More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1244 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1244  DNA-binding transcriptional activator KdpE  100 
 
 
229 aa  461  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00224308  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2931  DNA-binding transcriptional activator KdpE  81.22 
 
 
229 aa  384  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1155  DNA-binding transcriptional activator KdpE  87.56 
 
 
209 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1126  DNA-binding transcriptional activator KdpE  80.8 
 
 
226 aa  377  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.296902  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1214  DNA-binding transcriptional activator KdpE  81.61 
 
 
226 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00514307  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1102  DNA-binding transcriptional activator KdpE  87.56 
 
 
209 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.03864e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3578  DNA-binding transcriptional activator KdpE  87.56 
 
 
209 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.693422  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00642  hypothetical protein  78.48 
 
 
225 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0720  DNA-binding transcriptional activator KdpE  78.12 
 
 
225 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0669037  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00651  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with KdpD  78.48 
 
 
225 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  78.48 
 
 
225 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0716  DNA-binding transcriptional activator KdpE  78.48 
 
 
225 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0593355  normal  0.505732 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0741  DNA-binding transcriptional activator KdpE  78.03 
 
 
225 aa  363  1e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000675118  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2962  DNA-binding transcriptional activator KdpE  78.03 
 
 
225 aa  363  1e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0787  DNA-binding transcriptional activator KdpE  78.03 
 
 
225 aa  363  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0810  DNA-binding transcriptional activator KdpE  77.68 
 
 
225 aa  361  5e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0860  DNA-binding transcriptional activator KdpE  77.68 
 
 
225 aa  361  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0824  DNA-binding transcriptional activator KdpE  77.68 
 
 
225 aa  361  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0770111 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0750  DNA-binding transcriptional activator KdpE  77.68 
 
 
225 aa  361  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.358042  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0763  DNA-binding transcriptional activator KdpE  77.23 
 
 
225 aa  358  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0555  DNA-binding transcriptional activator KdpE  76.68 
 
 
225 aa  357  7e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1206  two component transcriptional regulator  75.68 
 
 
225 aa  350  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352252 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1025  DNA-binding response regulator KdpE  65.94 
 
 
234 aa  314  7e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1397  DNA-binding response regulator KdpE  65.5 
 
 
232 aa  311  6e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.089264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1246  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  65.5 
 
 
232 aa  311  6e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0779  DNA-binding response regulator KdpE  65.5 
 
 
234 aa  311  7e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97246  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0371  DNA-binding response regulator KdpE  65.5 
 
 
234 aa  311  7e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1872  DNA-binding response regulator KdpE  65.5 
 
 
234 aa  311  7e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1088  DNA-binding response regulator KdpE  65.5 
 
 
234 aa  311  7e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1254  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  65.5 
 
 
234 aa  311  7e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00667548  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0042  two component transcriptional regulator  65.78 
 
 
231 aa  309  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189828  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  66.67 
 
 
231 aa  308  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  4.20296e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1672  two component transcriptional regulator  64.19 
 
 
232 aa  303  2e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2307  two component transcriptional regulator  64.19 
 
 
232 aa  303  2e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2284  two component transcriptional regulator  64.19 
 
 
232 aa  303  2e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  63.76 
 
 
232 aa  303  2e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0994  two component transcriptional regulator  63.76 
 
 
232 aa  303  2e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  63.76 
 
 
232 aa  303  2e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3600  two component transcriptional regulator  63.79 
 
 
235 aa  301  6e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3248  two component transcriptional regulator  62.88 
 
 
232 aa  300  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3087  response regulator transcription regulator protein  64.04 
 
 
234 aa  299  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1312  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.88 
 
 
232 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.1865 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2502  two-component response regulator of kdp operon  68.56 
 
 
234 aa  298  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5611  two component transcriptional regulator  62.88 
 
 
232 aa  298  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0731674  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  61.57 
 
 
232 aa  297  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3557  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  65.22 
 
 
230 aa  295  5e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3023  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.6 
 
 
234 aa  293  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3370  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.6 
 
 
234 aa  294  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0359  two component transcriptional regulator  62.39 
 
 
236 aa  293  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274157  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1079  two component transcriptional regulator  61.3 
 
 
230 aa  291  6e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4990  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.47 
 
 
230 aa  291  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3504  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.71 
 
 
248 aa  284  9e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1666  two component transcriptional regulator  58.95 
 
 
230 aa  275  4e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10580  Response regulator  58.26 
 
 
229 aa  271  5e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5920  two component transcriptional regulator  56.78 
 
 
247 aa  267  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2274  two component transcriptional regulator  57.83 
 
 
231 aa  265  6e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2213  DNA binding response regulator KdpE  56.76 
 
 
231 aa  260  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3117  two component transcriptional regulator, winged helix family  80.39 
 
 
204 aa  259  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000837248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  52.47 
 
 
230 aa  244  6e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.89 
 
 
232 aa  243  2e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4253  two component transcriptional regulator  53.54 
 
 
228 aa  243  2e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  51.75 
 
 
230 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0942  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.64 
 
 
231 aa  239  3e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0532517  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 
241 aa  239  3e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  53.64 
 
 
233 aa  239  3e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2540  two component transcriptional regulator  52.49 
 
 
228 aa  239  3e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  51.54 
 
 
230 aa  238  6e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.18 
 
 
231 aa  238  8e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  50 
 
 
231 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0891  two component transcriptional regulator  52.86 
 
 
231 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  49.78 
 
 
230 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 
231 aa  235  5e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  50.22 
 
 
230 aa  234  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2379  two component transcriptional regulator  56.64 
 
 
250 aa  234  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.524484  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 
231 aa  233  2e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0450  two component transcriptional regulator  53.95 
 
 
232 aa  233  2e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153023  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  50.44 
 
 
231 aa  233  2e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1791  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 
240 aa  233  2e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.42123e-13 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3050  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 
224 aa  231  9e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.519152  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.88 
 
 
235 aa  231  9e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1222  two component transcriptional regulator  52.27 
 
 
235 aa  229  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1172  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 
235 aa  230  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1100  two component transcriptional regulator  50.91 
 
 
230 aa  228  8e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5960  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 
226 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.891848  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4088  response regulator receiver  47.98 
 
 
231 aa  223  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3763  two component transcriptional regulator  50.85 
 
 
243 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225565 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11045  transcriptional regulatory protein kdpE  47.98 
 
 
226 aa  222  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5029  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 
225 aa  221  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1269  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 
228 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  46.05 
 
 
230 aa  218  4e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  48.46 
 
 
232 aa  218  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2927  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 
228 aa  218  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2990  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 
230 aa  218  5e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.839569  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2262  two component transcriptional regulator  48.26 
 
 
231 aa  216  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1159  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 
230 aa  215  6e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1708  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.18 
 
 
228 aa  215  6e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.476364 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5362  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 
230 aa  214  8e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0748621 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4649  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 
230 aa  213  1e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.424735  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0299  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.64 
 
 
231 aa  212  3e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0828  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.37 
 
 
232 aa  212  4e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.159677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>