68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32530 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_32530  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  100 
 
 
511 aa  1017    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0636  glycosyl transferase family 39  64.4 
 
 
523 aa  665    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4565  glycosyl transferase family 39  58.96 
 
 
559 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1924  glycosyl transferase family protein  56.76 
 
 
516 aa  566  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.677294  normal  0.703315 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4360  glycosyl transferase family protein  56.15 
 
 
493 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4274  glycosyl transferase family protein  56.15 
 
 
493 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189454  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4653  glycosyl transferase family protein  56.15 
 
 
493 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4809  glycosyl transferase family protein  56.34 
 
 
525 aa  558  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11021  hypothetical protein  57.38 
 
 
522 aa  552  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634705  normal  0.320131 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1486  glycosyl transferase family 39  56.02 
 
 
528 aa  496  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0750108  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3241  glycosyl transferase family 39  53.75 
 
 
534 aa  495  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8627  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  38.15 
 
 
553 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3667  glycosyl transferase family 39  40.29 
 
 
539 aa  338  9.999999999999999e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3175  family 39 glycosyl transferase  39.96 
 
 
547 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0896  glycosyl transferase family 39  43.35 
 
 
507 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5721  glycosyl transferase family 39  39.92 
 
 
508 aa  317  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203068  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8625  Dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase-like protein  37.14 
 
 
520 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0172  glycosyl transferase family protein  39.39 
 
 
528 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.24648  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1205  glycosyl transferase family protein  38.06 
 
 
567 aa  300  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107557  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0972  glycosyl transferase family 39  38.52 
 
 
531 aa  299  9e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.286449  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4440  glycosyl transferase family protein  37.98 
 
 
586 aa  297  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0743  glycosyl transferase family protein  37.38 
 
 
534 aa  295  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3969  glycosyl transferase family protein  37.45 
 
 
569 aa  288  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.858554  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1275  glycosyl transferase family 39  38.06 
 
 
584 aa  288  1e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000500124 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0720  glycosyl transferase family protein  39.43 
 
 
560 aa  286  7e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0778  glycosyl transferase family protein  39.51 
 
 
579 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13260  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  38.7 
 
 
538 aa  283  6.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0582  glycosyl transferase family 39  34.71 
 
 
573 aa  279  9e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3663  glycosyl transferase family protein  38.39 
 
 
539 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870133  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0843  glycosyl transferase family 39  37.83 
 
 
592 aa  265  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.392501  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4076  glycosyl transferase family 39  36.53 
 
 
544 aa  263  6.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639567  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2736  glycosyl transferase family 39  37.3 
 
 
555 aa  259  9e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30410  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  35.73 
 
 
585 aa  256  8e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190808  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3861  glycosyl transferase family protein  32.9 
 
 
541 aa  252  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23350  dolichyl-phosphate-mannose--protein O-mannosyl transferase  35.84 
 
 
541 aa  251  2e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1964  glycosyl transferase family 39  34.44 
 
 
572 aa  251  3e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05340  polyprenol-phosphate-mannose protein O-mannosyl transferase, pmt  38.14 
 
 
537 aa  238  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463876  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0950  glycosyl transferase family 39  37.43 
 
 
563 aa  236  7e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.278855  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0385  putative integral membrane protein  33.4 
 
 
638 aa  219  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.201218  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0359  glycosyl transferase family 39  26.49 
 
 
441 aa  110  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2030  glycosyl transferase family 39  27.49 
 
 
462 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.746599  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0870  glycosyl transferase family protein  20.99 
 
 
493 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.937958  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3845  glycosyl transferase family protein  20.54 
 
 
487 aa  96.3  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2417  glycosyl transferase family 39  21.25 
 
 
658 aa  91.7  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4868  family 39 glycosyl transferase  21.11 
 
 
492 aa  91.3  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2192  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.43 
 
 
447 aa  87  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2206  hypothetical protein  24.6 
 
 
444 aa  81.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2358  glycosyl transferase family 39  20.84 
 
 
469 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.401559  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2306  glycosyl transferase family 39  19.92 
 
 
469 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1864  glycosyl transferase family 39  21.99 
 
 
566 aa  73.6  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000040084  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3095  glycosyl transferase family protein  22.71 
 
 
968 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42978  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1079  glycosyl transferase family 39  21.59 
 
 
466 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.159911 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04761  protein mannosyltransferase 1 (AFU_orthologue; AFUA_3G06450)  26.36 
 
 
918 aa  58.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.5878  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2664  glycosyl transferase family protein  23.83 
 
 
439 aa  57.4  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.255858  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53466  protein mannosyltransferase  23.87 
 
 
745 aa  51.6  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.0000125318  normal  0.117145 
 
 
-
 
NC_006686  CND06150  conserved hypothetical protein  29.69 
 
 
918 aa  51.6  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.802079  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1651  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
384 aa  51.2  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00693966 
 
 
-
 
NC_006686  CND01240  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase, putative  25 
 
 
767 aa  50.1  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139525  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0961  conserved hypothetical protein  26.28 
 
 
372 aa  49.7  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.273814  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0600  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
387 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1534  putative glycosyltransferase  30.97 
 
 
532 aa  47  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0362  glycosyl transferase family 39  30.29 
 
 
475 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2845  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.43 
 
 
549 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.108671  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  29.55 
 
 
569 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01459  mannosyltransferase PMTI (AFU_orthologue; AFUA_8G04500)  23.88 
 
 
773 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.97174 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  33.33 
 
 
575 aa  45.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0861  glycosyl transferase family 39  32.95 
 
 
466 aa  45.1  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00631433  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57202  predicted protein  24.56 
 
 
739 aa  43.9  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0669356  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>