80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1847 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1598  Na+/H+ antiporter NhaC  84.74 
 
 		 439 aa  704    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000151079  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2377  Na+/H+ antiporter NhaC  86.33 
 
 		 439 aa  739    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00605411  normal  0.730196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2449  Na+/H+ antiporter NhaC  86.1 
 
 		 439 aa  739    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00774297  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1454  Na+/H+ antiporter NhaC  77.5 
 
 		 442 aa  656    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2542  Na+/H+ antiporter NhaC  86.1 
 
 		 439 aa  733    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000174807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2095  hypothetical protein  83.6 
 
 		 440 aa  725    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2092  Na+/H+ antiporter NhaC  76.85 
 
 		 445 aa  641    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000144395  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1737  Na+/H+ antiporter NhaC  86.33 
 
 		 439 aa  731    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000126474  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1515  Na+/H+ antiporter NhaC  89.52 
 
 		 439 aa  777    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000563518  normal  0.487296 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1733  Na+/H+ antiporter NhaC  86.33 
 
 		 439 aa  731    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000745905  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2757  hypothetical protein  85.19 
 
 		 439 aa  728    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2547  Na+/H+ antiporter NhaC  86.33 
 
 		 439 aa  731    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000475833  hitchhiker  0.0000000305197 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1847  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 		 439 aa  864    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2575  Na+/H+ antiporter NhaC  85.65 
 
 		 439 aa  758    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000723865  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1776  Na+/H+ antiporter NhaC  86.33 
 
 		 439 aa  731    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000109905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2742  Na+/H+ antiporter NhaC  86.33 
 
 		 439 aa  734    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000444326  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0526  hypothetical protein  67.57 
 
 		 441 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02993  hypothetical protein  66.36 
 
 		 431 aa  571  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002937  hypothetical protein  66.98 
 
 		 425 aa  564  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000304263  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0887  Na+/H+ antiporter NhaC  65.17 
 
 		 446 aa  556  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.801907  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1861  sodium/proton antiporter  65.38 
 
 		 442 aa  554  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0056  Na+/H+ antiporter NhaC  60.68 
 
 		 440 aa  522  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.455554  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1068  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  64.09 
 
 		 440 aa  513  1e-144  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000122266  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1014  permease  57.46 
 
 		 452 aa  497  1e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.747204  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1651  Na+/H+ antiporter NhaC  60.04 
 
 		 448 aa  493  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00196781  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2802  Na+ antiporter NhaC  55.23 
 
 		 439 aa  476  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.936373  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4127  hypothetical protein  55.45 
 
 		 439 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00423015 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3845  Na+/H+ antiporter  55.68 
 
 		 439 aa  478  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4012  hypothetical protein  55 
 
 		 439 aa  471  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1978  Na+/H+ antiporter NhaC  54.86 
 
 		 464 aa  473  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331673 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4325  hypothetical protein  55 
 
 		 439 aa  471  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4213  hypothetical protein  55.23 
 
 		 439 aa  463  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4172  hypothetical protein  55 
 
 		 439 aa  461  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4236  hypothetical protein  55.68 
 
 		 439 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3859  Na+/H+ antiporter  55.45 
 
 		 439 aa  464  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1898  Na+/H+ antiporter NhaC  54.19 
 
 		 453 aa  464  1e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0935892  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29770  putative transporter  60.32 
 
 		 441 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000647538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1024  hypothetical protein  55.23 
 
 		 439 aa  464  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3935  Na+/H+ antiporter NhaC  55.45 
 
 		 439 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.10264  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2547  putative transporter  60.09 
 
 		 441 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1999  Na+/H+ antiporter NhaC  59.77 
 
 		 439 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00435268  normal  0.0272999 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2218  Na+/H+ antiporter NhaC  56.82 
 
 		 439 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3556  Na+/H+ antiporter NhaC  57.05 
 
 		 439 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3769  Na+/H+ antiporter NhaC  58.64 
 
 		 438 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2075  Na+/H+ antiporter NhaC  57.27 
 
 		 439 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.355597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2366  Na+/H+ antiporter NhaC  57.5 
 
 		 439 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0943  Na+ antiporter NhaC  47.87 
 
 		 448 aa  430  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.629306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0962  Na+ antiporter NhaC  48.97 
 
 		 438 aa  418  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000234758  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0943  Na+/H+ antiporter NhaC  48.97 
 
 		 438 aa  418  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000851242  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1343  Na+/H+ antiporter NhaC  48.05 
 
 		 438 aa  412  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014842  hitchhiker  0.000383483 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0529  hypothetical protein  48.97 
 
 		 438 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0114104  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1758  transport protein  46.52 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2204  Na+/H+ antiporter family protein  49.08 
 
 		 433 aa  360  2e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000124721  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1749  transport protein  48.29 
 
 		 435 aa  359  5e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0006  Na+/H+ antiporter family protein  46.58 
 
 		 433 aa  344  2e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000950539  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0006  Na+/H+ antiporter family protein  46.58 
 
 		 433 aa  342  5.999999999999999e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0435713  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2039  transport protein  44.59 
 
 		 455 aa  333  3e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0032  Na+/H+ antiporter family protein  46.8 
 
 		 433 aa  333  3e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.540321  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0477  Na+/H+ antiporter NhaC  44.77 
 
 		 434 aa  315  8e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0558  Na+/H+ antiporter family protein  42.69 
 
 		 446 aa  306  4.0000000000000004e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000048202 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1865  citrate transporter  43.63 
 
 		 455 aa  291  1e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1540  Na+/H+ antiporter family protein  43.08 
 
 		 450 aa  273  3e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  29.19 
 
 		 571 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  29.19 
 
 		 571 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  28.76 
 
 		 521 aa  51.6  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  29.45 
 
 		 517 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3732  gluconate transporter  27.41 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4746  Gnt-II system L-idonate transporter  27.41 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.618535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4521  Gnt-II system L-idonate transporter  27.41 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00247449  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04131  L-idonate and D-gluconate transporter  27.32 
 
 		 439 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04095  hypothetical protein  27.32 
 
 		 439 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  28.78 
 
 		 569 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4867  gluconate:H+ symporter family protein  26.64 
 
 		 463 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.147551 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4767  transporter, gluconate:H+ symporter (GntP) family  26.64 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0776084  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4737  transporter gluconate:H+ symporter (GntP) family  26.64 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.137331 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4886  gluconate:H+ symporter family transporter  26.64 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4830  gluconate:H+ symporter (hypothetical protein) family transporter  26.64 
 
 		 463 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.742324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22470  Gluconate transporter  26.94 
 
 		 450 aa  44.3  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  24.38 
 
 		 507 aa  44.3  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  21.33 
 
 		 452 aa  43.1  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>