271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3054 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 		 265 aa  520  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  84.53 
 
 		 265 aa  447  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1630  flagellar biosynthesis protein FliR  87.74 
 
 		 261 aa  450  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  80.68 
 
 		 265 aa  442  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  80.3 
 
 		 265 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  80.3 
 
 		 265 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  80.3 
 
 		 265 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  79.92 
 
 		 265 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  79.17 
 
 		 265 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  79.17 
 
 		 265 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  78.41 
 
 		 265 aa  431  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  78.49 
 
 		 265 aa  433  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  79.47 
 
 		 267 aa  428  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  76.34 
 
 		 267 aa  419  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  77.57 
 
 		 266 aa  413  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  72.14 
 
 		 262 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03149  flagellar biosynthesis protein FliR  49.23 
 
 		 260 aa  261  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002827  flagellar biosynthesis protein FliR  48.85 
 
 		 260 aa  260  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1703  flagellar biosynthesis protein FliR  47.69 
 
 		 260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  45.77 
 
 		 260 aa  244  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2296  flagellar biosynthesis protein FliR  47.31 
 
 		 260 aa  242  6e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  43.53 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3035  flagellar biosynthesis protein FliR  44.54 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  43.16 
 
 		 261 aa  208  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  44.63 
 
 		 258 aa  205  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  45.53 
 
 		 258 aa  202  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  43.39 
 
 		 261 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  48.91 
 
 		 261 aa  201  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  44.17 
 
 		 258 aa  194  9e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  40.83 
 
 		 258 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  45 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  41.88 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  40.17 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  41.67 
 
 		 257 aa  186  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  42.79 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  40.57 
 
 		 261 aa  183  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  39.64 
 
 		 260 aa  183  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  41.92 
 
 		 258 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  42.04 
 
 		 247 aa  181  9.000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  41.92 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  41.48 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  40 
 
 		 265 aa  171  9e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  41.3 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  39.46 
 
 		 260 aa  168  8e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  35.48 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  38.11 
 
 		 264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  35 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  35.34 
 
 		 259 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2160  flagellar biosynthesis protein FliR  39.08 
 
 		 236 aa  161  8.000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  35.78 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3666  flagellar biosynthetic protein FliR  38.79 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2304  flagellar biosynthesis protein FliR  40.16 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2404  flagellar biosynthesis protein FliR  40.16 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.688451  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  34.71 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  34.93 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  34.93 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  34.93 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001178  flagellar biosynthesis protein FliR  38.57 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.795861  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  31.62 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04965  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  39.05 
 
 		 258 aa  152  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  36.12 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  36.12 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  32.91 
 
 		 259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1966  flagellar biosynthetic protein FliR  40.09 
 
 		 266 aa  152  8e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3432  flagellar biosynthetic protein FliR  36.91 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  31.2 
 
 		 260 aa  149  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  35.34 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  33.62 
 
 		 261 aa  148  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0036  flagellar biosynthetic protein FliR  36.24 
 
 		 260 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  33.77 
 
 		 247 aa  145  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  35.34 
 
 		 256 aa  145  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  37.16 
 
 		 260 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0027  flagellar biosynthetic protein FliR  35.81 
 
 		 260 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  37.16 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  37.16 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  37.16 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  35.06 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  37.16 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  37.16 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  37.16 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  35.59 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  37.16 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  35.32 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  34.13 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  35.32 
 
 		 261 aa  142  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1698  flagellar biosynthetic protein FliR  37.14 
 
 		 261 aa  139  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412821  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0153  flagellar biosynthesis protein FliR  32.75 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2727  flagellar biosynthesis protein FliR  37.14 
 
 		 261 aa  139  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00116197  normal  0.508279 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2183  flagellar biosynthesis protein FliR  37.14 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000259397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1692  flagellar biosynthesis protein FliR  38.6 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000555568  normal  0.0138418 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3219  flagellar biosynthesis protein FliR  34.5 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1234  flagellar biosynthesis protein FliR  38.6 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000114634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2050  flagellar biosynthesis protein FliR  38.6 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000709328  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1564  flagellar biosynthetic protein FliR  38.62 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  36.48 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1071  flagellar biosynthesis protein FliR  38.16 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309979  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3595  flagellar biosynthetic protein FliR  35.8 
 
 		 259 aa  138  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2959  flagellar biosynthesis protein FliR  37.87 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  36.07 
 
 		 264 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  36.07 
 
 		 264 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>