225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3792 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00165  PII uridylyl-transferase  78.17 
 
 		 890 aa  1434    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3436  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  77.94 
 
 		 890 aa  1432    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03239  PII uridylyl-transferase  55.32 
 
 		 874 aa  991    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  42.94 
 
 		 900 aa  685    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  42.94 
 
 		 877 aa  674    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1549  protein-P-II uridylyltransferase  44.99 
 
 		 878 aa  775    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0175  PII uridylyl-transferase  78.06 
 
 		 890 aa  1432    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0452861  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1626  PII uridylyl-transferase  50.29 
 
 		 861 aa  801    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  41.87 
 
 		 898 aa  680    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1341  PII uridylyl-transferase  41.98 
 
 		 898 aa  670    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  42.96 
 
 		 893 aa  673    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3493  PII uridylyl-transferase  78.17 
 
 		 890 aa  1434    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.761936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  42.47 
 
 		 892 aa  655    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  42.31 
 
 		 900 aa  691    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2887  PII uridylyl-transferase  50.12 
 
 		 851 aa  813    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.664043  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3362  PII uridylyl-transferase  85.18 
 
 		 903 aa  1561    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2904  PII uridylyl-transferase  49.53 
 
 		 861 aa  791    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0760318  normal  0.279173 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  42.76 
 
 		 899 aa  692    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3437  PII uridylyl-transferase  85.78 
 
 		 893 aa  1565    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  43.25 
 
 		 900 aa  688    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0251  PII uridylyl-transferase  77.83 
 
 		 890 aa  1431    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0177  PII uridylyl-transferase  78.4 
 
 		 890 aa  1437    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0235  PII uridylyl-transferase  77.6 
 
 		 890 aa  1427    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1552  PII uridylyl-transferase  49.01 
 
 		 861 aa  825    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.350187  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1064  PII uridylyl-transferase  85.78 
 
 		 912 aa  1565    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0561  PII uridylyl-transferase  43.82 
 
 		 891 aa  667    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0159  PII uridylyl-transferase  78.17 
 
 		 890 aa  1434    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0691765  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1443  PII uridylyl-transferase  49.65 
 
 		 861 aa  794    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.322557  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1247  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  43.67 
 
 		 870 aa  716    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3283  PII uridylyl-transferase  48.69 
 
 		 859 aa  816    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.0000397326 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0829  PII uridylyl-transferase  45.87 
 
 		 861 aa  727    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.328211  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2643  PII uridylyl-transferase  50.18 
 
 		 861 aa  803    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.359945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2710  PII uridylyl-transferase  50.18 
 
 		 861 aa  803    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.468819  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  45.29 
 
 		 894 aa  715    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1268  PII uridylyl-transferase  48.2 
 
 		 857 aa  815    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0169  PII uridylyl-transferase  78.29 
 
 		 890 aa  1436    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  42.53 
 
 		 900 aa  697    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  42.94 
 
 		 900 aa  686    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1011  PII uridylyl-transferase  85.78 
 
 		 893 aa  1565    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0146749  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0235  PII uridylyl-transferase  77.83 
 
 		 890 aa  1432    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.862739  normal  0.902468 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2817  PII uridylyl-transferase  50.18 
 
 		 861 aa  804    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0674494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0705  PII uridylyl-transferase  78.4 
 
 		 891 aa  1442    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.707926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1346  PII uridylyl-transferase  49.82 
 
 		 860 aa  796    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00951231  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3163  PII uridylyl-transferase  49.76 
 
 		 859 aa  812    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.258503  normal  0.795531 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0170  PII uridylyl-transferase  78.17 
 
 		 890 aa  1433    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.751876  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1137  PII uridylyl-transferase  50.59 
 
 		 856 aa  835    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0729778  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3004  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  46.78 
 
 		 869 aa  808    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.38403 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  42.37 
 
 		 900 aa  685    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2550  PII uridylyl-transferase  42.87 
 
 		 881 aa  688    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  42.53 
 
 		 900 aa  694    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  44.98 
 
 		 899 aa  724    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2429  PII uridylyl-transferase  54.98 
 
 		 883 aa  972    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  43.17 
 
 		 899 aa  693    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0253  PII uridylyl-transferase  77.71 
 
