241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0313 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  91.3 
 
 		 369 aa  663    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  100 
 
 		 369 aa  717    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5709  folate-binding protein YgfZ  52.48 
 
 		 344 aa  320  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6150  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  52.2 
 
 		 409 aa  313  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4625  folate-binding protein YgfZ  54.81 
 
 		 368 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6837  folate-binding protein YgfZ  52.54 
 
 		 364 aa  300  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0467  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  52.51 
 
 		 385 aa  298  8e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5037  folate-binding protein YgfZ  50.3 
 
 		 369 aa  291  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37750  folate-binding protein YgfZ  44.66 
 
 		 376 aa  275  9e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0952  folate-binding protein YgfZ  46.44 
 
 		 389 aa  267  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0655  folate-binding protein YgfZ  46.87 
 
 		 328 aa  266  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2873  hypothetical protein  44.94 
 
 		 343 aa  264  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4919  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  50.44 
 
 		 356 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4342  folate-binding protein YgfZ  45.78 
 
 		 340 aa  259  8e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.964763  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  46.65 
 
 		 352 aa  258  9e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4536  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  50.15 
 
 		 356 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.935602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4623  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  50.15 
 
 		 356 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0919  LigA  41.92 
 
 		 328 aa  256  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  49.1 
 
 		 396 aa  253  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10826  hypothetical protein  49.13 
 
 		 368 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0841313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0480  folate-binding protein YgfZ  42.41 
 
 		 352 aa  251  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8240  folate-binding protein YgfZ  45.95 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0444  folate-binding protein YgfZ  45.43 
 
 		 389 aa  245  6.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.401201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5109  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  46.67 
 
 		 361 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1638  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  46.38 
 
 		 367 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.246382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  46.87 
 
 		 360 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3086  folate-binding protein YgfZ  49.43 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04980  folate-binding protein YgfZ  47.02 
 
 		 369 aa  239  4e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3572  folate-binding protein YgfZ  45.83 
 
 		 349 aa  238  9e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0682209  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4250  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  43.09 
 
 		 324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3028  folate-binding protein YgfZ  45.72 
 
 		 379 aa  236  7e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3008  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  43.57 
 
 		 361 aa  233  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2719  folate-binding protein YgfZ  42.46 
 
 		 361 aa  225  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239345 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17390  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  45.71 
 
 		 398 aa  223  4.9999999999999996e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03590  folate-binding protein YgfZ  42.52 
 
 		 386 aa  220  3.9999999999999997e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.663588 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25690  folate-binding protein YgfZ  40.7 
 
 		 369 aa  176  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3469  folate-binding protein YgfZ  29.45 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  26.55 
 
 		 342 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0266  folate-binding protein YgfZ  30.47 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0098053 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  30.7 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  30.88 
 
 		 336 aa  96.7  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1501  folate-binding protein YgfZ  29.51 
 
 		 384 aa  94.4  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.119461  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  27.78 
 
 		 354 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.45 
 
 		 349 aa  90.9  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  28.75 
 
 		 339 aa  90.1  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  26.3 
 
 		 356 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  26.3 
 
 		 356 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0332  folate-binding protein YgfZ  28.98 
 
 		 386 aa  88.6  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.97102  normal  0.0439096 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  28.79 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2474  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.46 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2547  folate-binding protein YgfZ  28.16 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.87 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  27.65 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2938  folate-binding protein YgfZ  29.15 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.428228  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  26.38 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1464  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.61 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.24907  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3032  folate-binding protein YgfZ  28.47 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156046  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3735  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.71 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0261257 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.84 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  28.28 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3450  glycine cleavage T-protein barrel  24.61 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  28.74 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.6 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  25.89 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2098  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase)  28.75 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.438328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  26.1 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.44 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1164  folate-binding protein YgfZ  26.61 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000602813  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.84 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1881  folate-binding protein YgfZ  27.18 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.66 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  27.04 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0954  glycine cleavage T-protein-like  27.18 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.436358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.3 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.3 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2127  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.27 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  25.57 
 
 		 371 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0727  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.01 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639994  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0217  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.8 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.77 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3692  folate-binding protein YgfZ  37.27 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0180331  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.36 
 
 		 365 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 815 aa  59.3  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2199  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.79 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.91 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1256  folate-binding protein YgfZ  27.11 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.07 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  24.12 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.2 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1720  glycine cleavage system T protein  24.73 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.845128 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2375  putative glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.56 
 
 		 294 aa  57  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.62 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1238  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.39 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.81 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0240  hypothetical protein  26.11 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.46 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3161  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 		 827 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.84 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1117  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.95 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0959  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  35.56 
 
 		 288 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>