195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_09720 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_09720  Pro-Hyp dipeptidase  100 
 
 		 354 aa  691    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.885607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5929  amidohydrolase  65.06 
 
 		 356 aa  446  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117607  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12929  hypothetical protein  61.89 
 
 		 370 aa  410  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0687  normal  0.519945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1960  amidohydrolase  57.14 
 
 		 368 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2006  amidohydrolase  57.14 
 
 		 368 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0811412  normal  0.722686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2182  amidohydrolase  57.31 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322343  normal  0.931322 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1940  amidohydrolase  57.14 
 
 		 368 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.864175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4010  amidohydrolase  60 
 
 		 361 aa  375  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4181  amidohydrolase  58.87 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11020  amidohydrolase, imidazolonepropionase  51.97 
 
 		 366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.161229  normal  0.0546284 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1562  amidohydrolase 3  52.65 
 
 		 362 aa  354  2e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345787  normal  0.0640888 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3262  amidohydrolase  53.98 
 
 		 361 aa  351  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2486  amidohydrolase  52.82 
 
 		 360 aa  342  4e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445092  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23760  amidohydrolase, imidazolonepropionase  52.23 
 
 		 378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1166  amidohydrolase  54.19 
 
 		 373 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1397  amidohydrolase  54.52 
 
 		 359 aa  325  9e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  decreased coverage  0.00549847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3142  amidohydrolase  56.41 
 
 		 359 aa  323  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000508689  normal  0.129698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1191  amidohydrolase  53.63 
 
 		 359 aa  323  3e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251504  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1612  amidohydrolase  54.95 
 
 		 358 aa  323  3e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0569822  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2082  amidohydrolase  54.73 
 
 		 357 aa  317  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2226  amidohydrolase  50 
 
 		 360 aa  317  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000139869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1302  amidohydrolase  54.21 
 
 		 359 aa  315  6e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2244  amidohydrolase  51.8 
 
 		 367 aa  312  5.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.209508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1281  amidohydrolase  52.97 
 
 		 364 aa  310  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3462  amidohydrolase 3  51.69 
 
 		 365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1469  amidohydrolase  52.08 
 
 		 362 aa  300  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145414 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09960  amidohydrolase, imidazolonepropionase  49.45 
 
 		 388 aa  279  6e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0916327  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0984  amidohydrolase  45.91 
 
 		 358 aa  278  1e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000713577  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  29.74 
 
 		 396 aa  107  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  28.86 
 
 		 423 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  27.47 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  28.32 
 
 		 407 aa  97.1  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  24.93 
 
 		 401 aa  93.6  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  29.16 
 
 		 391 aa  93.6  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  29.56 
 
 		 419 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  28.61 
 
 		 433 aa  90.5  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  30.79 
 
 		 415 aa  90.5  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  27.89 
 
 		 440 aa  90.1  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0462  amidohydrolase  29.91 
 
 		 401 aa  89.7  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000842595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  27.02 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  27.34 
 
 		 432 aa  86.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  25.27 
 
 		 413 aa  86.7  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  25.2 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  28.29 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  28.53 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  33.02 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  31.77 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  33.02 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  33.02 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  32.56 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  27.27 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  28.37 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  32.56 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  27.32 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  29.55 
 
 		 426 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  27.7 
 
 		 430 aa  80.9  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  28.81 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  24.02 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  28.22 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  28.95 
 
 		 428 aa  80.1  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  27.17 
 
 		 433 aa  80.1  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  29.04 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  32.45 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  25.95 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  27.98 
 
 		 408 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  27.98 
 
 		 408 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  27.98 
 
 		 408 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4333  amidohydrolase  26.44 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.48776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1571  amidohydrolase  28.75 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0206923  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3597  amidohydrolase  30.15 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  23.75 
 
 		 407 aa  76.3  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  25.14 
 
 		 421 aa  75.9  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  31.46 
 
 		 414 aa  75.9  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  24.94 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  24.55 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  33.52 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  33.52 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  25.81 
 
 		 426 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  33.52 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  26.77 
 
 		 437 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  27.92 
 
 		 459 aa  73.2  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  26.33 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  26.11 
 
 		 445 aa  72.8  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  29.03 
 
 		 444 aa  72  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2941  amidohydrolase  26.17 
 
 		 390 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.270763  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  25.7 
 
 		 485 aa  72.4  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  26.04 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  27.56 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0868  amidohydrolase  34.1 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  27.32 
 
 		 402 aa  69.3  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  27.42 
 
 		 438 aa  68.9  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  23.84 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  25.92 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  26.72 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3491  Pro-Hyp dipeptidase  28.05 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  25.8 
 
 		 411 aa  67  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  28.95 
 
 		 403 aa  67  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2992  amidohydrolase  34.22 
 
 		 489 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  27.12 
 
 		 417 aa  66.2  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  27 
 
 		 411 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>