More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0285 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0285  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 
214 aa  417  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376291  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0329  phosphate uptake regulator, PhoU  93.93 
 
 
214 aa  333  7.999999999999999e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0770036  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0959  phosphate uptake regulator, PhoU  48.34 
 
 
219 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0698  phosphate uptake regulator, PhoU  47.62 
 
 
217 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0469  phosphate uptake regulator, PhoU  47.14 
 
 
215 aa  187  7e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0894  phosphate uptake regulator, PhoU  47.39 
 
 
221 aa  186  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  hitchhiker  0.000480176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4320  phosphate uptake regulator, PhoU  45.54 
 
 
220 aa  186  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6147  phosphate uptake regulator, PhoU  45.71 
 
 
214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557412  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8217  phosphate uptake regulator, PhoU  43.81 
 
 
217 aa  180  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.864865  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37610  phosphate uptake regulator, PhoU  43.33 
 
 
220 aa  170  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0655  phosphate uptake regulator, PhoU  43.66 
 
 
224 aa  169  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0834345  hitchhiker  0.000018178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2218  phosphate uptake regulator, PhoU  45.87 
 
 
216 aa  169  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0150232 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4604  phosphate uptake regulator, PhoU  44.29 
 
 
219 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4044  phosphate uptake regulator, PhoU  42.86 
 
 
238 aa  164  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0090  phosphate uptake regulator, PhoU  46.67 
 
 
220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0497  phosphate uptake regulator, PhoU  45.24 
 
 
218 aa  162  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.839068  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13330  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY1  41.04 
 
 
221 aa  158  6e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6815  phosphate uptake regulator, PhoU  41.51 
 
 
220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289636  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1665  phosphate uptake regulator, PhoU  41.43 
 
 
222 aa  153  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3921  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.95 
 
 
220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4977  phosphate uptake regulator, PhoU  43.81 
 
 
225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2908  phosphate uptake regulator, PhoU  46.67 
 
 
231 aa  152  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4897  phosphate uptake regulator, PhoU  41.43 
 
 
222 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4514  phosphate uptake regulator, PhoU  41.43 
 
 
222 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4601  phosphate uptake regulator, PhoU  41.43 
 
 
222 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31900  phosphate uptake regulator, PhoU  43.87 
 
 
223 aa  149  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0769  phosphate uptake regulator, PhoU  38.97 
 
 
232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.178103  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3538  phosphate uptake regulator, PhoU  37.91 
 
 
220 aa  145  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2085  phosphate uptake regulator, PhoU  38.97 
 
 
222 aa  144  7.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.252335  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10836  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY2  38.21 
 
 
213 aa  143  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5088  phosphate uptake regulator, PhoU  39.81 
 
 
222 aa  142  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  38.68 
 
 
219 aa  138  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03680  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.44 
 
 
226 aa  139  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1780  phosphate uptake regulator  38.54 
 
 
224 aa  137  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.210752  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0722  phosphate uptake regulator, PhoU  38.1 
 
 
220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3448  phosphate uptake regulator, PhoU  38.57 
 
 
230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741283  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0848  phosphate uptake regulator, PhoU  37.85 
 
 
220 aa  131  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09310  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.91 
 
 
226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0395  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.98 
 
 
226 aa  121  9e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  30.59 
 
 
218 aa  118  7.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03730  phosphate uptake regulator, PhoU  36.19 
 
 
222 aa  114  7.999999999999999e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0356664  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  32.27 
 
 
221 aa  108  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3204  phosphate uptake regulator, PhoU  39.34 
 
 
234 aa  106  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  32.27 
 
 
216 aa  103  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0987  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.09 
 
 
217 aa  100  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.188055  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0992  phosphate uptake regulator, PhoU  35.98 
 
 
219 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  33.02 
 
 
218 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2837  phosphate uptake regulator, PhoU  28.37 
 
 
214 aa  98.2  8e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  34.43 
 
 
218 aa  97.8  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1011  phosphate uptake regulatory protein  30.59 
 
 
218 aa  97.8  9e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.158059  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1475  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.58 
 
 
213 aa  97.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.632881  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1446  phosphate uptake regulator, PhoU  29.58 
 
 
213 aa  97.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  30.33 
 
 
216 aa  96.7  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1241  hypothetical protein  32.69 
 
 
228 aa  96.3  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  29.95 
 
 
219 aa  95.9  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  34.1 
 
 
243 aa  95.5  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  32.55 
 
 
233 aa  95.5  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  31.46 
 
 
238 aa  95.1  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4447  phosphate uptake regulator, PhoU  32.41 
 
 
234 aa  95.1  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  31.25 
 
 
226 aa  94.7  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  28.77 
 
 
215 aa  94.7  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  30.84 
 
 
221 aa  94.7  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  32.56 
 
 
219 aa  94  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  30.33 
 
 
223 aa  94  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1782  phosphate uptake regulator, PhoU  32.73 
 
 
216 aa  94.4  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  32.39 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  30.33 
 
 
223 aa  94  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  31.6 
 
 
233 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.3 
 
 
221 aa  93.2  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 
220 aa  94  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  29.86 
 
 
229 aa  92.8  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  32.08 
 
 
233 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.38 
 
 
228 aa  92.4  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  29.77 
 
 
221 aa  92  6e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  28.24 
 
 
217 aa  91.7  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4001  phosphate uptake regulator, PhoU  31.02 
 
 
227 aa  91.7  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  33.02 
 
 
240 aa  91.3  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.88 
 
 
240 aa  91.3  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  32.7 
 
 
236 aa  90.9  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 
241 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 
241 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.88 
 
 
240 aa  91.3  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  32.41 
 
 
226 aa  91.3  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1042  phosphate uptake regulator, PhoU  36.54 
 
 
228 aa  91.3  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  29.68 
 
 
217 aa  90.1  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  33.81 
 
 
242 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  31.6 
 
 
237 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1928  phosphate uptake regulator, PhoU  27.7 
 
 
220 aa  89.7  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0636497  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1541  phosphate uptake regulator, PhoU  31.02 
 
 
220 aa  89.7  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000266211  normal  0.024088 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  30.81 
 
 
218 aa  89.7  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2889  phosphate uptake regulator, PhoU  29.72 
 
 
218 aa  89.7  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.114573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2904  phosphate uptake regulator, PhoU  29.72 
 
 
218 aa  89.7  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.0218976 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  30.43 
 
 
215 aa  89.4  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0974  hypothetical protein  30.29 
 
 
228 aa  89  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0351  phosphate uptake regulator, PhoU  27.23 
 
 
233 aa  89  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00165088 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  30.91 
 
 
240 aa  89  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  28.97 
 
 
216 aa  89  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0489  phosphate uptake regulator, PhoU  31.86 
 
 
223 aa  89  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.762813  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1275  phosphate uptake regulator, PhoU  31.02 
 
 
234 aa  88.2  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0823  phosphate uptake regulator, PhoU  31.02 
 
 
234 aa  88.2  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>