More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2031 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  100 
 
 
260 aa  528  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  77.69 
 
 
260 aa  422  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  63.46 
 
 
260 aa  334  7.999999999999999e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.38 
 
 
260 aa  323  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  60 
 
 
260 aa  323  2e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  61.15 
 
 
260 aa  319  3e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  60.77 
 
 
260 aa  317  1e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.77 
 
 
260 aa  317  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  54.26 
 
 
258 aa  292  4e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.85 
 
 
260 aa  288  7e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.31 
 
 
260 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.46 
 
 
259 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  50.38 
 
 
262 aa  259  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.77 
 
 
260 aa  256  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.62 
 
 
260 aa  254  8e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.92 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  48.85 
 
 
260 aa  253  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.85 
 
 
260 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  53.31 
 
 
256 aa  251  8.000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.47 
 
 
258 aa  251  1e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.85 
 
 
261 aa  251  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.4 
 
 
265 aa  250  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
258 aa  248  9e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  47.69 
 
 
259 aa  246  2e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.89 
 
 
265 aa  245  4.9999999999999997e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.74 
 
 
261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  46.88 
 
 
663 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.65 
 
 
260 aa  242  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.97 
 
 
259 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.46 
 
 
259 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  47.24 
 
 
260 aa  237  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  45.77 
 
 
259 aa  237  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 
261 aa  237  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.17 
 
 
260 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.74 
 
 
253 aa  233  3e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.26 
 
 
267 aa  232  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  45.38 
 
 
260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.77 
 
 
260 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.51 
 
 
267 aa  232  6e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.77 
 
 
260 aa  231  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.12 
 
 
259 aa  231  8.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  45.77 
 
 
662 aa  231  1e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.08 
 
 
259 aa  230  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  46.4 
 
 
260 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.51 
 
 
258 aa  229  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.08 
 
 
259 aa  229  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  45.77 
 
 
260 aa  228  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1716  short chain enoyl-CoA hydratase  49.23 
 
 
260 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.923335  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  46.33 
 
 
258 aa  226  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  45.77 
 
 
662 aa  224  9e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.66 
 
 
268 aa  222  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.59 
 
 
259 aa  221  8e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 
260 aa  221  8e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  45.82 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.37 
 
 
269 aa  219  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  44.91 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  45.56 
 
 
262 aa  219  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.21 
 
 
259 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.21 
 
 
259 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  46.04 
 
 
258 aa  218  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  46.39 
 
 
260 aa  218  7.999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1316  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.95 
 
 
260 aa  218  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.200035  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  43.85 
 
 
662 aa  218  1e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  46.01 
 
 
263 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  43.58 
 
 
260 aa  216  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.7 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  45.25 
 
 
257 aa  215  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  44.4 
 
 
661 aa  215  5e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  44.91 
 
 
258 aa  215  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.83 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.68 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.32 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  43.73 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  43.68 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  42.97 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.97 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0017  enoyl-CoA hydratase  43.19 
 
 
261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  42.21 
 
 
257 aa  211  7e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  45.16 
 
 
262 aa  211  7e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  42.21 
 
 
257 aa  211  7.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.69 
 
 
261 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.98 
 
 
258 aa  211  9e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0855  short chain enoyl-CoA hydratase  44.92 
 
 
263 aa  211  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  42.59 
 
 
257 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  46.15 
 
 
259 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3544  enoyl-CoA hydratase  46.04 
 
 
258 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000159011  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.83 
 
 
257 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  43.48 
 
 
261 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  43.56 
 
 
262 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.91 
 
 
259 aa  210  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.25 
 
 
264 aa  209  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  45.28 
 
 
257 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3571  enoyl-CoA hydratase  45.66 
 
 
264 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00545367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  45.16 
 
 
262 aa  209  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.98 
 
 
257 aa  209  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.63 
 
 
262 aa  209  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0544  enoyl-CoA hydratase  45.66 
 
 
258 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.0000000212345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3563  enoyl-CoA hydratase  45.66 
 
 
258 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1899  enoyl-CoA hydratase  45.66 
 
 
258 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000141088  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  41.54 
 
 
258 aa  209  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>