245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1408 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  72.82 
 
 
502 aa  687    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  100 
 
 
518 aa  1030    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  95.17 
 
 
519 aa  920    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  62.03 
 
 
312 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  57 
 
 
1147 aa  335  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  57.59 
 
 
1077 aa  333  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  54.14 
 
 
947 aa  301  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01630  aminopeptidase Y  60.89 
 
 
509 aa  296  5e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.777606  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  62.07 
 
 
515 aa  289  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  60.89 
 
 
512 aa  276  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  49.06 
 
 
1131 aa  273  7e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  54.44 
 
 
518 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0141  Aminopeptidase Y  62.44 
 
 
506 aa  264  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  55.6 
 
 
512 aa  259  8e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0793  Aminopeptidase Y  62.27 
 
 
514 aa  253  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  56.25 
 
 
536 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  55.51 
 
 
513 aa  251  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  55.8 
 
 
535 aa  250  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  45.54 
 
 
437 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  46.35 
 
 
291 aa  248  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  42.6 
 
 
313 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  55.7 
 
 
548 aa  237  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  53.74 
 
 
512 aa  234  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3548  aminopeptidase Y  54.3 
 
 
555 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0650469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6479  hypothetical protein  66.12 
 
 
606 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1182  Aminopeptidase Y  52.54 
 
 
481 aa  229  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  49.79 
 
 
512 aa  223  8e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  49.42 
 
 
500 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  48.61 
 
 
512 aa  217  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  50.65 
 
 
502 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0168155 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  51.57 
 
 
503 aa  211  3e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0553  aminopeptidase Y  49.78 
 
 
501 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0565  aminopeptidase Y  49.78 
 
 
501 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0543  aminopeptidase Y  49.78 
 
 
501 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207964  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  49.78 
 
 
510 aa  207  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0554  aminopeptidase Y  50 
 
 
479 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0566  aminopeptidase Y  50 
 
 
479 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0537512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0544  aminopeptidase Y  50 
 
 
479 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.282981  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4502  peptidase M14 carboxypeptidase A  62.43 
 
 
628 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4082  peptidase M14, carboxypeptidase A  62.43 
 
 
626 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221076  normal  0.0678076 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0716  aminopeptidase Y  48.26 
 
 
488 aa  200  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.841416  normal  0.0176108 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3105  peptidase M14 carboxypeptidase A  59.12 
 
 
632 aa  196  7e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000214938  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  48.13 
 
 
524 aa  195  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89245  Aminopeptidase yscIII Transferrin receptor  46.02 
 
 
533 aa  191  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03918  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00220)  44.09 
 
 
502 aa  190  5.999999999999999e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0943032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  48.25 
 
 
488 aa  189  9e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2070  peptidase M28  38.11 
 
 
309 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  43.75 
 
 
534 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4283  metallophosphoesterase  52.75 
 
 
717 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227058  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4782  peptidase M4 thermolysin  50.57 
 
 
802 aa  161  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0253013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  33.46 
 
 
450 aa  98.6  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  37.34 
 
 
466 aa  88.2  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  39.87 
 
 
466 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  37.2 
 
 
465 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  39.24 
 
 
466 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  39.24 
 
 
466 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  39.24 
 
 
466 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  39.24 
 
 
466 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  39.24 
 
 
466 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  39.24 
 
 
466 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  36.59 
 
 
466 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  36.59 
 
 
466 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  40.34 
 
 
584 aa  80.9  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  33.81 
 
 
625 aa  80.9  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  27.7 
 
 
487 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  30.58 
 
 
571 aa  77.4  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  27.5 
 
 
497 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  33.33 
 
 
1247 aa  73.9  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  33.12 
 
 
346 aa  73.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  28.68 
 
 
775 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  42.06 
 
 
416 aa  73.2  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  45 
 
 
539 aa  72  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  32.79 
 
 
544 aa  71.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35493  predicted protein  32.11 
 
 
450 aa  70.5  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0224729  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  25.43 
 
 
334 aa  69.7  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  29.52 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  24.94 
 
 
483 aa  67.4  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  34.78 
 
 
647 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  29.28 
 
 
944 aa  67  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  39.56 
 
 
457 aa  66.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  33.71 
 
 
347 aa  66.6  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2143  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.68 
 
 
650 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  46.25 
 
 
525 aa  66.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  37.3 
 
 
333 aa  65.1  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  38.83 
 
 
552 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04290  hypothetical protein  34.06 
 
 
647 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00560134  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2866  hypothetical protein  31.97 
 
 
401 aa  63.5  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2729  hypothetical protein  38.64 
 
 
401 aa  63.5  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  31.25 
 
 
578 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  38.89 
 
 
457 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  30.77 
 
 
373 aa  62.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  46.48 
 
 
523 aa  61.6  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  25.65 
 
 
384 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  27.2 
 
 
342 aa  61.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  26.02 
 
 
408 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  25.28 
 
 
408 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  35.03 
 
 
574 aa  59.7  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  29.33 
 
 
559 aa  59.7  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  29.1 
 
 
308 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  47.14 
 
 
677 aa  59.3  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>