More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2391 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2391  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 322 aa  635    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2158  CBS domain-containing protein  56.11 
 
 		 314 aa  300  3e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.583239  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0979  CBS  54.96 
 
 		 313 aa  286  4e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.980181  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3620  CBS domain-containing protein  46.59 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0024  CBS domain-containing protein  42.4 
 
 		 304 aa  209  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307011  normal  0.720082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0449  CBS domain containing protein  41.12 
 
 		 381 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1813  CBS domain-containing protein  40.98 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0067  CBS domain containing protein  39.81 
 
 		 324 aa  198  9e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0239  HlyC/CorC family transporters  40.33 
 
 		 375 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0593  HlyC/CorC family transporter  40.53 
 
 		 376 aa  195  9e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0049  transporter  40.27 
 
 		 386 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0232  CBS domain containing protein  38.56 
 
 		 373 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1637  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2894  CBS domain containing protein  39.04 
 
 		 357 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594512 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0024  CBS:transporter-associated  39.93 
 
 		 374 aa  188  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0441  hemolysin  39.62 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0017  ctransporter-associated region  39.13 
 
 		 375 aa  186  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0674373 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3179  CBS domain-containing protein  36.72 
 
 		 389 aa  186  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1356  CBS domain-containing protein  40.66 
 
 		 289 aa  181  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0204179  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3207  CBS domain-containing protein  38.7 
 
 		 382 aa  179  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3531  CBS domain containing protein  38.7 
 
 		 382 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.307837  normal  0.3242 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3402  CBS domain containing protein  37.85 
 
 		 384 aa  178  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1058  CBS domain-containing protein  36.56 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279471  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  37.94 
 
 		 371 aa  176  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3773  CBS domain-containing protein  41.73 
 
 		 318 aa  176  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.163853  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  39.15 
 
 		 273 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  41.95 
 
 		 421 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0636  CBS domain-containing protein  36.18 
 
 		 377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  34.66 
 
 		 273 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.47 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0471  CBS  34.43 
 
 		 420 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  35.38 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1246  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.84 
 
 		 340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1014  CBS domain containing protein  43.06 
 
 		 302 aa  161  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0266413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0043  CBS domain-containing protein  37.03 
 
 		 391 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0313302  hitchhiker  0.00000000114145 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0011  CBS/transport-associated domain-containing protein  33.33 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3875  hypothetical protein  35.83 
 
 		 314 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  33.7 
 
 		 285 aa  157  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1330  CBS domain-containing protein  36.88 
 
 		 275 aa  155  7e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.964649  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  40.37 
 
 		 443 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0031  hemolysin  31.23 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.551744  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  35.42 
 
 		 433 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0481  putative hemolysin  36.59 
 
 		 291 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00948682  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0016  transporter-associated region  36.91 
 
 		 383 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0028  CBS domain containing protein  36.31 
 
 		 377 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490023  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  38.36 
 
 		 435 aa  152  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3036  CBS domain-containing protein  42.11 
 
 		 296 aa  152  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0704  CBS  39.24 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.345067 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  34.36 
 
 		 291 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3922  transporter-associated region  33.9 
 
 		 353 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  33.9 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0191  CBS domain-containing protein  37.55 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  34.35 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  34.69 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  34.69 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  34.69 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  33.9 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  34.69 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  33.68 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3782  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 279 aa  149  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.964712  normal  0.253 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 291 aa  149  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  33.9 
 
 		 291 aa  149  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  33.9 
 
 		 291 aa  149  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3282  CBS domain-containing protein  39.66 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.847272 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.9 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3597  CorC/Hlyc family protein  39.66 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0738043  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  33.22 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  34.03 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3385  CBS domain containing protein  39.34 
 
 		 438 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4953  transporter-associated region  33.45 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  33.68 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  32.99 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  38.1 
 
 		 427 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  33.96 
 
 		 426 aa  147  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0993  hemolysin  35.74 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0803506  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  41.1 
 
 		 447 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  33.78 
 
 		 445 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  34.44 
 
 		 420 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  32.89 
 
 		 293 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  40.1 
 
 		 439 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0631  CBS domain-containing protein  32.99 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00687954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  34.48 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4789  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0871051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4843  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  34.6 
 
 		 465 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02233  Mg/Co transporter  30.34 
 
 		 285 aa  144  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  28.24 
 
 		 445 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4665  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.389317  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1349  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.038929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02660  putative transmembrane CorC/HlyC family transporter associatedprotein  32.38 
 
 		 418 aa  142  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  27.86 
 
 		 445 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1184  CBS domain-containing protein  33.22 
 
 		 292 aa  142  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0632091 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  32.12 
 
 		 296 aa  142  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  34.78 
 
 		 464 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  36.94 
 
 		 446 aa  142  8e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01227  hypothetical protein  35.51 
 
 		 299 aa  142  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  35.27 
 
 		 429 aa  142  9e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0751  CBS domain containing protein  35.15 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558025 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0599  magnesium and cobalt efflux protein, putative  35.15 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  34.42 
 
 		 464 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  33.19 
 
 		 421 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>