72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3199 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3425  hypothetical protein  79.17 
 
 		 474 aa  699    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.945444  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3199  hypothetical protein  100 
 
 		 487 aa  967    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3999  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  66.67 
 
 		 334 aa  336  5e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0587  ATPase involved in chromosome partitioning  42.01 
 
 		 534 aa  206  9e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068267  normal  0.016158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0137  chromosome partitioning ATPase  41.98 
 
 		 586 aa  195  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.458231  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03240  chromosome partitioning ATPase  40.44 
 
 		 617 aa  194  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334592  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  40.22 
 
 		 542 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0132  chromosome partitioning ATPase  41.22 
 
 		 533 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2421  putative signal peptide  41.76 
 
 		 439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  34.26 
 
 		 478 aa  124  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  34.3 
 
 		 388 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  34.3 
 
 		 388 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  34.3 
 
 		 388 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  33.6 
 
 		 639 aa  121  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  33.14 
 
 		 771 aa  121  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  33.33 
 
 		 619 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  33.2 
 
 		 665 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  32.94 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  34.14 
 
 		 330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4553  hypothetical protein  32.8 
 
 		 497 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387687 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  34.24 
 
 		 698 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4508  hypothetical protein  31.2 
 
 		 478 aa  116  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42849  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  33.07 
 
 		 495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4286  hypothetical protein  31.97 
 
 		 494 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4185  hypothetical protein  32.8 
 
 		 485 aa  114  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  33.2 
 
 		 899 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  32.94 
 
 		 343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  32.43 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4411  chromosome partitioning ATPase protein-like  33.33 
 
 		 759 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  32.05 
 
 		 364 aa  107  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  32.8 
 
 		 405 aa  103  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3978  hypothetical protein  30.58 
 
 		 544 aa  89.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  30.08 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3172  hypothetical protein  28.11 
 
 		 453 aa  84.3  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.209106  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  28.63 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2936  hypothetical protein  28.06 
 
 		 416 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  27.71 
 
 		 463 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  26.51 
 
 		 455 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5968  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  22.83 
 
 		 552 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12800  hypothetical protein  25.36 
 
 		 587 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  25.51 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0072  hypothetical protein  24.9 
 
 		 475 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  22.83 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0081  hypothetical protein  24.9 
 
 		 475 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0649479  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0062  hypothetical protein  24.9 
 
 		 475 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4616  chromosome partitioning ATPase  28.57 
 
 		 811 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  28.78 
 
 		 544 aa  62.4  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  26.27 
 
 		 666 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0061  hypothetical protein  30.63 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0051  hypothetical protein  30.63 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00417598 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0070  hypothetical protein  30.63 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216114  normal  0.0962693 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13896  hypothetical protein  25.51 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0175743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0776  hypothetical protein  27.95 
 
 		 380 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0069  hypothetical protein  26.34 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5779  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  26.88 
 
 		 532 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374626  normal  0.249782 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13923  hypothetical protein  27.33 
 
 		 341 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.979459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  25.1 
 
 		 1132 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  25.9 
 
 		 968 aa  50.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  25.11 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0137  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1519 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  27.84 
 
 		 400 aa  47  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  33.04 
 
 		 2397 aa  47  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2474  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.66 
 
 		 294 aa  45.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00522516  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  23.6 
 
 		 926 aa  45.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  27.03 
 
 		 262 aa  44.7  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  25 
 
 		 400 aa  44.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1132  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.02 
 
 		 289 aa  44.3  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  26.14 
 
 		 400 aa  43.9  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0576  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.82 
 
 		 314 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  25.14 
 
 		 402 aa  43.5  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1288  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.31 
 
 		 294 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.435318  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1257  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.31 
 
 		 294 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>