 		 890 aa  1431    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1468  metal dependent phosphohydrolase  44.16 
 
 		 889 aa  682    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0238  PII uridylyl-transferase  77.83 
 
 		 890 aa  1432    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002744  [Protein-PII] uridylyltransferase  56.25 
 
 		 874 aa  997    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3792  PII uridylyl-transferase  100 
 
 		 892 aa  1833    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.991129  hitchhiker  0.000938474 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1448  PII uridylyl-transferase  49.53 
 
 		 861 aa  791    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1847  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00164  hypothetical protein  78.17 
 
 		 890 aa  1434    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.920413  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2983  PII uridylyl-transferase  83.91 
 
 		 890 aa  1514    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3167  PII uridylyl-transferase  83.73 
 
 		 893 aa  1526    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2637  PII uridylyl-transferase  48.95 
 
 		 857 aa  811    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0239463  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0939  PII uridylyl-transferase  86.45 
 
 		 904 aa  1568    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119925  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1853  PII uridylyl-transferase  55.17 
 
 		 881 aa  986    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172176  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1479  PII uridylyl-transferase  49.53 
 
 		 861 aa  791    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.450236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0910  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  40.09 
 
 		 882 aa  624  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0445386  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  38.2 
 
 		 900 aa  611  1e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1685  hypothetical protein  37.74 
 
 		 861 aa  607  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1684  hypothetical protein  37.74 
 
 		 861 aa  606  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3746  (protein-PII) uridylyltransferase  37.88 
 
 		 867 aa  600  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1270  metal dependent phosphohydrolase  38.42 
 
 		 897 aa  601  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.439382 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2877  protein-P-II uridylyltransferase  39.71 
 
 		 874 aa  598  1e-169  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.521501  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3942  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  38.5 
 
 		 868 aa  590  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0556  metal dependent phosphohydrolase  37.95 
 
 		 899 aa  587  1e-166  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258602 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1287  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  36.36 
 
 		 888 aa  580  1e-164  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.934135  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0441  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  36.31 
 
 		 913 aa  569  1e-160  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0395  protein-P-II uridylyltransferase  37.27 
 
 		 915 aa  559  1e-158  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919932 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2147  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  39.47 
 
 		 863 aa  555  1e-156  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.112628  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  36.8 
 
 		 852 aa  541  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1532  PII uridylyl-transferase  36.82 
 
 		 856 aa  538  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0731964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1453  PII uridylyl-transferase  37.91 
 
 		 865 aa  531  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1340  PII uridylyl-transferase  37.02 
 
 		 862 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1402  PII uridylyl-transferase  37.43 
 
 		 861 aa  523  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5331  PII uridylyl-transferase  38.02 
 
 		 858 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345474  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1276  PII uridylyl-transferase  37.74 
 
 		 862 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.111517  normal  0.077343 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01140  PII uridylyl-transferase  39.91 
 
 		 838 aa  520  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.120202  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0783  PII uridylyl-transferase  37.37 
 
 		 850 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.483078 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1255  PII uridylyl-transferase  37.7 
 
 		 858 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0751944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2180  PII uridylyl-transferase  37.28 
 
 		 858 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234625  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6056  PII uridylyl-transferase  37.68 
 
 		 858 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399672  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_2021  PII uridylyl-transferase  37.68 
 
 		 858 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0924  protein-P-II uridylyltransferase  38.95 
 
 		 862 aa  514  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1923  PII uridylyl-transferase  37.7 
 
 		 858 aa  515  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.289399 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2457  PII uridylyl-transferase  37.45 
 
 		 859 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100241  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2041  PII uridylyl-transferase  37.56 
 
 		 858 aa  515  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442689  normal  1 
 
 
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NC_008390  Bamb_2054  PII uridylyl-transferase  37.7 
 
 		 858 aa  515  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_1043  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  38.95 
 
 		 862 aa  514  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030161 
 
 
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NC_007973  Rmet_1433  PII uridylyl-transferase  36.61 
 
 		 857 aa  512  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939305 
 
 
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NC_010002  Daci_4853  PII uridylyl-transferase  37.01 
 
 		 895 aa  509  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.826646  normal  1 
 
 
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