  52.4  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  36.84 
 
 		 257 aa  52.4  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 258 aa  52  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  32.38 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  44.44 
 
 		 281 aa  52  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.68 
 
 		 213 aa  52  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 271 aa  52  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  28.39 
 
 		 235 aa  52  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  27.22 
 
 		 286 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14451  SAM-dependent methyltransferase  27.4 
 
 		 223 aa  51.6  0.000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0481  hypothetical protein  32.54 
 
 		 398 aa  51.6  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.874719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>