More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1284 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1284  flagellin domain-containing protein  100 
 
 
273 aa  521  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1283  flagellin domain-containing protein  85.35 
 
 
273 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.87042 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2938  flagellin-like protein  61.54 
 
 
272 aa  305  8.000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2361  flagellin-like  48.93 
 
 
327 aa  273  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1986  flagellin-like protein  50.71 
 
 
285 aa  231  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.462318  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  51.25 
 
 
278 aa  229  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  50.87 
 
 
287 aa  228  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  52.17 
 
 
279 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0784  flagellin, C-terminal:flagellin, N-terminal  50 
 
 
273 aa  223  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605686 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  50.9 
 
 
279 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  48 
 
 
280 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  48.71 
 
 
276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  52.17 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  51.81 
 
 
271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0066  flagellin domain-containing protein  51.45 
 
 
271 aa  217  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0569033 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0618  flagellin domain-containing protein  47.59 
 
 
290 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  50.9 
 
 
271 aa  213  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  47.29 
 
 
276 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  49.46 
 
 
271 aa  211  7.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1009  flagellin domain-containing protein  45.49 
 
 
286 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1010  flagellin domain-containing protein  45.96 
 
 
287 aa  209  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  47.14 
 
 
283 aa  209  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  50.18 
 
 
271 aa  208  8e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  49.29 
 
 
271 aa  206  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  49.29 
 
 
271 aa  206  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  47.84 
 
 
275 aa  206  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0077  flagellin domain-containing protein  49.45 
 
 
274 aa  202  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104255 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  46.53 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  45.36 
 
 
282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0985  flagellin domain protein  45.65 
 
 
277 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2887  flagellin domain protein  48.38 
 
 
278 aa  198  6e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  45.56 
 
 
272 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  45.56 
 
 
272 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0442  flagellin-like  45.85 
 
 
314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3233  flagellin domain protein  47.83 
 
 
275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  48.28 
 
 
272 aa  196  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3087  flagellin-like  45.26 
 
 
276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0071  flagellin domain-containing protein  47.89 
 
 
377 aa  195  6e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0550639 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  46.32 
 
 
274 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3088  flagellin-like  46.15 
 
 
274 aa  194  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  44.53 
 
 
272 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  43.87 
 
 
272 aa  192  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  45.19 
 
 
271 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  45.19 
 
 
271 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1609  flagellin domain-containing protein  43.8 
 
 
272 aa  191  9e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  46.04 
 
 
263 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0082  flagellin domain-containing protein  47.17 
 
 
272 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2237  flagellin-like protein  43.91 
 
 
273 aa  190  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  46.83 
 
 
282 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0630  flagellin domain protein  46.47 
 
 
281 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.892831  hitchhiker  0.00000486769 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  43.49 
 
 
271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  43.49 
 
 
271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4305  flagellin domain protein  44.36 
 
 
262 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0943523  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  42.65 
 
 
273 aa  186  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1315  flagellin-like protein  43.49 
 
 
272 aa  187  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  43.07 
 
 
271 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  43.07 
 
 
271 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  43.64 
 
 
294 aa  186  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  44.69 
 
 
272 aa  186  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  42.01 
 
 
273 aa  186  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2236  flagellin-like protein  44.32 
 
 
272 aa  186  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  42.12 
 
 
275 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1375  flagellin  43.33 
 
 
271 aa  185  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000344656  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  43.26 
 
 
273 aa  185  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2522  flagellin domain-containing protein  47.84 
 
 
278 aa  185  7e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  43.68 
 
 
263 aa  185  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3076  flagellin  42.38 
 
 
273 aa  185  9e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  42.07 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  41.76 
 
 
275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  43.07 
 
 
274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  42.56 
 
 
294 aa  183  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1527  flagellin  46.53 
 
 
283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2306  flagellin-like protein  41.94 
 
 
272 aa  182  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  43.43 
 
 
274 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  42.44 
 
 
273 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0076  flagellin domain protein  44.44 
 
 
265 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  42.01 
 
 
273 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2989  flagellin  43.07 
 
 
272 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000626303 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0077  flagellin domain protein  45.05 
 
 
266 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3466  flagellin  45.36 
 
 
282 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1452  flagellin-like  44.95 
 
 
287 aa  180  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1453  flagellin-like  45.99 
 
 
287 aa  181  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.276413  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2615  flagellin domain protein  45.45 
 
 
279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113225  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2038  flagellin domain protein  42.96 
 
 
295 aa  179  4e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.416457 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3343  flagellin  44.32 
 
 
272 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4306  flagellin domain protein  42.96 
 
 
263 aa  179  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240686  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2611  flagellin domain protein  46.01 
 
 
278 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409959  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0631  flagellin domain protein  44.24 
 
 
281 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000536021 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  43.8 
 
 
270 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2519  flagellin domain protein  45.09 
 
 
279 aa  178  8e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000201488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1339  flagellin-like  46.38 
 
 
279 aa  178  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000247158  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1342  flagellin-like  45.09 
 
 
278 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308098  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2515  flagellin domain protein  45.09 
 
 
278 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0378301  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0169  flagellin  44.2 
 
 
274 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.521055  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0156  flagellin  44.2 
 
 
274 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.447267  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2585  flagellin domain-containing protein  43.22 
 
 
271 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  42.22 
 
 
272 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1608  flagellin domain-containing protein  42.7 
 
 
273 aa  176  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1489  flagellin  44.21 
 
 
283 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0102  flagellin domain protein  44.26 
 
 
276 aa  175  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>